More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2421 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2421  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  592  1e-168  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0349242  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0039  hypothetical protein  52.82 
 
 		 291 aa  311  5.999999999999999e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0420  hypothetical protein  48.97 
 
 		 293 aa  279  5e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.387203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0409  hypothetical protein  48.97 
 
 		 293 aa  279  5e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0214224  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  42.03 
 
 		 299 aa  225  8e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  41.73 
 
 		 294 aa  208  8e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  37.72 
 
 		 293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  37.72 
 
 		 293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  37.72 
 
 		 293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  37.72 
 
 		 293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  38.06 
 
 		 293 aa  199  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  37.72 
 
 		 293 aa  199  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  37.72 
 
 		 293 aa  198  7e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5270  MscS mechanosensitive ion channel  38.6 
 
 		 285 aa  198  9e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  38.6 
 
 		 285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5331  mechanosensitive ion channel family protein  38.06 
 
 		 293 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0115523  hitchhiker  0.00000270411 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5604  mechanosensitive ion channel family protein  38.41 
 
 		 293 aa  188  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  33.08 
 
 		 288 aa  168  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  39.13 
 
 		 299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  35.71 
 
 		 289 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2935  MscS Mechanosensitive ion channel  33.85 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.863949  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  31.41 
 
 		 283 aa  147  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3355  MscS Mechanosensitive ion channel  34.23 
 
 		 278 aa  145  6e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0571  MscS Mechanosensitive ion channel  31.82 
 
 		 260 aa  142  6e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000639441  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0410  MscS Mechanosensitive ion channel  35.74 
 
 		 372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1247  MscS Mechanosensitive ion channel  32.13 
 
 		 370 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1188  MscS Mechanosensitive ion channel  30.42 
 
 		 549 aa  136  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0082  MscS mechanosensitive ion channel  30.54 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0423997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0128  MscS mechanosensitive ion channel  32.34 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11820  small-conductance mechanosensitive channel  32.13 
 
 		 336 aa  127  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4901  MscS Mechanosensitive ion channel  29.35 
 
 		 301 aa  125  9e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2511  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.399769  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1631  MscS mechanosensitive ion channel  33.48 
 
 		 414 aa  123  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1801  MscS Mechanosensitive ion channel  32.51 
 
 		 335 aa  122  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1580  MscS mechanosensitive ion channel  31.75 
 
 		 319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1136  MscS Mechanosensitive ion channel  28.83 
 
 		 325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  29.6 
 
 		 356 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1609  MscS mechanosensitive ion channel  31.75 
 
 		 319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1634  MscS mechanosensitive ion channel  31.75 
 
 		 319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1912  MscS mechanosensitive ion channel  28.51 
 
 		 325 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.476783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3455  MscS Mechanosensitive ion channel  27.94 
 
 		 320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739809  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1334  MscS Mechanosensitive ion channel  31.11 
 
 		 335 aa  119  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0104  hypothetical protein  30.59 
 
 		 280 aa  118  9e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0511133  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6682  MscS mechanosensitive ion channel  31.44 
 
 		 293 aa  119  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  27.47 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0546  MscS mechanosensitive ion channel  32.86 
 
 		 291 aa  116  5e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2549  mechanosensitive ion channel MscS  28.51 
 
 		 342 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0602  MscS mechanosensitive ion channel  28.92 
 
 		 568 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0823902  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  27.17 
 
 		 550 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11550  small-conductance mechanosensitive channel  28.33 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4450  MscS mechanosensitive ion channel  26.92 
 
 		 334 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  30.67 
 
 		 336 aa  112  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0853  MscS mechanosensitive ion channel  26.43 
 
 		 327 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0593395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0610  hypothetical protein  30.4 
 
 		 599 aa  111  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0847  MscS mechanosensitive ion channel  26.43 
 
 		 327 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0864  MscS mechanosensitive ion channel  26.43 
 
 		 327 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0266  small-conductance mechanosensitive channel-like  32.32 
 
 		 505 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068339 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1833  MscS mechanosensitive ion channel  28.52 
 
 		 394 aa  110  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0190  small-conductance mechanosensitive channel  29.03 
 
 		 263 aa  109  5e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4634  MscS Mechanosensitive ion channel  30.57 
 
 		 334 aa  109  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0333987  normal  0.045581 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0950  MscS mechanosensitive ion channel  26.94 
 
 		 787 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13121  transmembrane protein  32.43 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.609452 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  29.84 
 
 		 344 aa  106  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2980  mechanosensitive ion channel family protein  29.15 
 
 		 286 aa  106  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1378  MscS mechanosensitive ion channel  27.56 
 
 		 342 aa  105  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586081  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2666  MscS Mechanosensitive ion channel  27.6 
 
 		 911 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232424  normal  0.397707 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  29.35 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0846  mechanosensitive ion channel protein MscS  29.29 
 
 		 537 aa  104  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2189  MscS mechanosensitive ion channel  28.28 
 
 		 821 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3624  MscS mechanosensitive ion channel  26.79 
 
 		 822 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749548 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4463  MscS mechanosensitive ion channel  26.79 
 
 		 822 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3903  MscS mechanosensitive ion channel  26.79 
 
 		 822 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4456  MscS mechanosensitive ion channel  31.14 
 
 		 550 aa  103  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2432  MscS Mechanosensitive ion channel  27.73 
 
 		 307 aa  102  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00547938  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2634  MscS Mechanosensitive ion channel  26.79 
 
 		 293 aa  102  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.218755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7342  MscS Mechanosensitive ion channel  26.7 
 
 		 342 aa  102  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546474 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2861  small conductance mechanosensitive channel ion channel  27.31 
 
 		 767 aa  102  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.753072  normal  0.757549 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1754  MscS mechanosensitive ion channel  27.69 
 
 		 879 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4680  MscS mechanosensitive ion channel  28.28 
 
 		 837 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3001  MscS mechanosensitive ion channel  26.85 
 
 		 693 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2658  mechanosensitive ion channel family protein  29.43 
 
 		 286 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0115442  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3797  MscS mechanosensitive ion channel  28.06 
 
 		 871 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198076  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1608  MscS Mechanosensitive ion channel  26.92 
 
 		 876 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5854  hypothetical protein  29.07 
 
 		 735 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3278  MscS mechanosensitive ion channel  28.06 
 
 		 864 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7354  mechanosensitive ion channel  27.15 
 
 		 337 aa  99.4  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67630  hypothetical protein  28.33 
 
 		 735 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  25.3 
 
 		 321 aa  98.6  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0186  MscS Mechanosensitive ion channel  29.1 
 
 		 304 aa  98.2  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3795  MscS mechanosensitive ion channel  26.99 
 
 		 313 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.840492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  25.81 
 
 		 283 aa  97.8  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3068  hypothetical protein  29.73 
 
 		 756 aa  97.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.36924 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5420  MscS Mechanosensitive ion channel  26.84 
 
 		 889 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0964  MscS mechanosensitive ion channel  26.4 
 
 		 312 aa  97.1  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1688  MscS mechanosensitive ion channel  25.88 
 
 		 719 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.265093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  27.55 
 
 		 528 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2744  MscS mechanosensitive ion channel  26.91 
 
 		 315 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.535922  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  27.55 
 
 		 528 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1691  small-conductance mechanosensitive channel  32.5 
 
 		 290 aa  96.7  5e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5312  MscS mechanosensitive ion channel  24.55 
 
 		 454 aa  95.9  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.518656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>