More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0964 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0964  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 312 aa  630  1e-180  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0039  hypothetical protein  28.78 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  29.8 
 
 		 336 aa  99.8  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11820  small-conductance mechanosensitive channel  29.49 
 
 		 336 aa  99.8  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2935  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 282 aa  98.6  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.863949  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0409  hypothetical protein  30.43 
 
 		 293 aa  97.4  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0214224  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0420  hypothetical protein  30.43 
 
 		 293 aa  97.4  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.387203  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  30.67 
 
 		 294 aa  96.7  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1136  MscS Mechanosensitive ion channel  27.91 
 
 		 325 aa  95.9  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0610  hypothetical protein  30.85 
 
 		 599 aa  95.1  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0571  MscS Mechanosensitive ion channel  28.86 
 
 		 260 aa  95.1  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000639441  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5312  MscS mechanosensitive ion channel  31.07 
 
 		 454 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.518656 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0082  MscS mechanosensitive ion channel  31.96 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0423997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1801  MscS Mechanosensitive ion channel  36.81 
 
 		 335 aa  94  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1895  small-conductance mechanosensitive ion channel  28.97 
 
 		 787 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1334  MscS Mechanosensitive ion channel  30.45 
 
 		 335 aa  94  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  38.58 
 
 		 288 aa  93.6  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0544  MscS mechanosensitive ion channel  28.62 
 
 		 787 aa  92.4  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  26.69 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1247  MscS Mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 370 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  29.6 
 
 		 299 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2612  MscS mechanosensitive ion channel  27.45 
 
 		 273 aa  91.3  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1188  MscS Mechanosensitive ion channel  33.1 
 
 		 549 aa  91.3  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1154  MscS mechanosensitive ion channel  31.03 
 
 		 442 aa  90.5  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  35.85 
 
 		 321 aa  89.4  7e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3994  hypothetical protein  28.08 
 
 		 792 aa  89.4  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.535307  normal  0.386715 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11550  small-conductance mechanosensitive channel  29.49 
 
 		 316 aa  89  8e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0104  hypothetical protein  27.42 
 
 		 280 aa  88.6  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0511133  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3355  MscS Mechanosensitive ion channel  28.88 
 
 		 278 aa  88.6  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3908  putative small-conductance mechanosensitive channel transmembrane protein  33.82 
 
 		 771 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385979 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0190  small-conductance mechanosensitive channel  26.89 
 
 		 263 aa  87.8  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2549  mechanosensitive ion channel MscS  33.55 
 
 		 342 aa  87.4  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3068  hypothetical protein  34.15 
 
 		 756 aa  87.4  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.36924 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3563  MscS mechanosensitive ion channel  32.84 
 
 		 762 aa  87.4  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  28.12 
 
 		 356 aa  87.4  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  28.44 
 
 		 293 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  28.44 
 
 		 293 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  28.44 
 
 		 293 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0602  MscS mechanosensitive ion channel  31.19 
 
 		 568 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0823902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  28.44 
 
 		 293 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  28.44 
 
 		 293 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  28.44 
 
 		 293 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0332  MscS Mechanosensitive ion channel  31.82 
 
 		 773 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.323369  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0546  MscS mechanosensitive ion channel  28.44 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  26.64 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  27.59 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  27.57 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  26.83 
 
 		 350 aa  83.2  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  34.09 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4463  MscS mechanosensitive ion channel  30.58 
 
 		 822 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141403  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3624  MscS mechanosensitive ion channel  30.58 
 
 		 822 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749548 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3903  MscS mechanosensitive ion channel  30.58 
 
 		 822 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0901  MscS Mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 766 aa  82.8  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0266  small-conductance mechanosensitive channel-like  30.36 
 
 		 505 aa  82.4  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068339 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0181  MscS mechanosensitive ion channel  33.88 
 
 		 707 aa  82.4  0.000000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2666  MscS Mechanosensitive ion channel  28.05 
 
 		 911 aa  82.4  0.000000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232424  normal  0.397707 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  27.91 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1181  hypothetical protein  32.58 
 
 		 884 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.40697 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2432  MscS Mechanosensitive ion channel  27.11 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00547938  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1457  MscS mechanosensitive ion channel  31.34 
 
 		 768 aa  82  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2511  MscS mechanosensitive ion channel  30.18 
 
 		 282 aa  82  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.399769  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0432  small-conductance mechanosensitive channel  25.66 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000493882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1378  MscS mechanosensitive ion channel  30.04 
 
 		 342 aa  82  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586081  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1277  MscS mechanosensitive ion channel  37.68 
 
 		 718 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175782  normal  0.44534 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5311  MscS mechanosensitive ion channel  32.12 
 
 		 858 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021896 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1688  MscS mechanosensitive ion channel  35.38 
 
 		 719 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.265093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5604  mechanosensitive ion channel family protein  26.64 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5420  MscS Mechanosensitive ion channel  32.58 
 
 		 889 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5331  mechanosensitive ion channel family protein  26.64 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0115523  hitchhiker  0.00000270411 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5270  MscS mechanosensitive ion channel  26.64 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3797  MscS mechanosensitive ion channel  30.65 
 
 		 871 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198076  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2062  MscS mechanosensitive ion channel  38.52 
 
 		 747 aa  80.5  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2784  MscS mechanosensitive ion channel  33.06 
 
 		 801 aa  80.9  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.582826  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  26.27 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3278  MscS mechanosensitive ion channel  32.58 
 
 		 864 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4680  MscS mechanosensitive ion channel  31.54 
 
 		 837 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4634  MscS Mechanosensitive ion channel  27.37 
 
 		 334 aa  79.3  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0333987  normal  0.045581 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  25.46 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2189  MscS mechanosensitive ion channel  30.36 
 
 		 821 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3871  MscS mechanosensitive ion channel  33.56 
 
 		 674 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1754  MscS mechanosensitive ion channel  33.74 
 
 		 879 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4477  MscS mechanosensitive ion channel  39.82 
 
 		 772 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1514  MscS mechanosensitive ion channel  29.2 
 
 		 836 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.767095  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3072  MscS mechanosensitive ion channel  29.2 
 
 		 773 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.718015  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7354  mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1609  MscS mechanosensitive ion channel  25.61 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2980  mechanosensitive ion channel family protein  32.16 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67630  hypothetical protein  42.11 
 
 		 735 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1410  hypothetical protein  29.41 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1634  MscS mechanosensitive ion channel  25.61 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1580  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5854  hypothetical protein  42.11 
 
 		 735 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2834  MscS Mechanosensitive ion channel  31.75 
 
 		 741 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.269757  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0863  hypothetical protein  31.88 
 
 		 741 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00697122  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0676  mechanosensitive ion channel family protein  39.82 
 
 		 767 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7342  MscS Mechanosensitive ion channel  26.05 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546474 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  28.66 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0950  MscS mechanosensitive ion channel  32.52 
 
 		 787 aa  77.4  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2835  hypothetical protein  31.75 
 
 		 741 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.49236  normal  0.59414 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0956  hypothetical protein  31.75 
 
 		 741 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0640759  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>