More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_09010 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_09010  small-conductance mechanosensitive channel  100 
 
 		 298 aa  587  1e-167  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0427247  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1334  MscS Mechanosensitive ion channel  45.42 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  43.17 
 
 		 356 aa  196  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2549  mechanosensitive ion channel MscS  43.07 
 
 		 342 aa  194  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1136  MscS Mechanosensitive ion channel  38.24 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7354  mechanosensitive ion channel  44.12 
 
 		 337 aa  193  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11820  small-conductance mechanosensitive channel  41.92 
 
 		 336 aa  190  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3536  MscS mechanosensitive ion channel  40.7 
 
 		 388 aa  188  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3911  MscS mechanosensitive ion channel  40.64 
 
 		 367 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1154  MscS mechanosensitive ion channel  40.49 
 
 		 442 aa  185  8e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0853  MscS mechanosensitive ion channel  44.9 
 
 		 327 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0593395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0847  MscS mechanosensitive ion channel  44.9 
 
 		 327 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0864  MscS mechanosensitive ion channel  44.9 
 
 		 327 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1824  MscS Mechanosensitive ion channel  38.83 
 
 		 330 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000045049  normal  0.0757476 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11550  small-conductance mechanosensitive channel  35.69 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  42.47 
 
 		 336 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3795  MscS mechanosensitive ion channel  40.49 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.840492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5312  MscS mechanosensitive ion channel  39.13 
 
 		 454 aa  173  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.518656 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7342  MscS Mechanosensitive ion channel  38.43 
 
 		 342 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546474 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4634  MscS Mechanosensitive ion channel  39.34 
 
 		 334 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0333987  normal  0.045581 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2432  MscS Mechanosensitive ion channel  40.79 
 
 		 307 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00547938  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24600  small-conductance mechanosensitive channel  43.2 
 
 		 337 aa  169  6e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.503052  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2744  MscS mechanosensitive ion channel  39.58 
 
 		 315 aa  165  9e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.535922  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1363  MscS Mechanosensitive ion channel  47.34 
 
 		 366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.207761  hitchhiker  0.0000810048 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1378  MscS mechanosensitive ion channel  38.19 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586081  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  37.82 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  36.86 
 
 		 288 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0940  MscS Mechanosensitive ion channel  36.33 
 
 		 293 aa  155  9e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.285938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  37.4 
 
 		 294 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  34.94 
 
 		 299 aa  153  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  39.91 
 
 		 321 aa  150  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1801  MscS Mechanosensitive ion channel  38.71 
 
 		 335 aa  144  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0410  MscS Mechanosensitive ion channel  37.29 
 
 		 372 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  36.15 
 
 		 283 aa  142  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1247  MscS Mechanosensitive ion channel  36.24 
 
 		 370 aa  142  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  31.8 
 
 		 550 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  36.11 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2413  MscS mechanosensitive ion channel  42.61 
 
 		 221 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0138474  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  36.11 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  36.11 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  36.11 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  36.11 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  36.11 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  32.47 
 
 		 285 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  34.66 
 
 		 350 aa  139  6e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  33.99 
 
 		 308 aa  138  8.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3068  hypothetical protein  38.64 
 
 		 756 aa  138  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.36924 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  35.19 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5270  MscS mechanosensitive ion channel  30.94 
 
 		 285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1100  MscS Mechanosensitive ion channel  32.28 
 
 		 341 aa  136  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0753115  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1188  MscS Mechanosensitive ion channel  34.15 
 
 		 549 aa  136  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5604  mechanosensitive ion channel family protein  34.07 
 
 		 293 aa  136  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5331  mechanosensitive ion channel family protein  34.07 
 
 		 293 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0115523  hitchhiker  0.00000270411 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1833  MscS mechanosensitive ion channel  39.09 
 
 		 394 aa  135  8e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2167  MscS Mechanosensitive ion channel  42.62 
 
 		 228 aa  133  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000258413 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2612  MscS mechanosensitive ion channel  32.81 
 
 		 273 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1580  MscS mechanosensitive ion channel  32.49 
 
 		 319 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1609  MscS mechanosensitive ion channel  32.49 
 
 		 319 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1634  MscS mechanosensitive ion channel  32.49 
 
 		 319 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0602  MscS mechanosensitive ion channel  34.38 
 
 		 568 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0823902  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0128  MscS mechanosensitive ion channel  34.4 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2511  MscS mechanosensitive ion channel  33.46 
 
 		 282 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.399769  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1579  mechanosensitive ion channel family protein  30.07 
 
 		 455 aa  130  3e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.397271  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1754  MscS mechanosensitive ion channel  36.7 
 
 		 879 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6682  MscS mechanosensitive ion channel  33.22 
 
 		 293 aa  129  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3355  MscS Mechanosensitive ion channel  31.13 
 
 		 278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0039  hypothetical protein  27.11 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1912  MscS mechanosensitive ion channel  33.06 
 
 		 325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.476783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2861  small conductance mechanosensitive channel ion channel  34.96 
 
 		 767 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.753072  normal  0.757549 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  30.83 
 
 		 289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0332  MscS Mechanosensitive ion channel  33.49 
 
 		 773 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.323369  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2634  MscS Mechanosensitive ion channel  43.68 
 
 		 293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.218755 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1608  MscS Mechanosensitive ion channel  34.51 
 
 		 876 aa  125  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1456  mechanosensitive ion channel protein  29.82 
 
 		 455 aa  125  6e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000389307  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1324  MscS mechanosensitive ion channel  30.56 
 
 		 458 aa  125  6e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00452452  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1277  MscS mechanosensitive ion channel  33.2 
 
 		 718 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175782  normal  0.44534 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2935  MscS Mechanosensitive ion channel  37.79 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.863949  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0846  mechanosensitive ion channel protein MscS  31.48 
 
 		 537 aa  124  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  29.51 
 
 		 528 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4450  MscS mechanosensitive ion channel  33.47 
 
 		 334 aa  123  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  29.51 
 
 		 528 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3001  MscS mechanosensitive ion channel  34.68 
 
 		 693 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  31.1 
 
 		 344 aa  123  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0610  hypothetical protein  33.64 
 
 		 599 aa  123  4e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13121  transmembrane protein  34.78 
 
 		 308 aa  122  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.609452 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1514  MscS mechanosensitive ion channel  34.06 
 
 		 836 aa  122  6e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.767095  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3962  MscS mechanosensitive ion channel  30.08 
 
 		 538 aa  121  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000243935  hitchhiker  0.0037815 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5854  hypothetical protein  35.21 
 
 		 735 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1688  MscS mechanosensitive ion channel  33.01 
 
 		 719 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.265093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1790  MscS Mechanosensitive ion channel  31.72 
 
 		 716 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.192721 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67630  hypothetical protein  35.21 
 
 		 735 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1802  MscS Mechanosensitive ion channel  31.6 
 
 		 753 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.135784  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0901  MscS Mechanosensitive ion channel  31.62 
 
 		 766 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1971  MscS Mechanosensitive ion channel  30.97 
 
 		 716 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0170847  normal  0.348628 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3908  putative small-conductance mechanosensitive channel transmembrane protein  33.97 
 
 		 771 aa  119  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385979 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0082  MscS mechanosensitive ion channel  38.79 
 
 		 303 aa  119  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0423997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0950  MscS mechanosensitive ion channel  33.91 
 
 		 787 aa  118  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  34.15 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5033  MscS mechanosensitive ion channel  35.48 
 
 		 701 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149124 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3072  MscS mechanosensitive ion channel  34.21 
 
 		 773 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.718015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>