More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0540 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0540  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 582 aa  1162    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1803  MscS Mechanosensitive ion channel  34.11 
 
 		 595 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  0.895337 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5186  MscS Mechanosensitive ion channel  33.68 
 
 		 600 aa  276  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000148025 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0610  hypothetical protein  30.66 
 
 		 599 aa  232  1e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0846  mechanosensitive ion channel protein MscS  31.23 
 
 		 537 aa  230  5e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  32.2 
 
 		 550 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3962  MscS mechanosensitive ion channel  32.3 
 
 		 538 aa  223  7e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000243935  hitchhiker  0.0037815 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  31.8 
 
 		 528 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  31.8 
 
 		 528 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2274  MscS mechanosensitive ion channel  30.33 
 
 		 586 aa  222  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13451  putative mechanosensitive ion channel, MscS family protein  30.04 
 
 		 656 aa  198  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1226  MscS Mechanosensitive ion channel  28.96 
 
 		 569 aa  171  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1197  MscS Mechanosensitive ion channel  29.75 
 
 		 569 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0266  small-conductance mechanosensitive channel-like  29.22 
 
 		 505 aa  143  8e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068339 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  28.81 
 
 		 356 aa  138  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  33.19 
 
 		 350 aa  137  6.0000000000000005e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1456  mechanosensitive ion channel protein  33.03 
 
 		 455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000389307  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1579  mechanosensitive ion channel family protein  32.6 
 
 		 455 aa  134  5e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.397271  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1324  MscS mechanosensitive ion channel  32.75 
 
 		 458 aa  134  5e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00452452  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  36.12 
 
 		 299 aa  134  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3797  MscS mechanosensitive ion channel  27.74 
 
 		 871 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198076  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3072  MscS mechanosensitive ion channel  34.2 
 
 		 773 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.718015  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3278  MscS mechanosensitive ion channel  28.21 
 
 		 864 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1833  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 394 aa  132  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1378  MscS mechanosensitive ion channel  32.78 
 
 		 342 aa  128  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586081  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7354  mechanosensitive ion channel  32.19 
 
 		 337 aa  126  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3908  putative small-conductance mechanosensitive channel transmembrane protein  30.7 
 
 		 771 aa  126  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385979 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  31.67 
 
 		 344 aa  126  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0602  MscS mechanosensitive ion channel  38.16 
 
 		 568 aa  125  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0823902  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2189  MscS mechanosensitive ion channel  27.34 
 
 		 821 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  32.3 
 
 		 289 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1971  MscS Mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 716 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0170847  normal  0.348628 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4680  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 837 aa  124  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3624  MscS mechanosensitive ion channel  26.56 
 
 		 822 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749548 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4463  MscS mechanosensitive ion channel  26.56 
 
 		 822 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3903  MscS mechanosensitive ion channel  26.56 
 
 		 822 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  30.89 
 
 		 294 aa  124  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0186  MscS Mechanosensitive ion channel  32 
 
 		 304 aa  123  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  30.83 
 
 		 308 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5311  MscS mechanosensitive ion channel  28.98 
 
 		 858 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021896 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1334  MscS Mechanosensitive ion channel  30.04 
 
 		 335 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3001  MscS mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 693 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5420  MscS Mechanosensitive ion channel  28.12 
 
 		 889 aa  121  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3563  MscS mechanosensitive ion channel  29.33 
 
 		 762 aa  122  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1181  hypothetical protein  28.12 
 
 		 884 aa  121  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.40697 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1790  MscS Mechanosensitive ion channel  30.28 
 
 		 716 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.192721 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  30.38 
 
 		 299 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1247  MscS Mechanosensitive ion channel  32.41 
 
 		 370 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2861  small conductance mechanosensitive channel ion channel  28.19 
 
 		 767 aa  118  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.753072  normal  0.757549 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2549  mechanosensitive ion channel MscS  31.48 
 
 		 342 aa  118  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1136  MscS Mechanosensitive ion channel  29.95 
 
 		 325 aa  117  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1608  MscS Mechanosensitive ion channel  29.06 
 
 		 876 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1154  MscS mechanosensitive ion channel  28.38 
 
 		 442 aa  116  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  32.42 
 
 		 288 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1801  MscS Mechanosensitive ion channel  27.09 
 
 		 335 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1754  MscS mechanosensitive ion channel  29.58 
 
 		 879 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5772  MscS mechanosensitive ion channel  26.91 
 
 		 705 aa  115  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429261  normal  0.122613 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  30.91 
 
 		 336 aa  115  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5312  MscS mechanosensitive ion channel  27.93 
 
 		 454 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.518656 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1487  MscS mechanosensitive ion channel  30.13 
 
 		 796 aa  114  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1802  MscS Mechanosensitive ion channel  26.51 
 
 		 753 aa  114  7.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.135784  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  28.7 
 
 		 321 aa  113  9e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11820  small-conductance mechanosensitive channel  28.37 
 
 		 336 aa  113  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3536  MscS mechanosensitive ion channel  28.36 
 
 		 388 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0950  MscS mechanosensitive ion channel  28.01 
 
 		 787 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3068  hypothetical protein  29.82 
 
 		 756 aa  112  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.36924 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0901  MscS Mechanosensitive ion channel  27.71 
 
 		 766 aa  112  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  28.9 
 
 		 283 aa  111  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3911  MscS mechanosensitive ion channel  27.24 
 
 		 367 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0349  MscS Mechanosensitive ion channel  25.82 
 
 		 759 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5854  hypothetical protein  27.95 
 
 		 735 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67630  hypothetical protein  27.95 
 
 		 735 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1398  MscS Mechanosensitive ion channel  32.65 
 
 		 266 aa  109  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1631  MscS mechanosensitive ion channel  29.69 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1688  MscS mechanosensitive ion channel  25.98 
 
 		 719 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.265093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11550  small-conductance mechanosensitive channel  29.26 
 
 		 316 aa  108  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0940  MscS Mechanosensitive ion channel  29.07 
 
 		 293 aa  108  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.285938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0332  MscS Mechanosensitive ion channel  25.31 
 
 		 773 aa  107  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.323369  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4584  MscS mechanosensitive ion channel  27.63 
 
 		 697 aa  107  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.99351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5133  MscS Mechanosensitive ion channel  28.18 
 
 		 658 aa  107  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538778  normal  0.147558 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2935  MscS Mechanosensitive ion channel  30.52 
 
 		 282 aa  107  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.863949  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2401  MscS Mechanosensitive ion channel  25.12 
 
 		 718 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0124939 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1277  MscS mechanosensitive ion channel  27.52 
 
 		 718 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175782  normal  0.44534 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4477  MscS mechanosensitive ion channel  28.4 
 
 		 772 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4049  MscS Mechanosensitive ion channel  29.67 
 
 		 650 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2784  MscS mechanosensitive ion channel  28 
 
 		 801 aa  105  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.582826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0410  MscS Mechanosensitive ion channel  32.63 
 
 		 372 aa  105  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3795  MscS mechanosensitive ion channel  27.66 
 
 		 313 aa  105  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.840492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1224  MscS Mechanosensitive ion channel  28.27 
 
 		 838 aa  103  7e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1728  hypothetical protein  27.52 
 
 		 717 aa  103  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784062  normal  0.0313644 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0676  mechanosensitive ion channel family protein  27.94 
 
 		 767 aa  103  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2666  MscS Mechanosensitive ion channel  28.51 
 
 		 911 aa  103  9e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232424  normal  0.397707 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1895  small-conductance mechanosensitive ion channel  29.78 
 
 		 787 aa  103  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2612  MscS mechanosensitive ion channel  29.76 
 
 		 273 aa  102  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2980  mechanosensitive ion channel family protein  31.4 
 
 		 286 aa  103  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3991  MscS mechanosensitive ion channel  27.52 
 
 		 715 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0693455  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0544  MscS mechanosensitive ion channel  29.78 
 
 		 787 aa  103  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3355  MscS Mechanosensitive ion channel  28.42 
 
 		 278 aa  103  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1320  MscS mechanosensitive ion channel  27.52 
 
 		 717 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1912  MscS mechanosensitive ion channel  33.15 
 
 		 325 aa  102  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.476783  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>