More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4500 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4500  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 662 aa  1339    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3246  MscS mechanosensitive ion channel  37.97 
 
 		 381 aa  256  8e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00298811  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0641  hypothetical protein  31.94 
 
 		 543 aa  249  1e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  40.07 
 
 		 380 aa  244  5e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1752  MscS Mechanosensitive ion channel  33.14 
 
 		 356 aa  208  2e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  40.94 
 
 		 362 aa  206  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3016  MscS mechanosensitive ion channel  40.7 
 
 		 426 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0689  MscS mechanosensitive ion channel  35.28 
 
 		 351 aa  191  4e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.13803  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1409  MscS mechanosensitive ion channel  34.99 
 
 		 351 aa  189  2e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0938  MscS Mechanosensitive ion channel  34.9 
 
 		 433 aa  184  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.466834  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  35.19 
 
 		 433 aa  184  7e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.940167  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0941  MscS mechanosensitive ion channel  32.27 
 
 		 467 aa  183  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884334  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0887  MscS mechanosensitive ion channel  34.1 
 
 		 431 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0881194  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1277  MscS mechanosensitive ion channel  37.16 
 
 		 352 aa  183  1e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0942  MscS Mechanosensitive ion channel  33.23 
 
 		 377 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000347454  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0195  MscS mechanosensitive ion channel  32.5 
 
 		 354 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0052728  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  29.76 
 
 		 624 aa  174  5e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1267  MscS mechanosensitive ion channel  34.69 
 
 		 351 aa  173  9e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4048  MscS mechanosensitive ion channel  26.94 
 
 		 569 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138882  normal  0.12233 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  28.15 
 
 		 682 aa  163  1e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0042  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 375 aa  160  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.634821  normal  0.103785 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1462  small-conductance mechanosensitive channel protein  32.17 
 
 		 373 aa  160  7e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1737  mechanosensitive ion channel family protein  27.41 
 
 		 624 aa  159  1e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.64597  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4194  MscS mechanosensitive ion channel  29.61 
 
 		 562 aa  158  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1578  small-conductance mechanosensitive channel  27.99 
 
 		 534 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00006998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1500  MscS mechanosensitive ion channel  27.05 
 
 		 614 aa  155  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638706  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0172  MscS mechanosensitive ion channel  38.54 
 
 		 375 aa  153  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0460  putative mechanosensitive ion channel  32.04 
 
 		 357 aa  152  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1791  small-conductance mechanosensitive channel  36.74 
 
 		 369 aa  151  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0722785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1295  MscS mechanosensitive ion channel  27.49 
 
 		 391 aa  150  6e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4873  MscS Mechanosensitive ion channel  26.33 
 
 		 567 aa  150  8e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05088  hypothetical protein  31.25 
 
 		 399 aa  150  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0263  mechanosensitive ion channel family protein  29.18 
 
 		 627 aa  148  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0883  MscS mechanosensitive ion channel  30.35 
 
 		 380 aa  148  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199191 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0289  mechanosensitive ion channel family protein  27.59 
 
 		 627 aa  148  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.658149  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1154  hypothetical protein  31.52 
 
 		 363 aa  148  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0298455  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1791  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  32.58 
 
 		 343 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01308  conserved inner membrane protein  32.6 
 
 		 343 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2315  MscS Mechanosensitive ion channel  32.6 
 
 		 343 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0901587  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1570  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  32.6 
 
 		 343 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1543  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  32.6 
 
 		 343 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2294  MscS mechanosensitive ion channel  32.6 
 
 		 343 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1978  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  32.6 
 
 		 343 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218747 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1447  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  32.6 
 
 		 343 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01318  hypothetical protein  32.6 
 
 		 343 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.831445  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0236  mechanosensitive ion channel family protein  28.88 
 
 		 627 aa  146  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0857  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  29.18 
 
 		 383 aa  145  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017497  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1059  MscS mechanosensitive ion channel  30.34 
 
 		 384 aa  145  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.196377 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1943  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 533 aa  144  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000658199  decreased coverage  0.00758396 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  29.39 
 
 		 633 aa  144  4e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1936  MscS mechanosensitive ion channel  25.65 
 
 		 413 aa  144  6e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1452  MscS mechanosensitive ion channel  34.21 
 
 		 355 aa  144  7e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.678727  normal  0.0144942 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0707  MscS Mechanosensitive ion channel  28.12 
 
 		 344 aa  144  7e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1177  mechanosensitive ion channel  30.71 
 
 		 383 aa  142  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1822  MscS mechanosensitive ion channel  36.67 
 
 		 374 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00396347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2594  MscS mechanosensitive ion channel  29.33 
 
 		 388 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0691  MscS Mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 362 aa  141  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4689  MscS Mechanosensitive ion channel  31.62 
 
 		 374 aa  141  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3612  MscS Mechanosensitive ion channel  31.62 
 
 		 374 aa  141  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.649067 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0803  small mechanosensitive ion channel  27.94 
 
 		 342 aa  140  1e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  27.84 
 
 		 484 aa  139  2e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1848  MscS family hypothetical protein  31.58 
 
 		 343 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.512359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1786  MscS family inner membrane protein YnaI  31.58 
 
 		 343 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0416525  normal  0.388102 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1788  MscS family inner membrane protein YnaI  31.82 
 
 		 343 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150216 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1670  MscS family inner membrane protein YnaI  31.82 
 
 		 343 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.107683 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3649  mechanosensitive ion channel family protein  29.2 
 
 		 374 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158368  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1488  MscS family inner membrane protein YnaI  31.82 
 
 		 343 aa  137  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.445516  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1352  MscS mechanosensitive ion channel  33.62 
 
 		 376 aa  135  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.308859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001221  small-conductance mechanosensitive channel  28 
 
 		 367 aa  134  6e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2066  MscS mechanosensitive ion channel  28.85 
 
 		 424 aa  133  9e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.838165  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0905  MscS Mechanosensitive ion channel  32.08 
 
 		 373 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0910  MscS mechanosensitive ion channel  28.61 
 
 		 400 aa  133  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505459  normal  0.0192096 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4932  MscS Mechanosensitive ion channel  34.56 
 
 		 400 aa  132  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00392  hypothetical protein  30.42 
 
 		 377 aa  131  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.65965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4007  MscS mechanosensitive ion channel  35.71 
 
 		 376 aa  131  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0987654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2171  MscS mechanosensitive ion channel  34.29 
 
 		 374 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07011  small mechanosensitive ion channel  33.64 
 
 		 343 aa  130  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184839  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3357  MscS Mechanosensitive ion channel  35.71 
 
 		 376 aa  130  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2152  MscS mechanosensitive ion channel  35.38 
 
 		 377 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06981  small mechanosensitive ion channel  27.59 
 
 		 338 aa  128  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.247932  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3360  hypothetical protein  33.18 
 
 		 374 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2398  MscS mechanosensitive ion channel  33.18 
 
 		 374 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0075  small-conductance mechanosensitive channel  27.95 
 
 		 338 aa  127  5e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.221122  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1076  MscS mechanosensitive ion channel  29.39 
 
 		 378 aa  127  6e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.119695  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0635  small mechanosensitive ion channel  32.41 
 
 		 343 aa  126  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.352398  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06621  small mechanosensitive ion channel  27.57 
 
 		 343 aa  126  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.16712  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4608  MscS mechanosensitive ion channel  34.86 
 
 		 386 aa  125  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.247282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3200  MscS mechanosensitive ion channel  23.43 
 
 		 590 aa  124  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  25.07 
 
 		 362 aa  124  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20120  Mechanosensitive ion channel family protein  30.12 
 
 		 418 aa  123  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2220  MscS Mechanosensitive ion channel  32.73 
 
 		 339 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07431  small mechanosensitive ion channel  29.26 
 
 		 343 aa  121  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.1802 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06911  small mechanosensitive ion channel  27.55 
 
 		 343 aa  121  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412375  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5283  MscS Mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 376 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4427  MscS Mechanosensitive ion channel  31.79 
 
 		 349 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0238849  normal  0.125106 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0253  mechanosensitive ion channel family protein  30.56 
 
 		 378 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0247  mechanosensitive ion channel family protein  30.56 
 
 		 378 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0970  small-conductance mechanosensitive ion channel  26.24 
 
 		 650 aa  119  3e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371389 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1366  MscS Mechanosensitive ion channel  32.04 
 
 		 377 aa  118  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0389612  hitchhiker  0.000813003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1381  MscS Mechanosensitive ion channel  32.04 
 
 		 377 aa  118  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.524748 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>