More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1076 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1076  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 378 aa  758    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.119695  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1462  small-conductance mechanosensitive channel protein  38.48 
 
 		 373 aa  236  4e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1059  MscS mechanosensitive ion channel  38.22 
 
 		 384 aa  228  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.196377 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1936  MscS mechanosensitive ion channel  37.11 
 
 		 413 aa  222  9e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1295  MscS mechanosensitive ion channel  33.63 
 
 		 391 aa  216  7e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1177  mechanosensitive ion channel  33.87 
 
 		 383 aa  209  5e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1848  MscS family hypothetical protein  41.07 
 
 		 343 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.512359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1791  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  41.63 
 
 		 343 aa  207  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2066  MscS mechanosensitive ion channel  34.25 
 
 		 424 aa  207  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.838165  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1786  MscS family inner membrane protein YnaI  41.07 
 
 		 343 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0416525  normal  0.388102 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1670  MscS family inner membrane protein YnaI  41.07 
 
 		 343 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.107683 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1788  MscS family inner membrane protein YnaI  41.07 
 
 		 343 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150216 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1488  MscS family inner membrane protein YnaI  40.62 
 
 		 343 aa  207  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.445516  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0857  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  33.55 
 
 		 383 aa  206  4e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017497  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01308  conserved inner membrane protein  41.63 
 
 		 343 aa  206  6e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2315  MscS Mechanosensitive ion channel  41.63 
 
 		 343 aa  206  6e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0901587  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1978  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  41.63 
 
 		 343 aa  206  6e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218747 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01318  hypothetical protein  41.63 
 
 		 343 aa  206  6e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.831445  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1447  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  41.63 
 
 		 343 aa  206  6e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1543  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  41.63 
 
 		 343 aa  206  6e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2294  MscS mechanosensitive ion channel  41.63 
 
 		 343 aa  206  6e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1570  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  41.63 
 
 		 343 aa  206  6e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1791  small-conductance mechanosensitive channel  34.37 
 
 		 369 aa  203  5e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0722785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001221  small-conductance mechanosensitive channel  31.37 
 
 		 367 aa  191  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0460  putative mechanosensitive ion channel  37.09 
 
 		 357 aa  191  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05088  hypothetical protein  31.13 
 
 		 399 aa  190  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0700  hypothetical protein  31.03 
 
 		 365 aa  170  4e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.744044 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04171  small mechanosensitive ion channel, MscS family protein  30.51 
 
 		 370 aa  162  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.610357 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27641  small mechanosensitive ion channel, MscS family protein  30.8 
 
 		 373 aa  155  8e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3246  MscS mechanosensitive ion channel  32.14 
 
 		 381 aa  150  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00298811  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2212  small mechanosensitive ion channel  34.39 
 
 		 357 aa  143  5e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.414294  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2220  MscS Mechanosensitive ion channel  30.03 
 
 		 339 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  31.92 
 
 		 380 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1752  MscS Mechanosensitive ion channel  32.47 
 
 		 356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0910  MscS mechanosensitive ion channel  30.34 
 
 		 400 aa  123  6e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505459  normal  0.0192096 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0883  MscS mechanosensitive ion channel  34.23 
 
 		 380 aa  119  7.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199191 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4500  MscS Mechanosensitive ion channel  28.87 
 
 		 662 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0847  mechanosensitive ion channel family protein  26.44 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0334937  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0942  MscS Mechanosensitive ion channel  28.11 
 
 		 377 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000347454  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2594  MscS mechanosensitive ion channel  31.09 
 
 		 388 aa  113  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1154  hypothetical protein  26.19 
 
 		 363 aa  110  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0298455  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1737  mechanosensitive ion channel family protein  30.47 
 
 		 624 aa  108  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.64597  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0887  MscS mechanosensitive ion channel  29 
 
 		 431 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0881194  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  27.43 
 
 		 633 aa  103  6e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0938  MscS Mechanosensitive ion channel  28.72 
 
 		 433 aa  103  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.466834  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  28.37 
 
 		 433 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.940167  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  26.44 
 
 		 682 aa  102  1e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0941  MscS mechanosensitive ion channel  27.43 
 
 		 467 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884334  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0042  MscS Mechanosensitive ion channel  25.46 
 
 		 375 aa  97.1  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.634821  normal  0.103785 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0905  MscS Mechanosensitive ion channel  26.74 
 
 		 373 aa  94.7  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 362 aa  93.6  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1900  MscS mechanosensitive ion channel  27.75 
 
 		 240 aa  92.8  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0998935  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4427  MscS Mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 349 aa  92.8  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0238849  normal  0.125106 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1381  MscS Mechanosensitive ion channel  26.64 
 
 		 377 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.524748 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1350  MscS Mechanosensitive ion channel  26.64 
 
 		 377 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000205244  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1366  MscS Mechanosensitive ion channel  26.64 
 
 		 377 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0389612  hitchhiker  0.000813003 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1920  MscS Mechanosensitive ion channel  26.64 
 
 		 377 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000103017  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2101  MscS Mechanosensitive ion channel  26.64 
 
 		 377 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000188968 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0691  MscS Mechanosensitive ion channel  28.12 
 
 		 362 aa  90.9  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3612  MscS Mechanosensitive ion channel  25.74 
 
 		 374 aa  90.5  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.649067 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4689  MscS Mechanosensitive ion channel  25.74 
 
 		 374 aa  90.5  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2171  MscS mechanosensitive ion channel  30.52 
 
 		 374 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  24.17 
 
 		 484 aa  89.7  7e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3016  MscS mechanosensitive ion channel  26.46 
 
 		 426 aa  88.2  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2398  MscS mechanosensitive ion channel  29.11 
 
 		 374 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4048  MscS mechanosensitive ion channel  26.16 
 
 		 569 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138882  normal  0.12233 
 
 
-
 
NC_003296  RS00392  hypothetical protein  25.22 
 
 		 377 aa  87  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.65965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  26.82 
 
 		 806 aa  86.7  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1578  small-conductance mechanosensitive channel  24.66 
 
 		 534 aa  86.7  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00006998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0195  MscS mechanosensitive ion channel  23.68 
 
 		 354 aa  86.3  8e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0052728  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3360  hypothetical protein  28.64 
 
 		 374 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1966  hypothetical protein  31.55 
 
 		 268 aa  85.9  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0247  mechanosensitive ion channel family protein  28.34 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1352  MscS mechanosensitive ion channel  26.83 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.308859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0253  mechanosensitive ion channel family protein  27.81 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0922  MscS mechanosensitive ion channel  30.34 
 
 		 456 aa  84  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837868 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4194  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 562 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1500  MscS mechanosensitive ion channel  28.38 
 
 		 614 aa  83.2  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638706  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1943  MscS mechanosensitive ion channel  25.57 
 
 		 533 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000658199  decreased coverage  0.00758396 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4932  MscS Mechanosensitive ion channel  23.51 
 
 		 400 aa  82.4  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20120  Mechanosensitive ion channel family protein  24.38 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  23.99 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  23.86 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  26.85 
 
 		 362 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3671  MscS mechanosensitive ion channel  27.81 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0236  mechanosensitive ion channel family protein  23.39 
 
 		 627 aa  80.5  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0172  MscS mechanosensitive ion channel  26.81 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4873  MscS Mechanosensitive ion channel  25.43 
 
 		 567 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  24.84 
 
 		 624 aa  80.1  0.00000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0803  small mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 342 aa  79.7  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5283  MscS Mechanosensitive ion channel  26.01 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  23.95 
 
 		 364 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4608  MscS mechanosensitive ion channel  27.56 
 
 		 386 aa  79.3  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.247282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01752  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  28.11 
 
 		 328 aa  79.3  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249612  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4007  MscS mechanosensitive ion channel  29.39 
 
 		 376 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0987654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0757  MscS mechanosensitive ion channel  22.95 
 
 		 479 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0289  mechanosensitive ion channel family protein  23.68 
 
 		 627 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.658149  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3649  mechanosensitive ion channel family protein  24.36 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158368  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2152  MscS mechanosensitive ion channel  24.17 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  27.37 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>