More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1411 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1411  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 373 aa  737    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1410  MscS Mechanosensitive ion channel  40.18 
 
 		 362 aa  242  9e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  44.7 
 
 		 380 aa  102  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1752  MscS Mechanosensitive ion channel  31.15 
 
 		 356 aa  100  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  34.92 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1464  MscS Mechanosensitive ion channel  31.2 
 
 		 338 aa  98.2  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  28.63 
 
 		 360 aa  96.3  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3246  MscS mechanosensitive ion channel  38.36 
 
 		 381 aa  96.3  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00298811  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1295  MscS mechanosensitive ion channel  29.92 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0042  MscS Mechanosensitive ion channel  28.32 
 
 		 375 aa  90.5  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.634821  normal  0.103785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4873  MscS Mechanosensitive ion channel  30.18 
 
 		 567 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1462  small-conductance mechanosensitive channel protein  33.33 
 
 		 373 aa  87.4  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0938  MscS Mechanosensitive ion channel  36.31 
 
 		 433 aa  87  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.466834  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4048  MscS mechanosensitive ion channel  30.49 
 
 		 569 aa  87  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138882  normal  0.12233 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  38 
 
 		 433 aa  86.7  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.940167  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4194  MscS mechanosensitive ion channel  41.18 
 
 		 562 aa  86.3  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0941  MscS mechanosensitive ion channel  35.14 
 
 		 467 aa  85.9  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884334  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  27.24 
 
 		 369 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0887  MscS mechanosensitive ion channel  38 
 
 		 431 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0881194  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3200  MscS mechanosensitive ion channel  29.06 
 
 		 590 aa  85.1  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1500  MscS mechanosensitive ion channel  35.63 
 
 		 614 aa  82.8  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638706  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1791  small-conductance mechanosensitive channel  46.39 
 
 		 369 aa  82.8  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0722785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  30.26 
 
 		 484 aa  82.4  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1578  small-conductance mechanosensitive channel  41.23 
 
 		 534 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00006998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  35.03 
 
 		 361 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1059  MscS mechanosensitive ion channel  44.66 
 
 		 384 aa  81.3  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.196377 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3016  MscS mechanosensitive ion channel  32.32 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  31.66 
 
 		 359 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  35.8 
 
 		 341 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0970  small-conductance mechanosensitive ion channel  32.28 
 
 		 650 aa  79  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371389 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1446  MscS mechanosensitive ion channel  32.28 
 
 		 648 aa  79  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.770596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  28.09 
 
 		 362 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  27.84 
 
 		 369 aa  79  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1936  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0641  hypothetical protein  35.54 
 
 		 543 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  32.73 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1943  MscS mechanosensitive ion channel  39.17 
 
 		 533 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000658199  decreased coverage  0.00758396 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0857  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  28.69 
 
 		 383 aa  78.6  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017497  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1900  MscS mechanosensitive ion channel  31.52 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0998935  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  26.81 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1177  mechanosensitive ion channel  28.69 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30945  MscS family transporter: small-conductance mechanosensitive ion channel  32.31 
 
 		 473 aa  74.7  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.111123  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0707  MscS Mechanosensitive ion channel  26.91 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1650  MscS mechanosensitive ion channel  28.92 
 
 		 570 aa  75.5  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598293 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0253  mechanosensitive ion channel family protein  36.72 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0247  mechanosensitive ion channel family protein  36.72 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1076  MscS mechanosensitive ion channel  28.35 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.119695  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3360  hypothetical protein  32 
 
 		 374 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2398  MscS mechanosensitive ion channel  32 
 
 		 374 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0195  MscS mechanosensitive ion channel  36.25 
 
 		 354 aa  72  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0052728  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1788  MscS family inner membrane protein YnaI  26.83 
 
 		 343 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150216 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07431  small mechanosensitive ion channel  21.99 
 
 		 343 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.1802 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2152  MscS mechanosensitive ion channel  26.67 
 
 		 377 aa  72.4  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4500  MscS Mechanosensitive ion channel  26.16 
 
 		 662 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2171  MscS mechanosensitive ion channel  30.67 
 
 		 374 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1670  MscS family inner membrane protein YnaI  26.83 
 
 		 343 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.107683 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1848  MscS family hypothetical protein  26.64 
 
 		 343 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.512359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  32.45 
 
 		 362 aa  72  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1786  MscS family inner membrane protein YnaI  26.64 
 
 		 343 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0416525  normal  0.388102 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1488  MscS family inner membrane protein YnaI  27.08 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.445516  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05088  hypothetical protein  30.4 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3649  mechanosensitive ion channel family protein  31.79 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158368  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2357  hypothetical protein  26.47 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.116724  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1852  MscS Mechanosensitive ion channel  28.49 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.390235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20120  Mechanosensitive ion channel family protein  30.34 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1791  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  35.43 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1822  MscS mechanosensitive ion channel  31.79 
 
 		 374 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00396347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0617  MscS mechanosensitive ion channel  25.63 
 
 		 338 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0905  MscS Mechanosensitive ion channel  27.14 
 
 		 373 aa  68.9  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  34 
 
 		 624 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01308  conserved inner membrane protein  35.43 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2315  MscS Mechanosensitive ion channel  35.43 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0901587  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1277  MscS mechanosensitive ion channel  27.64 
 
 		 352 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01318  hypothetical protein  35.43 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.831445  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1447  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  35.43 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2294  MscS mechanosensitive ion channel  35.43 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1570  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  35.43 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2568  MscS mechanosensitive ion channel  24.74 
 
 		 358 aa  68.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1978  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  35.43 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218747 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0141  MscS Mechanosensitive ion channel  38.61 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195967  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1543  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  35.43 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4819  MscS mechanosensitive ion channel  31.06 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.749552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  25.58 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5283  MscS Mechanosensitive ion channel  37.19 
 
 		 376 aa  67  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1210  MscS mechanosensitive ion channel  32.52 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1933  MscS Mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03115  MscS Mechanosensitive ion channel  32.06 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0263  mechanosensitive ion channel family protein  26.15 
 
 		 627 aa  66.2  0.0000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2942  MscS mechanosensitive ion channel  31.25 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1124  MscS Mechanosensitive ion channel  23.9 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.745547  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0409  hypothetical protein  28.97 
 
 		 293 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0214224  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0289  mechanosensitive ion channel family protein  26.15 
 
 		 627 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.658149  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1267  MscS mechanosensitive ion channel  32.77 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0420  hypothetical protein  28.97 
 
 		 293 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.387203  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0236  mechanosensitive ion channel family protein  32.77 
 
 		 627 aa  66.2  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00392  hypothetical protein  27.23 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.65965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0689  MscS mechanosensitive ion channel  31.93 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.13803  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4427  MscS Mechanosensitive ion channel  25.44 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0238849  normal  0.125106 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4932  MscS Mechanosensitive ion channel  24.75 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0922  MscS mechanosensitive ion channel  27.84 
 
 		 456 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>