More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_30945 on replicon NC_009358
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009358  OSTLU_30945  MscS family transporter: small-conductance mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 473 aa  967    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.111123  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1295  MscS mechanosensitive ion channel  36.26 
 
 		 391 aa  100  6e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1791  small-conductance mechanosensitive channel  34.87 
 
 		 369 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0722785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1059  MscS mechanosensitive ion channel  32.28 
 
 		 384 aa  84.7  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.196377 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1936  MscS mechanosensitive ion channel  36.67 
 
 		 413 aa  79.7  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4873  MscS Mechanosensitive ion channel  30.85 
 
 		 567 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0641  hypothetical protein  32.19 
 
 		 543 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1462  small-conductance mechanosensitive channel protein  36.15 
 
 		 373 aa  77.8  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0141  MscS Mechanosensitive ion channel  40.34 
 
 		 373 aa  76.3  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195967  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3016  MscS mechanosensitive ion channel  31.64 
 
 		 426 aa  76.3  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1688  MscS mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 719 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.265093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4048  MscS mechanosensitive ion channel  29.85 
 
 		 569 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138882  normal  0.12233 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0190  small-conductance mechanosensitive channel  29.32 
 
 		 263 aa  75.5  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  33.33 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1578  small-conductance mechanosensitive channel  30.25 
 
 		 534 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00006998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1411  MscS Mechanosensitive ion channel  32.31 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0707  MscS Mechanosensitive ion channel  33.83 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1500  MscS mechanosensitive ion channel  31.54 
 
 		 614 aa  74.3  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638706  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1900  MscS mechanosensitive ion channel  34.04 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0998935  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  31.29 
 
 		 380 aa  73.6  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4194  MscS mechanosensitive ion channel  31.52 
 
 		 562 aa  73.6  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1457  MscS mechanosensitive ion channel  40.52 
 
 		 768 aa  73.6  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3246  MscS mechanosensitive ion channel  34.78 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00298811  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0442  MscS Mechanosensitive ion channel  27.71 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  38.66 
 
 		 286 aa  72.8  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1943  MscS mechanosensitive ion channel  28.4 
 
 		 533 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000658199  decreased coverage  0.00758396 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1452  MscS mechanosensitive ion channel  34.4 
 
 		 355 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.678727  normal  0.0144942 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  30.92 
 
 		 289 aa  72.4  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0104  hypothetical protein  30.26 
 
 		 280 aa  72  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0511133  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0887  MscS mechanosensitive ion channel  32.22 
 
 		 431 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0881194  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  37.9 
 
 		 294 aa  72.4  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1277  MscS mechanosensitive ion channel  32.65 
 
 		 718 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175782  normal  0.44534 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2740  MscS mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4819  MscS mechanosensitive ion channel  31.03 
 
 		 392 aa  71.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.749552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  36.79 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0767  small-conductance mechanosensitive ion channel  33.93 
 
 		 401 aa  71.2  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.967765  normal  0.366005 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1852  MscS Mechanosensitive ion channel  37.4 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.390235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2507  MscS mechanosensitive ion channel  26.9 
 
 		 475 aa  71.2  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2109  MscS Mechanosensitive ion channel  28.02 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  35.96 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0042  MscS Mechanosensitive ion channel  29.78 
 
 		 375 aa  70.9  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.634821  normal  0.103785 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  32.8 
 
 		 538 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0773  MscS mechanosensitive ion channel  33.04 
 
 		 401 aa  70.5  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0332  MscS Mechanosensitive ion channel  34.01 
 
 		 773 aa  70.5  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.323369  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0938  MscS Mechanosensitive ion channel  34.25 
 
 		 433 aa  70.5  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.466834  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0452  MscS mechanosensitive ion channel  34.96 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00426986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  33.94 
 
 		 341 aa  69.7  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  34.03 
 
 		 433 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.940167  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  35.51 
 
 		 275 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  29.21 
 
 		 281 aa  69.7  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  36.75 
 
 		 288 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  26.47 
 
 		 406 aa  69.7  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  35.05 
 
 		 532 aa  69.7  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0691  MscS Mechanosensitive ion channel  32.82 
 
 		 362 aa  69.7  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  28.45 
 
 		 624 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1352  MscS mechanosensitive ion channel  39.18 
 
 		 376 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.308859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  31.82 
 
 		 547 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  35.09 
 
 		 288 aa  69.7  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1410  MscS Mechanosensitive ion channel  29.55 
 
 		 362 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4433  MscS Mechanosensitive ion channel  31.55 
 
 		 285 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  32 
 
 		 533 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1650  MscS mechanosensitive ion channel  23.22 
 
 		 570 aa  68.9  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598293 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4349  MscS Mechanosensitive ion channel  31.55 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4989  MscS mechanosensitive ion channel  38.14 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0847315  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4503  MscS Mechanosensitive ion channel  31.55 
 
 		 285 aa  69.3  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3171  MscS mechanosensitive ion channel  38.14 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  34.02 
 
 		 563 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4436  MscS Mechanosensitive ion channel  31.55 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.312478 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0172  MscS mechanosensitive ion channel  40.43 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0857  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  35.9 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017497  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5270  MscS mechanosensitive ion channel  34.96 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0136  MscS mechanosensitive ion channel  32.8 
 
 		 451 aa  68.2  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1350  MscS Mechanosensitive ion channel  29.26 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000205244  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1728  hypothetical protein  29.06 
 
 		 717 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784062  normal  0.0313644 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1435  hypothetical protein  28.33 
 
 		 983 aa  67.8  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1549  hypothetical protein  28.33 
 
 		 983 aa  67.8  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  29.03 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  33.67 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44327  predicted protein  27.81 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.242296  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1177  mechanosensitive ion channel  35.9 
 
 		 383 aa  67.8  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3649  mechanosensitive ion channel family protein  37.76 
 
 		 374 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158368  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3256  MscS mechanosensitive ion channel  36.73 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00789281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2942  MscS mechanosensitive ion channel  37.11 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20120  Mechanosensitive ion channel family protein  30.67 
 
 		 418 aa  67.4  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5106  MscS mechanosensitive ion channel  36.73 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0140126  decreased coverage  0.0019989 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  34.96 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  31.71 
 
 		 544 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  32.54 
 
 		 293 aa  67  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  32.54 
 
 		 293 aa  67  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  32.38 
 
 		 633 aa  67.4  0.0000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  32.54 
 
 		 293 aa  67  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3994  hypothetical protein  38.53 
 
 		 792 aa  67  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.535307  normal  0.386715 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  32.54 
 
 		 293 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1320  MscS mechanosensitive ion channel  32.65 
 
 		 717 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3991  MscS mechanosensitive ion channel  32.65 
 
 		 715 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0693455  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 362 aa  67  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  31.03 
 
 		 682 aa  66.6  0.0000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04171  small mechanosensitive ion channel, MscS family protein  26.58 
 
 		 370 aa  66.6  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.610357 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0546  MscS mechanosensitive ion channel  35 
 
 		 291 aa  67  0.0000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  31.95 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>