More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1435 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp1435  hypothetical protein  100 
 
 		 983 aa  1969    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1549  hypothetical protein  98.07 
 
 		 983 aa  1936    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  29.21 
 
 		 291 aa  148  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  24.87 
 
 		 844 aa  144  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  30.97 
 
 		 299 aa  143  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  24.87 
 
 		 843 aa  142  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2730  potassium efflux system KEFA  29.8 
 
 		 825 aa  141  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668875  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  30.23 
 
 		 1235 aa  138  6.0000000000000005e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  28.36 
 
 		 298 aa  137  8e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  28.04 
 
 		 842 aa  136  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0935  MscS mechanosensitive ion channel  30.82 
 
 		 845 aa  135  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5300  MscS Mechanosensitive ion channel  29.94 
 
 		 909 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154619  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  29.35 
 
 		 825 aa  132  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  32.26 
 
 		 840 aa  132  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4833  MscS mechanosensitive ion channel  29.94 
 
 		 947 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.882104  normal  0.702316 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4343  MscS mechanosensitive ion channel  29.77 
 
 		 910 aa  131  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  28.81 
 
 		 832 aa  131  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  25.72 
 
 		 859 aa  129  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5378  MscS Mechanosensitive ion channel  32.51 
 
 		 909 aa  128  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.287309  normal  0.723398 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  28.97 
 
 		 830 aa  127  9e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4708  hypothetical protein  27.52 
 
 		 1108 aa  127  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4625  hypothetical protein  27.52 
 
 		 1108 aa  127  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.288253  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  32.24 
 
 		 847 aa  127  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4616  hypothetical protein  27.52 
 
 		 1108 aa  127  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.115019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4765  hypothetical protein  27.52 
 
 		 1108 aa  127  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.514219  normal  0.17769 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4744  hypothetical protein  27.52 
 
 		 1108 aa  127  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  32.24 
 
 		 847 aa  127  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  32.09 
 
 		 849 aa  126  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  31.48 
 
 		 1144 aa  126  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  29.52 
 
 		 860 aa  125  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3059  MscS mechanosensitive ion channel  27.44 
 
 		 879 aa  125  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0365719  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1608  MscS mechanosensitive ion channel  30.99 
 
 		 868 aa  125  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4630  hypothetical protein  27.52 
 
 		 1107 aa  124  6e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.250026  normal  0.0442574 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4691  hypothetical protein  27.52 
 
 		 1107 aa  125  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00421616  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04029  predicted mechanosensitive channel  27.52 
 
 		 1107 aa  124  7e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.475668  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3831  MscS Mechanosensitive ion channel  27.52 
 
 		 1107 aa  124  7e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915765  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3851  hypothetical protein  27.52 
 
 		 1107 aa  124  7e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332968 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4716  hypothetical protein  27.52 
 
 		 1107 aa  124  7e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00612141  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5675  hypothetical protein  27.52 
 
 		 1107 aa  124  7e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00234961  normal  0.548719 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 685 aa  124  7e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4401  hypothetical protein  27.52 
 
 		 1107 aa  124  7e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03991  hypothetical protein  27.52 
 
 		 1107 aa  124  7e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.391275  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2257  MscS mechanosensitive ion channel  34.62 
 
 		 1110 aa  124  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371999  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  26.02 
 
 		 891 aa  124  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  31.86 
 
 		 1127 aa  123  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4556  MscS Mechanosensitive ion channel  31.82 
 
 		 883 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0198839  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0345  hypothetical protein  26.61 
 
 		 1103 aa  123  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.742298  unclonable  0.00000473028 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  26.02 
 
 		 785 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  30.26 
 
 		 1166 aa  122  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3045  potassium efflux protein KefA  32.4 
 
 		 1133 aa  121  7.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  29.46 
 
 		 843 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  27.35 
 
 		 806 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3222  MscS mechanosensitive ion channel  27.72 
 
 		 866 aa  120  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  26.06 
 
 		 874 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0101  putative AefA  30.58 
 
 		 338 aa  119  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3390  MscS mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 861 aa  119  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0384  hypothetical protein  26.73 
 
 		 1107 aa  119  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.207125  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0586  MscS mechanosensitive ion channel  25.23 
 
 		 1067 aa  119  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0875624 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0587  MscS mechanosensitive ion channel  25.23 
 
 		 1067 aa  118  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0226105 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3291  MscS mechanosensitive ion channel  28.09 
 
 		 1068 aa  118  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.563171  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1453  MscS mechanosensitive ion channel  30.13 
 
 		 1105 aa  118  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2883  potassium efflux protein KefA  30.73 
 
 		 1120 aa  117  6.9999999999999995e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0991479 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3204  potassium efflux protein KefA  30.73 
 
 		 1120 aa  117  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3064  potassium efflux protein KefA  30.73 
 
 		 1120 aa  117  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  30.29 
 
 		 636 aa  117  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2151  MscS mechanosensitive ion channel  29.67 
 
 		 1158 aa  117  8.999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  30.29 
 
 		 636 aa  117  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  30.73 
 
 		 1118 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0473  hypothetical protein  26.73 
 
 		 1104 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  30.73 
 
 		 1120 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  27.42 
 
 		 867 aa  117  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  30.73 
 
 		 1120 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3934  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1107 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  29.95 
 
 		 795 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3756  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1107 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  30.73 
 
 		 1118 aa  117  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  30.73 
 
 		 1118 aa  117  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  32.39 
 
 		 322 aa  116  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  30.17 
 
 		 1115 aa  115  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3036  transporter, putative  26.97 
 
 		 1080 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0415629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3343  mechanosensitive ion channel protein  32.24 
 
 		 813 aa  115  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.183155 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3551  MscS mechanosensitive ion channel  27.53 
 
 		 1062 aa  114  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588  transporter, putative  26.97 
 
 		 1067 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3443  MscS mechanosensitive ion channel  26.97 
 
 		 1067 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  29.67 
 
 		 472 aa  114  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  31.34 
 
 		 796 aa  114  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3321  MscS mechanosensitive ion channel  26.97 
 
 		 1078 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.660513  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3721  MscS Mechanosensitive ion channel  26.97 
 
 		 1072 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  29.61 
 
 		 1120 aa  113  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4182  MscS mechanosensitive ion channel  25.7 
 
 		 1070 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0555  MscS mechanosensitive ion channel  26.42 
 
 		 1060 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0475901  normal  0.179203 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  29.61 
 
 		 1120 aa  113  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  29.61 
 
 		 1120 aa  113  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3904  MscS mechanosensitive ion channel  26.97 
 
 		 1072 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0786  MscS mechanosensitive ion channel  26.42 
 
 		 1066 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.213544  hitchhiker  0.000495101 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0547  MscS mechanosensitive ion channel  26.97 
 
 		 1067 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  29.61 
 
 		 1118 aa  113  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  29.61 
 
 		 1120 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  29.61 
 
 		 1120 aa  113  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  29.61 
 
 		 1120 aa  113  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>