More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44327 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_44327  predicted protein  100 
 
 		 391 aa  804    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.242296  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48892  predicted protein  40.11 
 
 		 485 aa  286  2.9999999999999996e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.301331  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0857  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  26.92 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017497  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1059  MscS mechanosensitive ion channel  37.01 
 
 		 384 aa  83.2  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.196377 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0700  hypothetical protein  35.29 
 
 		 365 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.744044 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1791  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  25.68 
 
 		 343 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1936  MscS mechanosensitive ion channel  30.86 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01308  conserved inner membrane protein  25.68 
 
 		 343 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2315  MscS Mechanosensitive ion channel  25.68 
 
 		 343 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0901587  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1462  small-conductance mechanosensitive channel protein  36 
 
 		 373 aa  82  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1447  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  25.68 
 
 		 343 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1543  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  25.68 
 
 		 343 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01318  hypothetical protein  25.68 
 
 		 343 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.831445  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1570  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  25.68 
 
 		 343 aa  81.6  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1978  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  25.68 
 
 		 343 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218747 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2294  MscS mechanosensitive ion channel  25.68 
 
 		 343 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1177  mechanosensitive ion channel  26.6 
 
 		 383 aa  81.3  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1791  small-conductance mechanosensitive channel  35.16 
 
 		 369 aa  80.1  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0722785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1295  MscS mechanosensitive ion channel  30.46 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1848  MscS family hypothetical protein  25.18 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.512359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1786  MscS family inner membrane protein YnaI  25.18 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0416525  normal  0.388102 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1670  MscS family inner membrane protein YnaI  25.18 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.107683 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1788  MscS family inner membrane protein YnaI  25.18 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150216 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1488  MscS family inner membrane protein YnaI  24.82 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.445516  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1076  MscS mechanosensitive ion channel  29.08 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.119695  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2066  MscS mechanosensitive ion channel  27.14 
 
 		 424 aa  73.6  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.838165  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05088  hypothetical protein  28.57 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31666  MscS family transporter: small-conductance mechanosensitive ion channel  24.51 
 
 		 511 aa  68.6  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0383993  normal  0.0629708 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2790  MscS mechanosensitive ion channel  26.15 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.756482  normal  0.557915 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30945  MscS family transporter: small-conductance mechanosensitive ion channel  27.81 
 
 		 473 aa  67.8  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.111123  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  27.89 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  25.58 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0460  putative mechanosensitive ion channel  36.3 
 
 		 357 aa  65.9  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1737  mechanosensitive ion channel family protein  26.19 
 
 		 624 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.64597  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0263  mechanosensitive ion channel family protein  24.22 
 
 		 627 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0289  mechanosensitive ion channel family protein  24.22 
 
 		 627 aa  64.7  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.658149  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0617  MscS mechanosensitive ion channel  28.12 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4048  MscS mechanosensitive ion channel  31.85 
 
 		 569 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138882  normal  0.12233 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001221  small-conductance mechanosensitive channel  35.71 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  26.95 
 
 		 633 aa  63.5  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0236  mechanosensitive ion channel family protein  25.54 
 
 		 627 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  28.95 
 
 		 624 aa  62  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  26 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2740  MscS mechanosensitive ion channel  25.63 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  30.25 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3051  MscS mechanosensitive ion channel  23.89 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0787633 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4873  MscS Mechanosensitive ion channel  34.26 
 
 		 567 aa  60.1  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  31.58 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0635  small mechanosensitive ion channel  26.17 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.352398  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27641  small mechanosensitive ion channel, MscS family protein  27.07 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  25.46 
 
 		 561 aa  59.7  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1900  MscS mechanosensitive ion channel  33.61 
 
 		 240 aa  58.9  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0998935  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  24.76 
 
 		 361 aa  59.3  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0460  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  31.71 
 
 		 280 aa  59.3  0.0000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00313509  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  26.13 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4194  MscS mechanosensitive ion channel  30.71 
 
 		 562 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  30.71 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3256  MscS mechanosensitive ion channel  24.34 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00789281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2981  hypothetical protein  31.19 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0759175  normal  0.0858863 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3016  MscS mechanosensitive ion channel  26.7 
 
 		 426 aa  58.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3397  MscS mechanosensitive ion channel  25.98 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0623  MscS Mechanosensitive ion channel  30.65 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1210  MscS mechanosensitive ion channel  26.28 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  27.13 
 
 		 305 aa  57  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  25.79 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1752  MscS Mechanosensitive ion channel  30.26 
 
 		 356 aa  57  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5106  MscS mechanosensitive ion channel  23.81 
 
 		 292 aa  57  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0140126  decreased coverage  0.0019989 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1578  small-conductance mechanosensitive channel  29.51 
 
 		 534 aa  57  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00006998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2355  MscS mechanosensitive ion channel  27.13 
 
 		 295 aa  57  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0549147  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  27.11 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  27.08 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  29.07 
 
 		 532 aa  56.2  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03115  MscS Mechanosensitive ion channel  32.43 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0910  MscS mechanosensitive ion channel  25.5 
 
 		 400 aa  56.2  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505459  normal  0.0192096 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  22.38 
 
 		 283 aa  56.2  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1409  MscS mechanosensitive ion channel  25.35 
 
 		 351 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1153  MscS Mechanosensitive ion channel  35.16 
 
 		 352 aa  55.8  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1267  MscS mechanosensitive ion channel  25.91 
 
 		 351 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1943  MscS mechanosensitive ion channel  31.78 
 
 		 533 aa  56.2  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000658199  decreased coverage  0.00758396 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  31.62 
 
 		 286 aa  56.2  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.461855 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1124  MscS Mechanosensitive ion channel  24.52 
 
 		 345 aa  55.8  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.745547  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  26.06 
 
 		 305 aa  55.1  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0689  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 351 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.13803  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2594  MscS mechanosensitive ion channel  24.06 
 
 		 388 aa  55.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  25.93 
 
 		 479 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1277  MscS mechanosensitive ion channel  26.02 
 
 		 352 aa  55.5  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  30.95 
 
 		 362 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  28.23 
 
 		 682 aa  54.7  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0661  MscS Mechanosensitive ion channel  27.31 
 
 		 295 aa  54.3  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1352  MscS mechanosensitive ion channel  26.92 
 
 		 376 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.308859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  27.84 
 
 		 285 aa  54.7  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0444  MscS Mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 404 aa  54.3  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  23.5 
 
 		 380 aa  53.9  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  28.36 
 
 		 292 aa  54.3  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2357  hypothetical protein  30 
 
 		 348 aa  53.9  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.116724  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  26.79 
 
 		 864 aa  53.9  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  26.18 
 
 		 287 aa  53.9  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1245  ion channel protein  26.83 
 
 		 261 aa  53.9  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  25.73 
 
 		 369 aa  53.9  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  27.69 
 
 		 807 aa  53.9  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>