More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0460 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0460  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  100 
 
 
280 aa  553  1e-157  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00313509  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1359  MscS mechanosensitive ion channel  31.7 
 
 
275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  28.91 
 
 
275 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0851  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  30.65 
 
 
289 aa  122  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3818  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  30.65 
 
 
289 aa  122  6e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.905722  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0854  MscS mechanosensitive ion channel  30.65 
 
 
289 aa  122  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3397  MscS mechanosensitive ion channel  28.04 
 
 
291 aa  122  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4503  MscS Mechanosensitive ion channel  30.71 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4433  MscS Mechanosensitive ion channel  30.89 
 
 
285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4349  MscS Mechanosensitive ion channel  30.89 
 
 
285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4436  MscS Mechanosensitive ion channel  30.89 
 
 
285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.312478 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  31.2 
 
 
286 aa  118  7.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  28.79 
 
 
280 aa  119  7.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  29.69 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4603  mechanosensitive ion channel family protein  30.53 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  30.12 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  29.28 
 
 
275 aa  117  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  28.93 
 
 
275 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5331  MscS mechanosensitive ion channel  27.55 
 
 
301 aa  116  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  29.66 
 
 
274 aa  116  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3671  MscS mechanosensitive ion channel  27.71 
 
 
277 aa  116  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  30.53 
 
 
275 aa  116  5e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  30.92 
 
 
277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  30.16 
 
 
275 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  30.42 
 
 
274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  31.51 
 
 
291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  30.16 
 
 
275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  30.16 
 
 
275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  30.43 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  27.31 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  29.76 
 
 
275 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5803  Small-conductance mechanosensitive channel  27.9 
 
 
284 aa  113  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  27.51 
 
 
322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  29.37 
 
 
275 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  29.37 
 
 
275 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  28.11 
 
 
270 aa  112  9e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 
275 aa  112  9e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  28.17 
 
 
275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  30.31 
 
 
274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0589  MscS mechanosensitive ion channel  29.21 
 
 
291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  28.41 
 
 
288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  29.48 
 
 
279 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  29.39 
 
 
305 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1199  mechanosensitive ion channel component  27.94 
 
 
281 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000786613  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  29.82 
 
 
305 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  26.52 
 
 
270 aa  109  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0515  MscS Mechanosensitive ion channel  28.06 
 
 
292 aa  108  7.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02189  hypothetical protein  29.69 
 
 
249 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0556  MscS Mechanosensitive ion channel  29.25 
 
 
293 aa  107  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  29.22 
 
 
276 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  30.77 
 
 
286 aa  106  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1245  ion channel protein  28.74 
 
 
261 aa  106  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  27.69 
 
 
274 aa  106  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3896  MscS Mechanosensitive ion channel  29.58 
 
 
283 aa  106  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  30.77 
 
 
286 aa  105  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 
286 aa  105  7e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3942  MscS mechanosensitive ion channel  28.64 
 
 
288 aa  105  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.639966 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  30.77 
 
 
286 aa  105  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  30.77 
 
 
286 aa  105  7e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  30.77 
 
 
286 aa  105  7e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  30.77 
 
 
286 aa  105  7e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  30.77 
 
 
286 aa  105  7e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  30.77 
 
 
291 aa  105  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3699  MscS Mechanosensitive ion channel  29.58 
 
 
283 aa  105  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  30.52 
 
 
269 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1966  hypothetical protein  29.07 
 
 
268 aa  104  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  29.41 
 
 
287 aa  104  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0204  mechanosensitive ion channel family protein  29.03 
 
 
271 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.171183  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0202  mechanosensitive ion channel family protein  29.03 
 
 
271 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0585  putative small-conductance mechanosensitive channel  26.1 
 
 
277 aa  103  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591532  normal  0.0145572 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0541  MscS mechanosensitive ion channel  30.04 
 
 
273 aa  103  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3337  mechanosensitive channel MscS  31.13 
 
 
284 aa  102  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.306942  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  30.7 
 
 
275 aa  102  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0812  small-conductance mechanosensitive channel  28.35 
 
 
274 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  31.67 
 
 
286 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  31.67 
 
 
286 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  31.67 
 
 
286 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1674  MscS mechanosensitive ion channel  31.47 
 
 
270 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702305  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3375  MscS mechanosensitive ion channel  30.88 
 
 
302 aa  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.190462  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  31.67 
 
 
286 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  31.11 
 
 
286 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  26.34 
 
 
277 aa  99.8  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5651  hypothetical protein  28.45 
 
 
283 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1419  mechanosensitive ion channel family protein  31.08 
 
 
278 aa  98.2  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1034  MscS mechanosensitive ion channel  28.05 
 
 
288 aa  98.2  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  27.4 
 
 
298 aa  98.6  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3256  MscS mechanosensitive ion channel  27.08 
 
 
292 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00789281  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1557  mechanosensitive ion channel family protein  25.59 
 
 
274 aa  97.4  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.172425  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  32.41 
 
 
288 aa  97.4  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5106  MscS mechanosensitive ion channel  27.08 
 
 
292 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0140126  decreased coverage  0.0019989 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65040  hypothetical protein  28.45 
 
 
283 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0222155  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2565  hypothetical protein  25.76 
 
 
283 aa  96.3  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4965  hypothetical protein  28.91 
 
 
278 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1967  MscS Mechanosensitive ion channel  27.35 
 
 
279 aa  95.9  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3394  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 
277 aa  95.9  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00053127  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  30.37 
 
 
276 aa  95.9  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57110  hypothetical protein  28.12 
 
 
278 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0444  MscS Mechanosensitive ion channel  27.24 
 
 
404 aa  94.4  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0661  MscS Mechanosensitive ion channel  28.44 
 
 
295 aa  94.4  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1220  MscS mechanosensitive ion channel  27.4 
 
 
305 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0859387 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>