More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0661 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0661  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 295 aa  581  1.0000000000000001e-165  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  48.13 
 
 		 286 aa  233  3e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.461855 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2000  MscS Mechanosensitive ion channel  43.85 
 
 		 302 aa  218  6e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.03582 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1042  MscS Mechanosensitive ion channel  45.95 
 
 		 310 aa  215  7e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0091  MscS Mechanosensitive ion channel  46.25 
 
 		 297 aa  207  1e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1187  MscS Mechanosensitive ion channel  40.99 
 
 		 305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0250538  hitchhiker  0.00000123969 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0552  MscS Mechanosensitive ion channel  34.36 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1529  MscS Mechanosensitive ion channel  33.91 
 
 		 385 aa  140  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  35.27 
 
 		 389 aa  140  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0767  small-conductance mechanosensitive ion channel  34.89 
 
 		 401 aa  139  7e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.967765  normal  0.366005 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0773  MscS mechanosensitive ion channel  35.25 
 
 		 401 aa  138  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  33.08 
 
 		 406 aa  135  9e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1443  MscS Mechanosensitive ion channel  32.49 
 
 		 311 aa  135  9e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  37.31 
 
 		 408 aa  134  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  32.08 
 
 		 270 aa  133  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  39.88 
 
 		 273 aa  133  3.9999999999999996e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3627  MscS mechanosensitive ion channel  32.14 
 
 		 268 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0663  MscS Mechanosensitive ion channel  36.32 
 
 		 336 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  31.25 
 
 		 356 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  34.26 
 
 		 288 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  35 
 
 		 275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  31.84 
 
 		 429 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5329  mechanosensitive ion channel protein MscS  36.67 
 
 		 331 aa  129  6e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0890  MscS mechanosensitive ion channel  33.58 
 
 		 330 aa  129  8.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2565  hypothetical protein  35.66 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  31.92 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  30.53 
 
 		 275 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2355  MscS mechanosensitive ion channel  36.61 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0549147  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00500  MscS Mechanosensitive ion channel  28.85 
 
 		 334 aa  123  4e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  29.77 
 
 		 276 aa  122  6e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  32.76 
 
 		 360 aa  122  7e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  31.58 
 
 		 360 aa  122  8e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  36.32 
 
 		 298 aa  122  8e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  33.33 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  30.98 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1417  MscS Mechanosensitive ion channel  35.85 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  36.02 
 
 		 274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 277 aa  120  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1189  MscS Mechanosensitive ion channel  31.75 
 
 		 445 aa  120  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1034  MscS mechanosensitive ion channel  39.89 
 
 		 288 aa  120  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  31.37 
 
 		 359 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  32.83 
 
 		 274 aa  120  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  34.72 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0444  MscS Mechanosensitive ion channel  33.61 
 
 		 404 aa  119  4.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  32.17 
 
 		 274 aa  119  7e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  34.21 
 
 		 414 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  34.63 
 
 		 364 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  32.13 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  30.62 
 
 		 274 aa  117  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  33.2 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0452  MscS mechanosensitive ion channel  36.98 
 
 		 283 aa  117  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00426986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  28.62 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01752  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  33.72 
 
 		 328 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249612  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  31.06 
 
 		 269 aa  116  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  30.19 
 
 		 274 aa  116  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  32.11 
 
 		 288 aa  115  6e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 400 aa  115  7.999999999999999e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  28.68 
 
 		 362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  31.15 
 
 		 275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  30.04 
 
 		 360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  30.2 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  31.31 
 
 		 843 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02189  hypothetical protein  30.42 
 
 		 249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0812  small-conductance mechanosensitive channel  31.09 
 
 		 274 aa  113  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1359  MscS mechanosensitive ion channel  31.05 
 
 		 275 aa  114  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  34.72 
 
 		 287 aa  114  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  32.52 
 
 		 561 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  34.48 
 
 		 362 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0057  MscS Mechanosensitive ion channel  37.02 
 
 		 421 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.185804  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  31.37 
 
 		 341 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 393 aa  113  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  30.98 
 
 		 275 aa  113  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  32.13 
 
 		 292 aa  113  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3910  hypothetical protein  29.92 
 
 		 301 aa  112  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0589  MscS mechanosensitive ion channel  38.8 
 
 		 291 aa  112  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4603  mechanosensitive ion channel family protein  30.26 
 
 		 275 aa  112  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  29.8 
 
 		 275 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0569  MscS Mechanosensitive ion channel  31.4 
 
 		 280 aa  112  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912877  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  31.56 
 
 		 275 aa  112  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  31.56 
 
 		 275 aa  112  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0308  MscS mechanosensitive ion channel  30.58 
 
 		 459 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  28.67 
 
 		 287 aa  112  9e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  32.31 
 
 		 275 aa  112  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  29.41 
 
 		 288 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  30.38 
 
 		 276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1584  MscS mechanosensitive ion channel  33.88 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00518641  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  31.58 
 
 		 844 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  31.28 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1353  MscS mechanosensitive ion channel  35.58 
 
 		 282 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.512703  normal  0.132094 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0960  MscS mechanosensitive ion channel  36.2 
 
 		 280 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4371  MscS mechanosensitive ion channel  35.58 
 
 		 280 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.053495 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2641  MscS Mechanosensitive ion channel  27.53 
 
 		 280 aa  109  7.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  27.91 
 
 		 311 aa  108  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2771  MscS Mechanosensitive ion channel  30.14 
 
 		 296 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  30.74 
 
 		 275 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4496  MscS mechanosensitive ion channel  35.58 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.737667  normal  0.727724 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 843 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0407  MscS mechanosensitive ion channel  33.02 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.323817  normal  0.0164618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>