More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1933 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1933  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 358 aa  705    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2136  MscS Mechanosensitive ion channel  66.46 
 
 		 349 aa  434  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2114  MscS Mechanosensitive ion channel  52.44 
 
 		 361 aa  377  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0292  hypothetical protein  50.14 
 
 		 360 aa  356  2.9999999999999997e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.40096  hitchhiker  0.00233312 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2268  MscS mechanosensitive ion channel  51.22 
 
 		 362 aa  351  1e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.528739  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2539  MscS Mechanosensitive ion channel  50.42 
 
 		 360 aa  331  1e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.984511  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1009  small-conductance mechanosensitive channel  54.01 
 
 		 331 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0247  hypothetical protein  47 
 
 		 361 aa  322  9.000000000000001e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2257  small-conductance mechanosensitive ion channel  53.56 
 
 		 407 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0990371  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2855  MscS mechanosensitive ion channel  50.35 
 
 		 374 aa  299  4e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154936 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2160  mechanosensitive ion channel family protein  55.47 
 
 		 394 aa  299  5e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1797  MscS mechanosensitive ion channel  49.36 
 
 		 390 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.986921 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5188  MscS mechanosensitive ion channel  53.56 
 
 		 390 aa  295  8e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6191  MscS mechanosensitive ion channel  53.56 
 
 		 390 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.593763  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1911  MscS mechanosensitive ion channel  53.56 
 
 		 390 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801877 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1888  MscS mechanosensitive ion channel  53.56 
 
 		 390 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1825  MscS mechanosensitive ion channel  49.04 
 
 		 390 aa  295  9e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0903923  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3394  mechanosensitive ion channel family protein  55.08 
 
 		 395 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1910  mechanosensitive ion channel family protein  55.08 
 
 		 395 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2314  mechanosensitive ion channel family protein  55.08 
 
 		 395 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557878  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1419  mechanosensitive ion channel family protein  55.08 
 
 		 395 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1945  MscS Mechanosensitive ion channel  52.81 
 
 		 407 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.415325  normal  0.454872 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2436  mechanosensitive ion channel family protein  55.08 
 
 		 395 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1183  mechanosensitive ion channel family protein  55.08 
 
 		 395 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2275  mechanosensitive ion channel family protein  55.08 
 
 		 395 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1386  MscS mechanosensitive ion channel  53.56 
 
 		 391 aa  293  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3749  Small-conductance mechanosensitive ion channel  45.91 
 
 		 380 aa  291  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1121  MscS mechanosensitive ion channel  47.06 
 
 		 374 aa  286  4e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0118  MscS Mechanosensitive ion channel  54.96 
 
 		 358 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.472344 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3905  MscS mechanosensitive ion channel  48.63 
 
 		 373 aa  281  1e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5044  mechanosensitive ion channel protein  47.39 
 
 		 357 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02550  membrane protein  49.63 
 
 		 375 aa  281  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.290793  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2760  MscS Mechanosensitive ion channel  44.37 
 
 		 359 aa  279  4e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3654  MscS mechanosensitive ion channel  50.57 
 
 		 393 aa  277  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3568  MscS Mechanosensitive ion channel  48.53 
 
 		 353 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.492229  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4345  MscS mechanosensitive ion channel  47.71 
 
 		 361 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3947  MscS Mechanosensitive ion channel  50.57 
 
 		 393 aa  276  5e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0285178  normal  0.460909 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3940  MscS Mechanosensitive ion channel  50.19 
 
 		 393 aa  275  8e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1241  mechanosensitive ion channel family protein  52.51 
 
 		 362 aa  273  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0785  MscS Mechanosensitive ion channel  51.54 
 
 		 395 aa  273  3e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0017606  normal  0.0299135 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0235  MscS mechanosensitive ion channel  49.64 
 
 		 368 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2062  MscS mechanosensitive ion channel  44.04 
 
 		 352 aa  272  6e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2275  MscS mechanosensitive ion channel  44.97 
 
 		 376 aa  268  8e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.312032  normal  0.0129381 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0914  MscS mechanosensitive ion channel  41.23 
 
 		 411 aa  266  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0415  small-conductance mechanosensitive channel  44.49 
 
 		 371 aa  262  6e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.344204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33880  small-conductance mechanosensitive channel  48.89 
 
 		 727 aa  258  1e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.415466  normal  0.49587 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3972  MscS Mechanosensitive ion channel  45.59 
 
 		 363 aa  256  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0682489  normal  0.528998 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3703  MscS mechanosensitive ion channel  44.79 
 
 		 373 aa  254  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0936689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1046  MscS mechanosensitive ion channel  43.48 
 
 		 398 aa  252  8.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0838  MscS Mechanosensitive ion channel  44.52 
 
 		 374 aa  252  8.000000000000001e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0017  MscS Mechanosensitive ion channel  40.6 
 
 		 392 aa  252  8.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.305748 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0636  MscS mechanosensitive ion channel  50.64 
 
 		 364 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1758  MscS mechanosensitive ion channel  43.14 
 
 		 399 aa  239  8e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.010572 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0178  MscS mechanosensitive ion channel  49.61 
 
 		 545 aa  238  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.760917 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6267  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  40.83 
 
 		 365 aa  236  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2302  MscS mechanosensitive ion channel  40.2 
 
 		 399 aa  235  8e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.47196 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2263  MscS mechanosensitive ion channel  39.93 
 
 		 402 aa  235  8e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2310  MscS mechanosensitive ion channel  40.2 
 
 		 399 aa  235  8e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5934  MscS Mechanosensitive ion channel  36.13 
 
 		 378 aa  235  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3570  MscS mechanosensitive ion channel  45.08 
 
 		 368 aa  233  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6211  MscS Mechanosensitive ion channel  48.6 
 
 		 391 aa  231  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2022  small-conductance mechanosensitive channel  41.95 
 
 		 379 aa  230  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6897  MscS mechanosensitive ion channel  43.15 
 
 		 492 aa  226  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1771  MscS mechanosensitive ion channel  43.68 
 
 		 400 aa  227  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5784  MscS mechanosensitive ion channel  41.45 
 
 		 394 aa  226  4e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1861  MscS Mechanosensitive ion channel  41.57 
 
 		 402 aa  222  8e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3015  MscS Mechanosensitive ion channel  36.34 
 
 		 379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10518  MscS Mechanosensitive ion channel  40.65 
 
 		 591 aa  217  2.9999999999999998e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.526339  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2161  MscS Mechanosensitive ion channel  39.1 
 
 		 365 aa  212  9e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1004  MscS mechanosensitive ion channel  35.96 
 
 		 648 aa  196  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1203  MscS Mechanosensitive ion channel  49.35 
 
 		 372 aa  196  7e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.950573  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1262  MscS mechanosensitive ion channel  33.88 
 
 		 627 aa  192  1e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.523793  normal  0.0747451 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0783  MscS mechanosensitive ion channel  29.65 
 
 		 571 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2527  MscS mechanosensitive ion channel  31.6 
 
 		 566 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.131998  normal  0.145786 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1010  MscS mechanosensitive ion channel  31.61 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.926579  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  31.72 
 
 		 307 aa  105  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0227  MscS mechanosensitive ion channel  29.81 
 
 		 268 aa  104  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  28.71 
 
 		 351 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5898  MscS Mechanosensitive ion channel  36.36 
 
 		 268 aa  89.7  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2627  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 278 aa  75.5  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.159228  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  32.2 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  28.82 
 
 		 806 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  24.51 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0887  MscS mechanosensitive ion channel  24.69 
 
 		 431 aa  69.3  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0881194  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0941  MscS mechanosensitive ion channel  24.46 
 
 		 467 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884334  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0579  MscS mechanosensitive ion channel  26.88 
 
 		 440 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0872803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  32.86 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  28.78 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1411  MscS Mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1688  MscS mechanosensitive ion channel  31.79 
 
 		 719 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.265093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  24.02 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.940167  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0938  MscS Mechanosensitive ion channel  24.02 
 
 		 433 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.466834  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7380  mechanosensitive ion channel protein  29.68 
 
 		 439 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1352  MscS mechanosensitive ion channel  26.18 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.308859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  28.35 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  26.99 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  29.92 
 
 		 533 aa  63.9  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0156  MscS mechanosensitive ion channel  26.7 
 
 		 437 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0421972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  31.13 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  29.92 
 
 		 551 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>