256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0783 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0783  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 571 aa  1157    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10518  MscS Mechanosensitive ion channel  27.87 
 
 		 591 aa  251  2e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.526339  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2527  MscS mechanosensitive ion channel  31.44 
 
 		 566 aa  234  5e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.131998  normal  0.145786 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1262  MscS mechanosensitive ion channel  27.44 
 
 		 627 aa  229  7e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.523793  normal  0.0747451 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1004  MscS mechanosensitive ion channel  26.07 
 
 		 648 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1933  MscS Mechanosensitive ion channel  29.65 
 
 		 358 aa  141  3e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0118  MscS Mechanosensitive ion channel  32.48 
 
 		 358 aa  124  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.472344 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2160  mechanosensitive ion channel family protein  30.04 
 
 		 394 aa  124  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2275  mechanosensitive ion channel family protein  29.6 
 
 		 395 aa  124  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1419  mechanosensitive ion channel family protein  29.6 
 
 		 395 aa  123  8e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2436  mechanosensitive ion channel family protein  29.6 
 
 		 395 aa  123  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2314  mechanosensitive ion channel family protein  29.6 
 
 		 395 aa  123  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557878  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1183  mechanosensitive ion channel family protein  29.6 
 
 		 395 aa  123  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1910  mechanosensitive ion channel family protein  29.6 
 
 		 395 aa  123  8e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3394  mechanosensitive ion channel family protein  29.6 
 
 		 395 aa  123  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5934  MscS Mechanosensitive ion channel  32.08 
 
 		 378 aa  123  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0838  MscS Mechanosensitive ion channel  30.34 
 
 		 374 aa  123  9e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5044  mechanosensitive ion channel protein  28.57 
 
 		 357 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1945  MscS Mechanosensitive ion channel  30.74 
 
 		 407 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.415325  normal  0.454872 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1241  mechanosensitive ion channel family protein  29.68 
 
 		 362 aa  121  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2257  small-conductance mechanosensitive ion channel  31 
 
 		 407 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0990371  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2022  small-conductance mechanosensitive channel  28.87 
 
 		 379 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1009  small-conductance mechanosensitive channel  30.41 
 
 		 331 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2855  MscS mechanosensitive ion channel  29.21 
 
 		 374 aa  119  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3568  MscS Mechanosensitive ion channel  30.22 
 
 		 353 aa  117  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.492229  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2268  MscS mechanosensitive ion channel  30.42 
 
 		 362 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.528739  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0017  MscS Mechanosensitive ion channel  28.52 
 
 		 392 aa  117  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.305748 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2263  MscS mechanosensitive ion channel  28.42 
 
 		 402 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2310  MscS mechanosensitive ion channel  28.42 
 
 		 399 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2302  MscS mechanosensitive ion channel  28.42 
 
 		 399 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.47196 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2275  MscS mechanosensitive ion channel  26.96 
 
 		 376 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.312032  normal  0.0129381 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4345  MscS mechanosensitive ion channel  27.83 
 
 		 361 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3940  MscS Mechanosensitive ion channel  27.73 
 
 		 393 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5188  MscS mechanosensitive ion channel  28.75 
 
 		 390 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3703  MscS mechanosensitive ion channel  30.36 
 
 		 373 aa  116  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0936689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2136  MscS Mechanosensitive ion channel  27.31 
 
 		 349 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1386  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0785  MscS Mechanosensitive ion channel  27.84 
 
 		 395 aa  115  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0017606  normal  0.0299135 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3654  MscS mechanosensitive ion channel  26.96 
 
 		 393 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2760  MscS Mechanosensitive ion channel  30.13 
 
 		 359 aa  115  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1911  MscS mechanosensitive ion channel  29.13 
 
 		 390 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801877 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6191  MscS mechanosensitive ion channel  29.13 
 
 		 390 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.593763  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1888  MscS mechanosensitive ion channel  29.13 
 
 		 390 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1797  MscS mechanosensitive ion channel  27.54 
 
 		 390 aa  114  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.986921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1861  MscS Mechanosensitive ion channel  30.8 
 
 		 402 aa  113  7.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3905  MscS mechanosensitive ion channel  25.99 
 
 		 373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6267  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  31.31 
 
 		 365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1825  MscS mechanosensitive ion channel  27.54 
 
 		 390 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0903923  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1121  MscS mechanosensitive ion channel  28.03 
 
 		 374 aa  110  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3947  MscS Mechanosensitive ion channel  26.03 
 
 		 393 aa  111  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0285178  normal  0.460909 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2539  MscS Mechanosensitive ion channel  27.5 
 
 		 360 aa  110  7.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.984511  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1758  MscS mechanosensitive ion channel  28.79 
 
 		 399 aa  110  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.010572 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3015  MscS Mechanosensitive ion channel  26.14 
 
 		 379 aa  110  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33880  small-conductance mechanosensitive channel  28.71 
 
 		 727 aa  109  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.415466  normal  0.49587 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0292  hypothetical protein  29.49 
 
 		 360 aa  110  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.40096  hitchhiker  0.00233312 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0636  MscS mechanosensitive ion channel  27.45 
 
 		 364 aa  109  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0914  MscS mechanosensitive ion channel  26.25 
 
 		 411 aa  109  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1046  MscS mechanosensitive ion channel  28.34 
 
 		 398 aa  110  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0415  small-conductance mechanosensitive channel  26.62 
 
 		 371 aa  109  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.344204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0247  hypothetical protein  29.63 
 
 		 361 aa  108  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2062  MscS mechanosensitive ion channel  34.2 
 
 		 352 aa  108  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3749  Small-conductance mechanosensitive ion channel  27.99 
 
 		 380 aa  106  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2161  MscS Mechanosensitive ion channel  26.95 
 
 		 365 aa  106  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2114  MscS Mechanosensitive ion channel  27.48 
 
 		 361 aa  106  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0235  MscS mechanosensitive ion channel  26.94 
 
 		 368 aa  105  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5784  MscS mechanosensitive ion channel  28.44 
 
 		 394 aa  103  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0178  MscS mechanosensitive ion channel  27.64 
 
 		 545 aa  102  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.760917 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02550  membrane protein  26.83 
 
 		 375 aa  101  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.290793  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3972  MscS Mechanosensitive ion channel  27.18 
 
 		 363 aa  99.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0682489  normal  0.528998 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1771  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 400 aa  99.4  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3570  MscS mechanosensitive ion channel  26.75 
 
 		 368 aa  95.1  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1203  MscS Mechanosensitive ion channel  34.04 
 
 		 372 aa  94.4  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.950573  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6897  MscS mechanosensitive ion channel  26.38 
 
 		 492 aa  91.7  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6211  MscS Mechanosensitive ion channel  26.43 
 
 		 391 aa  83.6  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0969  mechanosensitive ion channel family protein  23.75 
 
 		 554 aa  82.8  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  23.74 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1010  MscS mechanosensitive ion channel  31.2 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.926579  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0227  MscS mechanosensitive ion channel  23.31 
 
 		 268 aa  75.5  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1650  MscS mechanosensitive ion channel  23.35 
 
 		 570 aa  70.9  0.00000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4873  MscS Mechanosensitive ion channel  22.42 
 
 		 567 aa  70.1  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4048  MscS mechanosensitive ion channel  21.28 
 
 		 569 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138882  normal  0.12233 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4194  MscS mechanosensitive ion channel  21.29 
 
 		 562 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1446  MscS mechanosensitive ion channel  22.83 
 
 		 648 aa  66.6  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.770596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5898  MscS Mechanosensitive ion channel  27.14 
 
 		 268 aa  65.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0970  small-conductance mechanosensitive ion channel  22.61 
 
 		 650 aa  65.1  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371389 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2627  MscS mechanosensitive ion channel  27.65 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.159228  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  21.66 
 
 		 351 aa  63.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0786  MscS Mechanosensitive ion channel  24.1 
 
 		 840 aa  61.6  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0857  MscS mechanosensitive ion channel  24.1 
 
 		 840 aa  61.6  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2145  MscS mechanosensitive ion channel  23.1 
 
 		 537 aa  60.8  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000018711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1578  small-conductance mechanosensitive channel  21.52 
 
 		 534 aa  60.8  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00006998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  28.99 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1320  MscS Mechanosensitive ion channel  27.59 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  26.06 
 
 		 341 aa  57  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1943  MscS mechanosensitive ion channel  21.69 
 
 		 533 aa  57  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000658199  decreased coverage  0.00758396 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  20.7 
 
 		 362 aa  55.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4139  MscS Mechanosensitive ion channel  26.36 
 
 		 815 aa  56.2  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2389  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 429 aa  55.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  28.08 
 
 		 637 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  25.41 
 
 		 322 aa  55.5  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>