More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2161 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2161  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 365 aa  736    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2263  MscS mechanosensitive ion channel  39.44 
 
 		 402 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2302  MscS mechanosensitive ion channel  39.44 
 
 		 399 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.47196 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0914  MscS mechanosensitive ion channel  38.5 
 
 		 411 aa  240  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2310  MscS mechanosensitive ion channel  39.44 
 
 		 399 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1758  MscS mechanosensitive ion channel  42.03 
 
 		 399 aa  236  6e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.010572 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33880  small-conductance mechanosensitive channel  43.99 
 
 		 727 aa  232  8.000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.415466  normal  0.49587 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1771  MscS mechanosensitive ion channel  45.52 
 
 		 400 aa  229  4e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4345  MscS mechanosensitive ion channel  39.01 
 
 		 361 aa  229  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1046  MscS mechanosensitive ion channel  38.64 
 
 		 398 aa  227  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1009  small-conductance mechanosensitive channel  44.62 
 
 		 331 aa  226  4e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3394  mechanosensitive ion channel family protein  47.45 
 
 		 395 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1419  mechanosensitive ion channel family protein  47.45 
 
 		 395 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2436  mechanosensitive ion channel family protein  47.45 
 
 		 395 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1910  mechanosensitive ion channel family protein  47.45 
 
 		 395 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1183  mechanosensitive ion channel family protein  47.45 
 
 		 395 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2314  mechanosensitive ion channel family protein  47.45 
 
 		 395 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557878  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2275  mechanosensitive ion channel family protein  47.45 
 
 		 395 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2160  mechanosensitive ion channel family protein  45.85 
 
 		 394 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2114  MscS Mechanosensitive ion channel  37.66 
 
 		 361 aa  222  7e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0178  MscS mechanosensitive ion channel  39.68 
 
 		 545 aa  222  8e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.760917 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1797  MscS mechanosensitive ion channel  47.18 
 
 		 390 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.986921 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1825  MscS mechanosensitive ion channel  47.18 
 
 		 390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0903923  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1386  MscS mechanosensitive ion channel  44.11 
 
 		 391 aa  220  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1911  MscS mechanosensitive ion channel  47.18 
 
 		 390 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801877 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5044  mechanosensitive ion channel protein  39.17 
 
 		 357 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6191  MscS mechanosensitive ion channel  47.18 
 
 		 390 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.593763  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1888  MscS mechanosensitive ion channel  47.18 
 
 		 390 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6267  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  47.83 
 
 		 365 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3568  MscS Mechanosensitive ion channel  37.54 
 
 		 353 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.492229  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0838  MscS Mechanosensitive ion channel  37.61 
 
 		 374 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5784  MscS mechanosensitive ion channel  41 
 
 		 394 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5188  MscS mechanosensitive ion channel  46.37 
 
 		 390 aa  216  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2022  small-conductance mechanosensitive channel  33.8 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6897  MscS mechanosensitive ion channel  39.37 
 
 		 492 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0415  small-conductance mechanosensitive channel  41.04 
 
 		 371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.344204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2136  MscS Mechanosensitive ion channel  40.27 
 
 		 349 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3654  MscS mechanosensitive ion channel  37.35 
 
 		 393 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1933  MscS Mechanosensitive ion channel  39.1 
 
 		 358 aa  212  9e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3947  MscS Mechanosensitive ion channel  37.35 
 
 		 393 aa  212  9e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0285178  normal  0.460909 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0118  MscS Mechanosensitive ion channel  42.75 
 
 		 358 aa  212  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.472344 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6211  MscS Mechanosensitive ion channel  40.97 
 
 		 391 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1241  mechanosensitive ion channel family protein  46.49 
 
 		 362 aa  210  3e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2275  MscS mechanosensitive ion channel  40.68 
 
 		 376 aa  210  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.312032  normal  0.0129381 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1945  MscS Mechanosensitive ion channel  46.96 
 
 		 407 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.415325  normal  0.454872 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2257  small-conductance mechanosensitive ion channel  46.96 
 
 		 407 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0990371  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2062  MscS mechanosensitive ion channel  40.15 
 
 		 352 aa  207  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3940  MscS Mechanosensitive ion channel  40.75 
 
 		 393 aa  205  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0636  MscS mechanosensitive ion channel  43.75 
 
 		 364 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3749  Small-conductance mechanosensitive ion channel  39.64 
 
 		 380 aa  203  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0292  hypothetical protein  41.29 
 
 		 360 aa  203  3e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.40096  hitchhiker  0.00233312 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2760  MscS Mechanosensitive ion channel  36.72 
 
 		 359 aa  203  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3905  MscS mechanosensitive ion channel  37.91 
 
 		 373 aa  202  6e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1203  MscS Mechanosensitive ion channel  47.43 
 
 		 372 aa  202  9e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.950573  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0785  MscS Mechanosensitive ion channel  41.38 
 
 		 395 aa  200  3.9999999999999996e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0017606  normal  0.0299135 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1121  MscS mechanosensitive ion channel  34.88 
 
 		 374 aa  199  9e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2855  MscS mechanosensitive ion channel  44.5 
 
 		 374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154936 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2268  MscS mechanosensitive ion channel  40.84 
 
 		 362 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.528739  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5934  MscS Mechanosensitive ion channel  33.63 
 
 		 378 aa  197  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02550  membrane protein  39.47 
 
 		 375 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.290793  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3570  MscS mechanosensitive ion channel  42.8 
 
 		 368 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0247  hypothetical protein  37.27 
 
 		 361 aa  195  1e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3015  MscS Mechanosensitive ion channel  36.05 
 
 		 379 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3703  MscS mechanosensitive ion channel  43.38 
 
 		 373 aa  192  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0936689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2539  MscS Mechanosensitive ion channel  35.22 
 
 		 360 aa  189  5e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.984511  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0017  MscS Mechanosensitive ion channel  35.47 
 
 		 392 aa  182  9.000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.305748 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0235  MscS mechanosensitive ion channel  38.37 
 
 		 368 aa  177  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3972  MscS Mechanosensitive ion channel  35.93 
 
 		 363 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0682489  normal  0.528998 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1861  MscS Mechanosensitive ion channel  32.8 
 
 		 402 aa  146  6e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10518  MscS Mechanosensitive ion channel  34.82 
 
 		 591 aa  144  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.526339  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1004  MscS mechanosensitive ion channel  30.08 
 
 		 648 aa  134  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1262  MscS mechanosensitive ion channel  27.41 
 
 		 627 aa  122  7e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.523793  normal  0.0747451 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  31.71 
 
 		 351 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0783  MscS mechanosensitive ion channel  26.95 
 
 		 571 aa  105  9e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  30.24 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0227  MscS mechanosensitive ion channel  26.38 
 
 		 268 aa  98.2  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2527  MscS mechanosensitive ion channel  28.18 
 
 		 566 aa  96.3  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.131998  normal  0.145786 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1010  MscS mechanosensitive ion channel  40.43 
 
 		 308 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.926579  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5898  MscS Mechanosensitive ion channel  33.76 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  29.38 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13183  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  33.78 
 
 		 316 aa  72.4  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1801  MscS Mechanosensitive ion channel  29.74 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  36.79 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  32.02 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  32.35 
 
 		 981 aa  69.7  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  35.34 
 
 		 360 aa  69.3  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  32.17 
 
 		 864 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  35.34 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  28.12 
 
 		 279 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  29.17 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0014  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01752  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  28.68 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249612  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  25.81 
 
 		 304 aa  67  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  25.77 
 
 		 843 aa  66.2  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  30.58 
 
 		 806 aa  66.2  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2627  MscS mechanosensitive ion channel  27.07 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.159228  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0571  MscS Mechanosensitive ion channel  26.96 
 
 		 260 aa  65.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000639441  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  32 
 
 		 795 aa  65.5  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0104  MscS mechanosensitive ion channel  30.22 
 
 		 278 aa  65.9  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00989653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>