More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1758 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1771  MscS mechanosensitive ion channel  91.5 
 
 
400 aa  676    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1758  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 
399 aa  778    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.010572 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0914  MscS mechanosensitive ion channel  44.8 
 
 
411 aa  346  3e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6211  MscS Mechanosensitive ion channel  53.13 
 
 
391 aa  340  2e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6897  MscS mechanosensitive ion channel  48.81 
 
 
492 aa  335  1e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587185  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33880  small-conductance mechanosensitive channel  52.19 
 
 
727 aa  330  2e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.415466  normal  0.49587 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0178  MscS mechanosensitive ion channel  50.59 
 
 
545 aa  323  3e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.760917 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1046  MscS mechanosensitive ion channel  51.75 
 
 
398 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2302  MscS mechanosensitive ion channel  46.7 
 
 
399 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.47196 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2310  MscS mechanosensitive ion channel  46.7 
 
 
399 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2263  MscS mechanosensitive ion channel  46.7 
 
 
402 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5784  MscS mechanosensitive ion channel  45.9 
 
 
394 aa  282  9e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2022  small-conductance mechanosensitive channel  40.74 
 
 
379 aa  271  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1009  small-conductance mechanosensitive channel  50.18 
 
 
331 aa  270  4e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6267  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  52.47 
 
 
365 aa  260  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5044  mechanosensitive ion channel protein  46.24 
 
 
357 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1933  MscS Mechanosensitive ion channel  45.13 
 
 
358 aa  257  2e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2760  MscS Mechanosensitive ion channel  42.75 
 
 
359 aa  256  5e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2160  mechanosensitive ion channel family protein  42.25 
 
 
394 aa  256  6e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1386  MscS mechanosensitive ion channel  41 
 
 
391 aa  256  6e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155035  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02550  membrane protein  46.44 
 
 
375 aa  255  9e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.290793  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2161  MscS Mechanosensitive ion channel  42.03 
 
 
365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307461  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1797  MscS mechanosensitive ion channel  40.28 
 
 
390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.986921 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5188  MscS mechanosensitive ion channel  40.44 
 
 
390 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3015  MscS Mechanosensitive ion channel  47.23 
 
 
379 aa  253  5.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1825  MscS mechanosensitive ion channel  40.28 
 
 
390 aa  253  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0903923  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2257  small-conductance mechanosensitive ion channel  40.27 
 
 
407 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0990371  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6191  MscS mechanosensitive ion channel  40.64 
 
 
390 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.593763  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1911  MscS mechanosensitive ion channel  40.64 
 
 
390 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00801877 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1888  MscS mechanosensitive ion channel  40.64 
 
 
390 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0292  hypothetical protein  43.64 
 
 
360 aa  247  3e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.40096  hitchhiker  0.00233312 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2275  mechanosensitive ion channel family protein  41.97 
 
 
395 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3568  MscS Mechanosensitive ion channel  41.26 
 
 
353 aa  246  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.492229  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1183  mechanosensitive ion channel family protein  41.69 
 
 
395 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1419  mechanosensitive ion channel family protein  41.69 
 
 
395 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2436  mechanosensitive ion channel family protein  41.69 
 
 
395 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2062  MscS mechanosensitive ion channel  46.62 
 
 
352 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2855  MscS mechanosensitive ion channel  41.12 
 
 
374 aa  244  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.154936 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1910  mechanosensitive ion channel family protein  41.69 
 
 
395 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2314  mechanosensitive ion channel family protein  41.69 
 
 
395 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557878  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3394  mechanosensitive ion channel family protein  41.69 
 
 
395 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1945  MscS Mechanosensitive ion channel  39.62 
 
 
407 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.415325  normal  0.454872 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3654  MscS mechanosensitive ion channel  37.94 
 
 
393 aa  243  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4345  MscS mechanosensitive ion channel  40.32 
 
 
361 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0415  small-conductance mechanosensitive channel  37.07 
 
 
371 aa  242  7e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.344204  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2136  MscS Mechanosensitive ion channel  45.38 
 
 
349 aa  242  7.999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3947  MscS Mechanosensitive ion channel  37.94 
 
 
393 aa  242  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0285178  normal  0.460909 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2268  MscS mechanosensitive ion channel  43.07 
 
 
362 aa  241  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.528739  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0785  MscS Mechanosensitive ion channel  41.67 
 
 
395 aa  240  2.9999999999999997e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0017606  normal  0.0299135 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1241  mechanosensitive ion channel family protein  41.36 
 
 
362 aa  239  5e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2114  MscS Mechanosensitive ion channel  41.91 
 
 
361 aa  239  5.999999999999999e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0838  MscS Mechanosensitive ion channel  45.63 
 
 
374 aa  239  8e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3940  MscS Mechanosensitive ion channel  41.55 
 
 
393 aa  239  9e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1121  MscS mechanosensitive ion channel  42.81 
 
 
374 aa  236  6e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0118  MscS Mechanosensitive ion channel  46.33 
 
 
358 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.472344 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2275  MscS mechanosensitive ion channel  46.44 
 
 
376 aa  230  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.312032  normal  0.0129381 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0247  hypothetical protein  43.3 
 
 
361 aa  229  7e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3749  Small-conductance mechanosensitive ion channel  39.58 
 
 
380 aa  228  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1203  MscS Mechanosensitive ion channel  47.1 
 
 
372 aa  227  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.950573  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3972  MscS Mechanosensitive ion channel  43.41 
 
 
363 aa  226  6e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0682489  normal  0.528998 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3905  MscS mechanosensitive ion channel  40.48 
 
 
373 aa  225  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2539  MscS Mechanosensitive ion channel  42.64 
 
 
360 aa  224  2e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.984511  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5934  MscS Mechanosensitive ion channel  43.36 
 
 
378 aa  223  4e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3703  MscS mechanosensitive ion channel  44.66 
 
 
373 aa  222  8e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0936689  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0636  MscS mechanosensitive ion channel  46.25 
 
 
364 aa  213  7e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3570  MscS mechanosensitive ion channel  45.61 
 
 
368 aa  206  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0235  MscS mechanosensitive ion channel  36.84 
 
 
368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0017  MscS Mechanosensitive ion channel  35.03 
 
 
392 aa  192  7e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.305748 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10518  MscS Mechanosensitive ion channel  29.6 
 
 
591 aa  175  9.999999999999999e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.526339  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1861  MscS Mechanosensitive ion channel  34.16 
 
 
402 aa  161  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1262  MscS mechanosensitive ion channel  35.19 
 
 
627 aa  155  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.523793  normal  0.0747451 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1004  MscS mechanosensitive ion channel  32.88 
 
 
648 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0783  MscS mechanosensitive ion channel  28.79 
 
 
571 aa  120  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2527  MscS mechanosensitive ion channel  27.14 
 
 
566 aa  101  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.131998  normal  0.145786 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  31.58 
 
 
351 aa  99  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  32.37 
 
 
307 aa  93.6  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1010  MscS mechanosensitive ion channel  28.39 
 
 
308 aa  89.7  7e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.926579  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0227  MscS mechanosensitive ion channel  24.02 
 
 
268 aa  83.6  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  28 
 
 
304 aa  82  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2627  MscS mechanosensitive ion channel  26.35 
 
 
278 aa  72.4  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.159228  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5898  MscS Mechanosensitive ion channel  31.5 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207523  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  39.66 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  29.68 
 
 
806 aa  67  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13183  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  31.25 
 
 
316 aa  67  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0014  MscS Mechanosensitive ion channel  25.17 
 
 
289 aa  66.2  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0332  MscS Mechanosensitive ion channel  25 
 
 
773 aa  65.1  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.323369  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2935  MscS Mechanosensitive ion channel  28.97 
 
 
282 aa  63.5  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.863949  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1457  MscS mechanosensitive ion channel  26.62 
 
 
768 aa  63.2  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0757  MscS mechanosensitive ion channel  25.77 
 
 
479 aa  63.2  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0427  MscS mechanosensitive ion channel  28.21 
 
 
288 aa  62  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0918944  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0082  MscS mechanosensitive ion channel  26.36 
 
 
303 aa  61.6  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0423997  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10253  hypothetical protein  27.91 
 
 
307 aa  60.5  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00229932  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  26.24 
 
 
864 aa  59.7  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  25.9 
 
 
981 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  24.84 
 
 
361 aa  58.5  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  31.15 
 
 
633 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1632  MscS mechanosensitive ion channel  35.29 
 
 
877 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253181  normal  0.172693 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  24.55 
 
 
484 aa  58.5  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1320  MscS Mechanosensitive ion channel  24.5 
 
 
300 aa  57.8  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1247  MscS Mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 
370 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>