More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3940 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3940  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 393 aa  785    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3947  MscS Mechanosensitive ion channel  94.15 
 
 		 393 aa  746    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0285178  normal  0.460909 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3654  MscS mechanosensitive ion channel  93.89 
 
 		 393 aa  745    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1121  MscS mechanosensitive ion channel  80.99 
 
 		 374 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3749  Small-conductance mechanosensitive ion channel  53.39 
 
 		 380 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2855  MscS mechanosensitive ion channel  48.92 
 
 		 374 aa  381  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154936 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3703  MscS mechanosensitive ion channel  57.01 
 
 		 373 aa  359  4e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0936689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3905  MscS mechanosensitive ion channel  52.89 
 
 		 373 aa  331  1e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0017  MscS Mechanosensitive ion channel  44.89 
 
 		 392 aa  309  5e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.305748 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0235  MscS mechanosensitive ion channel  48.74 
 
 		 368 aa  299  6e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2160  mechanosensitive ion channel family protein  53.82 
 
 		 394 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1419  mechanosensitive ion channel family protein  54.02 
 
 		 395 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2436  mechanosensitive ion channel family protein  54.02 
 
 		 395 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1183  mechanosensitive ion channel family protein  54.02 
 
 		 395 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1910  mechanosensitive ion channel family protein  54.02 
 
 		 395 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3394  mechanosensitive ion channel family protein  54.02 
 
 		 395 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2314  mechanosensitive ion channel family protein  54.02 
 
 		 395 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557878  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2275  mechanosensitive ion channel family protein  56.07 
 
 		 395 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1009  small-conductance mechanosensitive channel  47.37 
 
 		 331 aa  280  3e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02550  membrane protein  45.2 
 
 		 375 aa  279  6e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.290793  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1933  MscS Mechanosensitive ion channel  50.19 
 
 		 358 aa  276  7e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5044  mechanosensitive ion channel protein  47.02 
 
 		 357 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2136  MscS Mechanosensitive ion channel  48.85 
 
 		 349 aa  266  5e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2062  MscS mechanosensitive ion channel  53.25 
 
 		 352 aa  266  7e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0785  MscS Mechanosensitive ion channel  44.97 
 
 		 395 aa  265  8e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0017606  normal  0.0299135 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2275  MscS mechanosensitive ion channel  44.98 
 
 		 376 aa  263  3e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.312032  normal  0.0129381 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1241  mechanosensitive ion channel family protein  45 
 
 		 362 aa  262  6e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4345  MscS mechanosensitive ion channel  46.18 
 
 		 361 aa  262  6.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2760  MscS Mechanosensitive ion channel  47.06 
 
 		 359 aa  262  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2257  small-conductance mechanosensitive ion channel  42.56 
 
 		 407 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0990371  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3568  MscS Mechanosensitive ion channel  48.85 
 
 		 353 aa  259  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.492229  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1945  MscS Mechanosensitive ion channel  50 
 
 		 407 aa  259  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.415325  normal  0.454872 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1386  MscS mechanosensitive ion channel  48 
 
 		 391 aa  259  6e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1797  MscS mechanosensitive ion channel  51.85 
 
 		 390 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.986921 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5188  MscS mechanosensitive ion channel  51.44 
 
 		 390 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1911  MscS mechanosensitive ion channel  51.44 
 
 		 390 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801877 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6191  MscS mechanosensitive ion channel  51.44 
 
 		 390 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.593763  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1888  MscS mechanosensitive ion channel  51.44 
 
 		 390 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2268  MscS mechanosensitive ion channel  44.41 
 
 		 362 aa  258  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.528739  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1825  MscS mechanosensitive ion channel  51.44 
 
 		 390 aa  257  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0903923  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2114  MscS Mechanosensitive ion channel  41.06 
 
 		 361 aa  256  5e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0292  hypothetical protein  42.27 
 
 		 360 aa  252  9.000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.40096  hitchhiker  0.00233312 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0914  MscS mechanosensitive ion channel  40.98 
 
 		 411 aa  249  4e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1861  MscS Mechanosensitive ion channel  43.82 
 
 		 402 aa  243  3e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0636  MscS mechanosensitive ion channel  50.42 
 
 		 364 aa  242  7.999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5934  MscS Mechanosensitive ion channel  44.49 
 
 		 378 aa  241  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0838  MscS Mechanosensitive ion channel  40.19 
 
 		 374 aa  241  2e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0247  hypothetical protein  42.21 
 
 		 361 aa  238  1e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0415  small-conductance mechanosensitive channel  37.71 
 
 		 371 aa  238  1e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.344204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3570  MscS mechanosensitive ion channel  48.93 
 
 		 368 aa  237  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1046  MscS mechanosensitive ion channel  42.99 
 
 		 398 aa  235  9e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2539  MscS Mechanosensitive ion channel  42.91 
 
 		 360 aa  235  9e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.984511  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0118  MscS Mechanosensitive ion channel  41.79 
 
 		 358 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.472344 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3972  MscS Mechanosensitive ion channel  37.39 
 
 		 363 aa  233  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0682489  normal  0.528998 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33880  small-conductance mechanosensitive channel  44.4 
 
 		 727 aa  226  8e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.415466  normal  0.49587 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0178  MscS mechanosensitive ion channel  42.9 
 
 		 545 aa  225  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.760917 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1758  MscS mechanosensitive ion channel  41.55 
 
 		 399 aa  224  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.010572 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6897  MscS mechanosensitive ion channel  40.18 
 
 		 492 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1771  MscS mechanosensitive ion channel  38.55 
 
 		 400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6211  MscS Mechanosensitive ion channel  41.49 
 
 		 391 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6267  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  42.75 
 
 		 365 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5784  MscS mechanosensitive ion channel  40.52 
 
 		 394 aa  216  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2302  MscS mechanosensitive ion channel  38.29 
 
 		 399 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.47196 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2310  MscS mechanosensitive ion channel  38.29 
 
 		 399 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2263  MscS mechanosensitive ion channel  38.29 
 
 		 402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2161  MscS Mechanosensitive ion channel  35.84 
 
 		 365 aa  206  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307461  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3015  MscS Mechanosensitive ion channel  32.71 
 
 		 379 aa  196  7e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2022  small-conductance mechanosensitive channel  33.15 
 
 		 379 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1203  MscS Mechanosensitive ion channel  46.98 
 
 		 372 aa  194  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.950573  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10518  MscS Mechanosensitive ion channel  38.79 
 
 		 591 aa  177  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.526339  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1262  MscS mechanosensitive ion channel  34.65 
 
 		 627 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.523793  normal  0.0747451 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1004  MscS mechanosensitive ion channel  35.62 
 
 		 648 aa  161  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0783  MscS mechanosensitive ion channel  27.73 
 
 		 571 aa  116  7.999999999999999e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2527  MscS mechanosensitive ion channel  30.29 
 
 		 566 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.131998  normal  0.145786 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0227  MscS mechanosensitive ion channel  26.99 
 
 		 268 aa  95.5  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  30.25 
 
 		 351 aa  93.2  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1010  MscS mechanosensitive ion channel  30.93 
 
 		 308 aa  91.3  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.926579  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  26.19 
 
 		 307 aa  88.2  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5898  MscS Mechanosensitive ion channel  33.61 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2627  MscS mechanosensitive ion channel  36.79 
 
 		 278 aa  72.8  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.159228  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  26.27 
 
 		 341 aa  67  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1730  MscS Mechanosensitive ion channel  30.07 
 
 		 276 aa  65.9  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.351236  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  35.65 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  25.85 
 
 		 843 aa  62.4  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  32.5 
 
 		 806 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  44.44 
 
 		 279 aa  62.4  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10253  hypothetical protein  26.14 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00229932  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5329  mechanosensitive ion channel protein MscS  33.33 
 
 		 331 aa  62  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0421  hypothetical protein  26.9 
 
 		 1115 aa  61.6  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.693078  hitchhiker  0.0000017841 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  31.1 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2989  Ricin B lectin  24.84 
 
 		 474 aa  61.2  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000129425 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3375  MscS mechanosensitive ion channel  27.32 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.190462  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0890  MscS mechanosensitive ion channel  32.35 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  26.42 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  33.66 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2740  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4603  mechanosensitive ion channel family protein  28.48 
 
 		 275 aa  58.9  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  31.86 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  27.74 
 
 		 356 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2257  MscS mechanosensitive ion channel  36.71 
 
 		 1110 aa  58.9  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>