More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2314 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_2314  mechanosensitive ion channel family protein  100 
 
 		 395 aa  778    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557878  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1419  mechanosensitive ion channel family protein  100 
 
 		 395 aa  778    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2436  mechanosensitive ion channel family protein  100 
 
 		 395 aa  778    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1183  mechanosensitive ion channel family protein  100 
 
 		 395 aa  778    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3394  mechanosensitive ion channel family protein  100 
 
 		 395 aa  778    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2160  mechanosensitive ion channel family protein  93.67 
 
 		 394 aa  690    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2275  mechanosensitive ion channel family protein  99.49 
 
 		 395 aa  775    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1910  mechanosensitive ion channel family protein  100 
 
 		 395 aa  778    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1386  MscS mechanosensitive ion channel  74.1 
 
 		 391 aa  559  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1797  MscS mechanosensitive ion channel  76.36 
 
 		 390 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.986921 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1825  MscS mechanosensitive ion channel  76.1 
 
 		 390 aa  547  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0903923  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2257  small-conductance mechanosensitive ion channel  69.48 
 
 		 407 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0990371  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1945  MscS Mechanosensitive ion channel  69.13 
 
 		 407 aa  531  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.415325  normal  0.454872 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1911  MscS mechanosensitive ion channel  76.73 
 
 		 390 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801877 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6191  MscS mechanosensitive ion channel  76.45 
 
 		 390 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.593763  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1888  MscS mechanosensitive ion channel  76.45 
 
 		 390 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5188  MscS mechanosensitive ion channel  77.07 
 
 		 390 aa  527  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4345  MscS mechanosensitive ion channel  54.76 
 
 		 361 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2062  MscS mechanosensitive ion channel  56.37 
 
 		 352 aa  369  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1241  mechanosensitive ion channel family protein  58.73 
 
 		 362 aa  365  1e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5044  mechanosensitive ion channel protein  53.87 
 
 		 357 aa  365  1e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3568  MscS Mechanosensitive ion channel  54.3 
 
 		 353 aa  359  4e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.492229  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2275  MscS mechanosensitive ion channel  57.1 
 
 		 376 aa  349  5e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.312032  normal  0.0129381 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0636  MscS mechanosensitive ion channel  56.19 
 
 		 364 aa  347  3e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02550  membrane protein  51.8 
 
 		 375 aa  333  2e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.290793  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3570  MscS mechanosensitive ion channel  53.1 
 
 		 368 aa  325  1e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0785  MscS Mechanosensitive ion channel  57.8 
 
 		 395 aa  323  3e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0017606  normal  0.0299135 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1009  small-conductance mechanosensitive channel  54.24 
 
 		 331 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1933  MscS Mechanosensitive ion channel  45.1 
 
 		 358 aa  297  2e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2114  MscS Mechanosensitive ion channel  51.09 
 
 		 361 aa  292  7e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2268  MscS mechanosensitive ion channel  52.38 
 
 		 362 aa  292  7e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.528739  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3905  MscS mechanosensitive ion channel  51.97 
 
 		 373 aa  292  8e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2855  MscS mechanosensitive ion channel  49.83 
 
 		 374 aa  289  6e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154936 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2136  MscS Mechanosensitive ion channel  56.18 
 
 		 349 aa  289  7e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3940  MscS Mechanosensitive ion channel  53.88 
 
 		 393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3654  MscS mechanosensitive ion channel  51.81 
 
 		 393 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3947  MscS Mechanosensitive ion channel  51.81 
 
 		 393 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0285178  normal  0.460909 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0838  MscS Mechanosensitive ion channel  51.82 
 
 		 374 aa  282  9e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1121  MscS mechanosensitive ion channel  55.74 
 
 		 374 aa  277  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0292  hypothetical protein  45.95 
 
 		 360 aa  276  5e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.40096  hitchhiker  0.00233312 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0415  small-conductance mechanosensitive channel  47.83 
 
 		 371 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.344204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3749  Small-conductance mechanosensitive ion channel  52.59 
 
 		 380 aa  263  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2760  MscS Mechanosensitive ion channel  47.1 
 
 		 359 aa  263  6e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0235  MscS mechanosensitive ion channel  57.21 
 
 		 368 aa  261  1e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2539  MscS Mechanosensitive ion channel  49.06 
 
 		 360 aa  260  3e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.984511  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3703  MscS mechanosensitive ion channel  43.11 
 
 		 373 aa  259  5.0000000000000005e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0936689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3972  MscS Mechanosensitive ion channel  40.92 
 
 		 363 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0682489  normal  0.528998 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0017  MscS Mechanosensitive ion channel  41.69 
 
 		 392 aa  251  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.305748 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0247  hypothetical protein  46.88 
 
 		 361 aa  251  2e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0118  MscS Mechanosensitive ion channel  50.2 
 
 		 358 aa  248  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.472344 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33880  small-conductance mechanosensitive channel  47.08 
 
 		 727 aa  245  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.415466  normal  0.49587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6267  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  47.99 
 
 		 365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2022  small-conductance mechanosensitive channel  41.89 
 
 		 379 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1046  MscS mechanosensitive ion channel  46.03 
 
 		 398 aa  237  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0914  MscS mechanosensitive ion channel  44.49 
 
 		 411 aa  237  3e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2302  MscS mechanosensitive ion channel  46.34 
 
 		 399 aa  235  8e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.47196 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2310  MscS mechanosensitive ion channel  46.34 
 
 		 399 aa  235  8e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2263  MscS mechanosensitive ion channel  46.34 
 
 		 402 aa  235  9e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5934  MscS Mechanosensitive ion channel  44.14 
 
 		 378 aa  232  9e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1758  MscS mechanosensitive ion channel  38.99 
 
 		 399 aa  230  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.010572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6211  MscS Mechanosensitive ion channel  42.4 
 
 		 391 aa  230  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0178  MscS mechanosensitive ion channel  42.81 
 
 		 545 aa  229  6e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.760917 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2161  MscS Mechanosensitive ion channel  42.5 
 
 		 365 aa  229  8e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1771  MscS mechanosensitive ion channel  39.6 
 
 		 400 aa  228  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6897  MscS mechanosensitive ion channel  42.03 
 
 		 492 aa  220  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5784  MscS mechanosensitive ion channel  49.42 
 
 		 394 aa  219  8.999999999999998e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1861  MscS Mechanosensitive ion channel  42.12 
 
 		 402 aa  216  7e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3015  MscS Mechanosensitive ion channel  41.8 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10518  MscS Mechanosensitive ion channel  34.03 
 
 		 591 aa  209  9e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.526339  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1203  MscS Mechanosensitive ion channel  46.8 
 
 		 372 aa  189  5e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.950573  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1004  MscS mechanosensitive ion channel  34.21 
 
 		 648 aa  171  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1262  MscS mechanosensitive ion channel  32.22 
 
 		 627 aa  157  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.523793  normal  0.0747451 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0783  MscS mechanosensitive ion channel  28.1 
 
 		 571 aa  126  7e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2527  MscS mechanosensitive ion channel  32.27 
 
 		 566 aa  110  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.131998  normal  0.145786 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  27.34 
 
 		 307 aa  95.5  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0227  MscS mechanosensitive ion channel  28.37 
 
 		 268 aa  94  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  26.12 
 
 		 351 aa  89.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1010  MscS mechanosensitive ion channel  27.31 
 
 		 308 aa  88.2  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.926579  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5898  MscS Mechanosensitive ion channel  32.23 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  26.29 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2627  MscS mechanosensitive ion channel  31.3 
 
 		 278 aa  72.4  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.159228  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0014  MscS Mechanosensitive ion channel  25.78 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  27.65 
 
 		 341 aa  62.4  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0890  MscS mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 330 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  26.98 
 
 		 860 aa  61.6  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  26.19 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2989  Ricin B lectin  27.61 
 
 		 474 aa  60.1  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000129425 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  29.41 
 
 		 806 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0308  MscS mechanosensitive ion channel  24.35 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2555  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 321 aa  58.9  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  27.04 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10253  hypothetical protein  23.53 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00229932  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0663  MscS Mechanosensitive ion channel  29.09 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5329  mechanosensitive ion channel protein MscS  28.18 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2257  MscS mechanosensitive ion channel  37.21 
 
 		 1110 aa  58.2  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371999  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1320  MscS Mechanosensitive ion channel  31.16 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0427  MscS mechanosensitive ion channel  34.94 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0918944  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  24.77 
 
 		 305 aa  57  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0345  hypothetical protein  31.53 
 
 		 1103 aa  56.2  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.742298  unclonable  0.00000473028 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  24.92 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>