More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2985 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  717    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  49.84 
 
 		 307 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0227  MscS mechanosensitive ion channel  35.91 
 
 		 268 aa  188  1e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2627  MscS mechanosensitive ion channel  32.49 
 
 		 278 aa  178  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.159228  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1010  MscS mechanosensitive ion channel  35.42 
 
 		 308 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.926579  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  33.58 
 
 		 304 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  28.62 
 
 		 362 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  29.28 
 
 		 362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  30.16 
 
 		 364 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  29.29 
 
 		 360 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  28.95 
 
 		 359 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  30.82 
 
 		 547 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  30.65 
 
 		 534 aa  119  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  28.93 
 
 		 533 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  28.81 
 
 		 544 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  28.53 
 
 		 547 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  29 
 
 		 538 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  26.3 
 
 		 270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2000  MscS Mechanosensitive ion channel  30.63 
 
 		 302 aa  114  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.03582 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  26.56 
 
 		 366 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  31.86 
 
 		 561 aa  113  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  29.77 
 
 		 563 aa  113  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2161  MscS Mechanosensitive ion channel  31.71 
 
 		 365 aa  113  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  28.52 
 
 		 1144 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  29.13 
 
 		 549 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  29.13 
 
 		 549 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  31.36 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  29.87 
 
 		 532 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  29.13 
 
 		 549 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  33.18 
 
 		 366 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  32.89 
 
 		 540 aa  110  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  28.47 
 
 		 279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  32.33 
 
 		 360 aa  109  6e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  27.76 
 
 		 277 aa  109  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1262  MscS mechanosensitive ion channel  29.06 
 
 		 627 aa  109  9.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.523793  normal  0.0747451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  29.04 
 
 		 550 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  26.58 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  29.03 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  27.71 
 
 		 341 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  30.11 
 
 		 276 aa  108  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1004  MscS mechanosensitive ion channel  29.81 
 
 		 648 aa  108  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  28.95 
 
 		 369 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  29.5 
 
 		 273 aa  107  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  28.72 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  31.87 
 
 		 356 aa  107  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2423  MscS Mechanosensitive ion channel  27.84 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0692547 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1529  MscS Mechanosensitive ion channel  27.49 
 
 		 385 aa  107  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  28.71 
 
 		 551 aa  107  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1034  MscS mechanosensitive ion channel  32.23 
 
 		 288 aa  107  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  28.71 
 
 		 551 aa  107  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0838  MscS Mechanosensitive ion channel  26.98 
 
 		 374 aa  106  5e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6267  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  32.47 
 
 		 365 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  27.33 
 
 		 288 aa  106  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10518  MscS Mechanosensitive ion channel  27.05 
 
 		 591 aa  106  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.526339  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  32.44 
 
 		 200 aa  106  8e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1569  MscS mechanosensitive ion channel  31.02 
 
 		 342 aa  105  9e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.50156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  28.81 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0767  small-conductance mechanosensitive ion channel  33.48 
 
 		 401 aa  104  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.967765  normal  0.366005 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  31.5 
 
 		 360 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0661  MscS Mechanosensitive ion channel  28.46 
 
 		 295 aa  104  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  25.42 
 
 		 275 aa  104  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  34.39 
 
 		 393 aa  104  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  27.07 
 
 		 288 aa  103  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0773  MscS mechanosensitive ion channel  33.03 
 
 		 401 aa  103  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  27.22 
 
 		 305 aa  103  6e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0415  small-conductance mechanosensitive channel  34.44 
 
 		 371 aa  103  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.344204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0091  MscS Mechanosensitive ion channel  32.54 
 
 		 297 aa  102  8e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0589  MscS mechanosensitive ion channel  31.25 
 
 		 291 aa  102  8e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2855  MscS mechanosensitive ion channel  33.54 
 
 		 374 aa  102  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154936 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  29.18 
 
 		 285 aa  102  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  30.71 
 
 		 359 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0663  MscS Mechanosensitive ion channel  26.81 
 
 		 336 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  26.25 
 
 		 270 aa  102  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3172  MscS Mechanosensitive ion channel  27.7 
 
 		 784 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10253  hypothetical protein  34.48 
 
 		 307 aa  101  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00229932  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  24.69 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5934  MscS Mechanosensitive ion channel  33.55 
 
 		 378 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3015  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 379 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3045  potassium efflux protein KefA  29.95 
 
 		 1133 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0890  MscS mechanosensitive ion channel  27.56 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1933  MscS Mechanosensitive ion channel  28.71 
 
 		 358 aa  100  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2760  MscS Mechanosensitive ion channel  31.82 
 
 		 359 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  25.89 
 
 		 408 aa  99.8  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0452  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 283 aa  99.8  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00426986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  26.17 
 
 		 806 aa  99.8  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  28.9 
 
 		 484 aa  99.8  7e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1042  MscS Mechanosensitive ion channel  31.25 
 
 		 310 aa  99  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  30.89 
 
 		 292 aa  99  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 294 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  27.35 
 
 		 291 aa  99  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5044  mechanosensitive ion channel protein  29.79 
 
 		 357 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  26.11 
 
 		 287 aa  98.6  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  26.71 
 
 		 286 aa  99  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66400  potassium efflux protein KefA  26.33 
 
 		 1118 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  25.41 
 
 		 636 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5759  potassium efflux protein KefA  25.94 
 
 		 1118 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738971  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  27.34 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2114  MscS Mechanosensitive ion channel  32.64 
 
 		 361 aa  98.6  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  25.41 
 
 		 636 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  29.5 
 
 		 1120 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>