240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1046 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1046  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 
398 aa  784    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5784  MscS mechanosensitive ion channel  78.17 
 
 
394 aa  586  1e-166  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2263  MscS mechanosensitive ion channel  65.22 
 
 
402 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2310  MscS mechanosensitive ion channel  65.22 
 
 
399 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2302  MscS mechanosensitive ion channel  65.22 
 
 
399 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.47196 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33880  small-conductance mechanosensitive channel  52.5 
 
 
727 aa  346  3e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.415466  normal  0.49587 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0914  MscS mechanosensitive ion channel  48.84 
 
 
411 aa  345  1e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0178  MscS mechanosensitive ion channel  52.06 
 
 
545 aa  303  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.760917 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1771  MscS mechanosensitive ion channel  49.45 
 
 
400 aa  301  2e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6897  MscS mechanosensitive ion channel  45.68 
 
 
492 aa  295  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587185  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1758  MscS mechanosensitive ion channel  51.75 
 
 
399 aa  290  4e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.010572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6211  MscS Mechanosensitive ion channel  45.4 
 
 
391 aa  265  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1933  MscS Mechanosensitive ion channel  43.48 
 
 
358 aa  252  7e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0785  MscS Mechanosensitive ion channel  41.53 
 
 
395 aa  251  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0017606  normal  0.0299135 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5044  mechanosensitive ion channel protein  41.64 
 
 
357 aa  249  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2022  small-conductance mechanosensitive channel  36.96 
 
 
379 aa  247  3e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1009  small-conductance mechanosensitive channel  47.57 
 
 
331 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02550  membrane protein  43.96 
 
 
375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.290793  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2114  MscS Mechanosensitive ion channel  41.16 
 
 
361 aa  242  7e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2136  MscS Mechanosensitive ion channel  42.95 
 
 
349 aa  242  7.999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1386  MscS mechanosensitive ion channel  45.48 
 
 
391 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155035  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3568  MscS Mechanosensitive ion channel  38.72 
 
 
353 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.492229  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2760  MscS Mechanosensitive ion channel  45.42 
 
 
359 aa  241  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3015  MscS Mechanosensitive ion channel  39 
 
 
379 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1945  MscS Mechanosensitive ion channel  39.13 
 
 
407 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.415325  normal  0.454872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6267  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  45.49 
 
 
365 aa  239  6.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0247  hypothetical protein  43.14 
 
 
361 aa  238  2e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2160  mechanosensitive ion channel family protein  46.85 
 
 
394 aa  237  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1797  MscS mechanosensitive ion channel  51.35 
 
 
390 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.986921 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1121  MscS mechanosensitive ion channel  44.44 
 
 
374 aa  236  6e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1419  mechanosensitive ion channel family protein  46.32 
 
 
395 aa  236  7e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2436  mechanosensitive ion channel family protein  46.32 
 
 
395 aa  236  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1910  mechanosensitive ion channel family protein  46.32 
 
 
395 aa  236  7e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3394  mechanosensitive ion channel family protein  46.32 
 
 
395 aa  236  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2314  mechanosensitive ion channel family protein  46.32 
 
 
395 aa  236  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557878  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1183  mechanosensitive ion channel family protein  46.32 
 
 
395 aa  236  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3654  MscS mechanosensitive ion channel  39.72 
 
 
393 aa  235  8e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6191  MscS mechanosensitive ion channel  48.18 
 
 
390 aa  235  9e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.593763  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1911  MscS mechanosensitive ion channel  48.18 
 
 
390 aa  235  9e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00801877 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1888  MscS mechanosensitive ion channel  48.18 
 
 
390 aa  235  9e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2275  mechanosensitive ion channel family protein  46.32 
 
 
395 aa  235  9e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3947  MscS Mechanosensitive ion channel  39.72 
 
 
393 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0285178  normal  0.460909 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1825  MscS mechanosensitive ion channel  51.35 
 
 
390 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0903923  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2062  MscS mechanosensitive ion channel  41.5 
 
 
352 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4345  MscS mechanosensitive ion channel  38.55 
 
 
361 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5188  MscS mechanosensitive ion channel  48.58 
 
 
390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2268  MscS mechanosensitive ion channel  42.34 
 
 
362 aa  233  5e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.528739  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0292  hypothetical protein  39.16 
 
 
360 aa  232  7.000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.40096  hitchhiker  0.00233312 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2257  small-conductance mechanosensitive ion channel  38.79 
 
 
407 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0990371  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3749  Small-conductance mechanosensitive ion channel  38.59 
 
 
380 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3940  MscS Mechanosensitive ion channel  44.01 
 
 
393 aa  231  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2161  MscS Mechanosensitive ion channel  38.12 
 
 
365 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307461  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3972  MscS Mechanosensitive ion channel  42.28 
 
 
363 aa  229  5e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0682489  normal  0.528998 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1203  MscS Mechanosensitive ion channel  48.09 
 
 
372 aa  228  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.950573  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5934  MscS Mechanosensitive ion channel  42.86 
 
 
378 aa  227  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1241  mechanosensitive ion channel family protein  41.12 
 
 
362 aa  228  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0415  small-conductance mechanosensitive channel  39.51 
 
 
371 aa  224  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.344204  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2539  MscS Mechanosensitive ion channel  43.65 
 
 
360 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.984511  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2855  MscS mechanosensitive ion channel  38.91 
 
 
374 aa  220  3.9999999999999997e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.154936 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0118  MscS Mechanosensitive ion channel  42.75 
 
 
358 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.472344 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3703  MscS mechanosensitive ion channel  49.32 
 
 
373 aa  219  7e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0936689  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3905  MscS mechanosensitive ion channel  41.29 
 
 
373 aa  219  7.999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0235  MscS mechanosensitive ion channel  43.12 
 
 
368 aa  219  8.999999999999998e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0838  MscS Mechanosensitive ion channel  37.64 
 
 
374 aa  218  1e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2275  MscS mechanosensitive ion channel  37.65 
 
 
376 aa  206  6e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.312032  normal  0.0129381 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0017  MscS Mechanosensitive ion channel  35.47 
 
 
392 aa  196  7e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.305748 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0636  MscS mechanosensitive ion channel  40.91 
 
 
364 aa  192  9e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3570  MscS mechanosensitive ion channel  41.77 
 
 
368 aa  191  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10518  MscS Mechanosensitive ion channel  28.49 
 
 
591 aa  174  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.526339  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1861  MscS Mechanosensitive ion channel  34.13 
 
 
402 aa  169  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1262  MscS mechanosensitive ion channel  32.58 
 
 
627 aa  139  7.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.523793  normal  0.0747451 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1004  MscS mechanosensitive ion channel  30.67 
 
 
648 aa  127  5e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0783  MscS mechanosensitive ion channel  28.34 
 
 
571 aa  110  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2527  MscS mechanosensitive ion channel  31.39 
 
 
566 aa  93.2  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.131998  normal  0.145786 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  27.22 
 
 
351 aa  89.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0227  MscS mechanosensitive ion channel  26.4 
 
 
268 aa  88.6  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1010  MscS mechanosensitive ion channel  36.59 
 
 
308 aa  87.8  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.926579  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  31.16 
 
 
307 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  25.88 
 
 
304 aa  80.9  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5898  MscS Mechanosensitive ion channel  31.17 
 
 
268 aa  79.3  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207523  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2627  MscS mechanosensitive ion channel  25.83 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.159228  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0014  MscS Mechanosensitive ion channel  29.29 
 
 
289 aa  61.2  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  30.23 
 
 
864 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2109  MscS Mechanosensitive ion channel  30.13 
 
 
306 aa  56.2  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  29.95 
 
 
429 aa  55.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  28.24 
 
 
806 aa  55.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  26.6 
 
 
322 aa  53.9  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  25.97 
 
 
305 aa  53.9  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3447  mechanosensitive ion channel family protein  27.91 
 
 
816 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.597927  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  23.94 
 
 
389 aa  53.5  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  25.97 
 
 
305 aa  53.1  0.000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1188  MscS Mechanosensitive ion channel  27.23 
 
 
549 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0661  MscS Mechanosensitive ion channel  25.31 
 
 
295 aa  52.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  22.27 
 
 
400 aa  52.4  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1967  MscS Mechanosensitive ion channel  30.83 
 
 
279 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13183  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  27.43 
 
 
316 aa  51.6  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1298  MscS Mechanosensitive ion channel  26.67 
 
 
262 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.861763  normal  0.526246 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  25.97 
 
 
277 aa  52.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  31.33 
 
 
981 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0968  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  32.14 
 
 
403 aa  51.2  0.00003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0457255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>