More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10518 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_10518  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 591 aa  1213    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.526339  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1004  MscS mechanosensitive ion channel  34.03 
 
 		 648 aa  345  2e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1262  MscS mechanosensitive ion channel  31.69 
 
 		 627 aa  322  9.999999999999999e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.523793  normal  0.0747451 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2527  MscS mechanosensitive ion channel  29.03 
 
 		 566 aa  246  9e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.131998  normal  0.145786 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0783  MscS mechanosensitive ion channel  27.87 
 
 		 571 aa  240  6.999999999999999e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1933  MscS Mechanosensitive ion channel  40.65 
 
 		 358 aa  217  5.9999999999999996e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5188  MscS mechanosensitive ion channel  39.37 
 
 		 390 aa  209  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1825  MscS mechanosensitive ion channel  38.6 
 
 		 390 aa  206  9e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0903923  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1797  MscS mechanosensitive ion channel  38.6 
 
 		 390 aa  206  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.986921 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6191  MscS mechanosensitive ion channel  38.97 
 
 		 390 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.593763  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1888  MscS mechanosensitive ion channel  38.97 
 
 		 390 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1911  MscS mechanosensitive ion channel  38.97 
 
 		 390 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801877 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2275  mechanosensitive ion channel family protein  33.73 
 
 		 395 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1419  mechanosensitive ion channel family protein  33.73 
 
 		 395 aa  203  6e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2436  mechanosensitive ion channel family protein  33.73 
 
 		 395 aa  203  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2314  mechanosensitive ion channel family protein  33.73 
 
 		 395 aa  203  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557878  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1183  mechanosensitive ion channel family protein  33.73 
 
 		 395 aa  203  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1910  mechanosensitive ion channel family protein  33.73 
 
 		 395 aa  203  6e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3394  mechanosensitive ion channel family protein  33.73 
 
 		 395 aa  203  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1386  MscS mechanosensitive ion channel  33.14 
 
 		 391 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2760  MscS Mechanosensitive ion channel  38.76 
 
 		 359 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1945  MscS Mechanosensitive ion channel  34.41 
 
 		 407 aa  200  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.415325  normal  0.454872 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2160  mechanosensitive ion channel family protein  37.5 
 
 		 394 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2257  small-conductance mechanosensitive ion channel  33.05 
 
 		 407 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0990371  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6267  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  40.4 
 
 		 365 aa  193  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5934  MscS Mechanosensitive ion channel  37.83 
 
 		 378 aa  192  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2136  MscS Mechanosensitive ion channel  35.97 
 
 		 349 aa  192  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2114  MscS Mechanosensitive ion channel  37.25 
 
 		 361 aa  192  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1241  mechanosensitive ion channel family protein  37.69 
 
 		 362 aa  192  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2263  MscS mechanosensitive ion channel  31.68 
 
 		 402 aa  191  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5044  mechanosensitive ion channel protein  34.43 
 
 		 357 aa  190  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2302  MscS mechanosensitive ion channel  31.68 
 
 		 399 aa  191  5e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.47196 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2310  MscS mechanosensitive ion channel  31.68 
 
 		 399 aa  191  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2275  MscS mechanosensitive ion channel  38.71 
 
 		 376 aa  187  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.312032  normal  0.0129381 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02550  membrane protein  35.03 
 
 		 375 aa  187  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.290793  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1009  small-conductance mechanosensitive channel  39.63 
 
 		 331 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4345  MscS mechanosensitive ion channel  34.87 
 
 		 361 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0292  hypothetical protein  30.75 
 
 		 360 aa  185  3e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.40096  hitchhiker  0.00233312 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2062  MscS mechanosensitive ion channel  37.96 
 
 		 352 aa  184  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0415  small-conductance mechanosensitive channel  36.04 
 
 		 371 aa  182  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.344204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2855  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 374 aa  181  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154936 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0247  hypothetical protein  35.63 
 
 		 361 aa  180  8e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2539  MscS Mechanosensitive ion channel  36.71 
 
 		 360 aa  179  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.984511  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0017  MscS Mechanosensitive ion channel  29.49 
 
 		 392 aa  179  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.305748 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3905  MscS mechanosensitive ion channel  39.44 
 
 		 373 aa  178  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3972  MscS Mechanosensitive ion channel  32.57 
 
 		 363 aa  178  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0682489  normal  0.528998 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1121  MscS mechanosensitive ion channel  39.48 
 
 		 374 aa  178  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0838  MscS Mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 374 aa  179  2e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0914  MscS mechanosensitive ion channel  29.91 
 
 		 411 aa  178  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2268  MscS mechanosensitive ion channel  35.42 
 
 		 362 aa  178  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.528739  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3654  MscS mechanosensitive ion channel  37.86 
 
 		 393 aa  177  5e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3940  MscS Mechanosensitive ion channel  38.79 
 
 		 393 aa  177  6e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3947  MscS Mechanosensitive ion channel  37.86 
 
 		 393 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0285178  normal  0.460909 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3749  Small-conductance mechanosensitive ion channel  30.82 
 
 		 380 aa  174  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3568  MscS Mechanosensitive ion channel  33.46 
 
 		 353 aa  174  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.492229  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0785  MscS Mechanosensitive ion channel  38.07 
 
 		 395 aa  172  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0017606  normal  0.0299135 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1046  MscS mechanosensitive ion channel  32.16 
 
 		 398 aa  171  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33880  small-conductance mechanosensitive channel  32.48 
 
 		 727 aa  169  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.415466  normal  0.49587 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0118  MscS Mechanosensitive ion channel  32.32 
 
 		 358 aa  167  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.472344 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3703  MscS mechanosensitive ion channel  36.93 
 
 		 373 aa  165  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0936689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1861  MscS Mechanosensitive ion channel  34.3 
 
 		 402 aa  164  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0235  MscS mechanosensitive ion channel  36.18 
 
 		 368 aa  164  5.0000000000000005e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2022  small-conductance mechanosensitive channel  33.09 
 
 		 379 aa  160  7e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0636  MscS mechanosensitive ion channel  35.68 
 
 		 364 aa  159  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1771  MscS mechanosensitive ion channel  32.33 
 
 		 400 aa  157  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0178  MscS mechanosensitive ion channel  37 
 
 		 545 aa  157  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.760917 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1758  MscS mechanosensitive ion channel  32.34 
 
 		 399 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.010572 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5784  MscS mechanosensitive ion channel  33.94 
 
 		 394 aa  157  7e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3570  MscS mechanosensitive ion channel  35.21 
 
 		 368 aa  155  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6897  MscS mechanosensitive ion channel  30.91 
 
 		 492 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587185  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3015  MscS Mechanosensitive ion channel  32.87 
 
 		 379 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6211  MscS Mechanosensitive ion channel  32.1 
 
 		 391 aa  148  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2161  MscS Mechanosensitive ion channel  34.82 
 
 		 365 aa  144  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1203  MscS Mechanosensitive ion channel  43.02 
 
 		 372 aa  140  7.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.950573  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1010  MscS mechanosensitive ion channel  33.67 
 
 		 308 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.926579  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  29.1 
 
 		 307 aa  109  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4873  MscS Mechanosensitive ion channel  23.52 
 
 		 567 aa  107  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  27.05 
 
 		 351 aa  106  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0227  MscS mechanosensitive ion channel  36.3 
 
 		 268 aa  97.8  5e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1177  mechanosensitive ion channel  26.67 
 
 		 383 aa  97.4  7e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0857  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  26.67 
 
 		 383 aa  97.4  7e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017497  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5898  MscS Mechanosensitive ion channel  37.61 
 
 		 268 aa  97.1  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 304 aa  96.7  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0969  mechanosensitive ion channel family protein  25.23 
 
 		 554 aa  92.8  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1943  MscS mechanosensitive ion channel  22.54 
 
 		 533 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000658199  decreased coverage  0.00758396 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2755  MscS mechanosensitive ion channel:conserved TM helix  35.29 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3392  MscS Mechanosensitive ion channel  25.7 
 
 		 833 aa  83.2  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588  transporter, putative  26.98 
 
 		 1067 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2627  MscS mechanosensitive ion channel  25.1 
 
 		 278 aa  82.4  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.159228  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  25.66 
 
 		 484 aa  82  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3721  MscS Mechanosensitive ion channel  26.2 
 
 		 1072 aa  82  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4048  MscS mechanosensitive ion channel  22.77 
 
 		 569 aa  82  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138882  normal  0.12233 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3443  MscS mechanosensitive ion channel  26.98 
 
 		 1067 aa  82  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3904  MscS mechanosensitive ion channel  26.2 
 
 		 1072 aa  82  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0547  MscS mechanosensitive ion channel  26.2 
 
 		 1067 aa  82  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  24.91 
 
 		 362 aa  82  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3778  MscS mechanosensitive ion channel  26.2 
 
 		 1072 aa  82  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4500  MscS Mechanosensitive ion channel  24.45 
 
 		 662 aa  82  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3291  MscS mechanosensitive ion channel  26.98 
 
 		 1068 aa  80.5  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.563171  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0586  MscS mechanosensitive ion channel  25.76 
 
 		 1067 aa  80.5  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0875624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>