More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3947 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3940  MscS Mechanosensitive ion channel  94.15 
 
 		 393 aa  725    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3654  MscS mechanosensitive ion channel  98.98 
 
 		 393 aa  783    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3947  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 393 aa  789    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0285178  normal  0.460909 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1121  MscS mechanosensitive ion channel  79.65 
 
 		 374 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3749  Small-conductance mechanosensitive ion channel  52.12 
 
 		 380 aa  386  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2855  MscS mechanosensitive ion channel  51.27 
 
 		 374 aa  383  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154936 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3703  MscS mechanosensitive ion channel  56.34 
 
 		 373 aa  366  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0936689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3905  MscS mechanosensitive ion channel  53.14 
 
 		 373 aa  329  5.0000000000000004e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0017  MscS Mechanosensitive ion channel  48.1 
 
 		 392 aa  306  4.0000000000000004e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.305748 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0235  MscS mechanosensitive ion channel  49.69 
 
 		 368 aa  302  5.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2160  mechanosensitive ion channel family protein  55.56 
 
 		 394 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1183  mechanosensitive ion channel family protein  56.07 
 
 		 395 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1419  mechanosensitive ion channel family protein  56.07 
 
 		 395 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3394  mechanosensitive ion channel family protein  56.07 
 
 		 395 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2436  mechanosensitive ion channel family protein  56.07 
 
 		 395 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2314  mechanosensitive ion channel family protein  56.07 
 
 		 395 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557878  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2275  mechanosensitive ion channel family protein  56.07 
 
 		 395 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1910  mechanosensitive ion channel family protein  56.07 
 
 		 395 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1933  MscS Mechanosensitive ion channel  50.57 
 
 		 358 aa  276  5e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1009  small-conductance mechanosensitive channel  49.26 
 
 		 331 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02550  membrane protein  47.06 
 
 		 375 aa  270  4e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.290793  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5044  mechanosensitive ion channel protein  48.67 
 
 		 357 aa  269  7e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2136  MscS Mechanosensitive ion channel  49.23 
 
 		 349 aa  265  8.999999999999999e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2760  MscS Mechanosensitive ion channel  47.45 
 
 		 359 aa  263  4.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4345  MscS mechanosensitive ion channel  47.02 
 
 		 361 aa  262  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2268  MscS mechanosensitive ion channel  44.1 
 
 		 362 aa  262  6.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.528739  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0785  MscS Mechanosensitive ion channel  48.31 
 
 		 395 aa  261  2e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0017606  normal  0.0299135 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2062  MscS mechanosensitive ion channel  52.38 
 
 		 352 aa  261  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2275  MscS mechanosensitive ion channel  47.08 
 
 		 376 aa  260  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.312032  normal  0.0129381 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2257  small-conductance mechanosensitive ion channel  42.86 
 
 		 407 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0990371  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1241  mechanosensitive ion channel family protein  45 
 
 		 362 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1386  MscS mechanosensitive ion channel  48.36 
 
 		 391 aa  259  8e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3568  MscS Mechanosensitive ion channel  48.85 
 
 		 353 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.492229  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1797  MscS mechanosensitive ion channel  52 
 
 		 390 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.986921 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5188  MscS mechanosensitive ion channel  51.6 
 
 		 390 aa  257  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6191  MscS mechanosensitive ion channel  51.6 
 
 		 390 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.593763  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1911  MscS mechanosensitive ion channel  51.6 
 
 		 390 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801877 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1888  MscS mechanosensitive ion channel  51.6 
 
 		 390 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1945  MscS Mechanosensitive ion channel  50 
 
 		 407 aa  256  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.415325  normal  0.454872 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1825  MscS mechanosensitive ion channel  51.6 
 
 		 390 aa  255  7e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0903923  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2114  MscS Mechanosensitive ion channel  41.3 
 
 		 361 aa  252  1e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0292  hypothetical protein  42.27 
 
 		 360 aa  251  2e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.40096  hitchhiker  0.00233312 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1861  MscS Mechanosensitive ion channel  43.79 
 
 		 402 aa  247  3e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5934  MscS Mechanosensitive ion channel  45.28 
 
 		 378 aa  243  5e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0636  MscS mechanosensitive ion channel  50.41 
 
 		 364 aa  242  7e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0914  MscS mechanosensitive ion channel  39.69 
 
 		 411 aa  241  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0838  MscS Mechanosensitive ion channel  43.79 
 
 		 374 aa  239  5e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3570  MscS mechanosensitive ion channel  47.76 
 
 		 368 aa  236  7e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0118  MscS Mechanosensitive ion channel  42.09 
 
 		 358 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.472344 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0247  hypothetical protein  41.52 
 
 		 361 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1046  MscS mechanosensitive ion channel  42.28 
 
 		 398 aa  234  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0415  small-conductance mechanosensitive channel  44.49 
 
 		 371 aa  232  7.000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.344204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2539  MscS Mechanosensitive ion channel  41.87 
 
 		 360 aa  230  3e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.984511  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3972  MscS Mechanosensitive ion channel  37.09 
 
 		 363 aa  229  6e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0682489  normal  0.528998 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0178  MscS mechanosensitive ion channel  43.53 
 
 		 545 aa  226  4e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.760917 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1758  MscS mechanosensitive ion channel  42.32 
 
 		 399 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.010572 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33880  small-conductance mechanosensitive channel  44.79 
 
 		 727 aa  223  4e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.415466  normal  0.49587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5784  MscS mechanosensitive ion channel  39.4 
 
 		 394 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6267  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  40.2 
 
 		 365 aa  216  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6897  MscS mechanosensitive ion channel  41.42 
 
 		 492 aa  215  9e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1771  MscS mechanosensitive ion channel  38.16 
 
 		 400 aa  215  9e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6211  MscS Mechanosensitive ion channel  39.78 
 
 		 391 aa  215  9e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2161  MscS Mechanosensitive ion channel  37.35 
 
 		 365 aa  212  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2302  MscS mechanosensitive ion channel  37.47 
 
 		 399 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.47196 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2263  MscS mechanosensitive ion channel  37.47 
 
 		 402 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2310  MscS mechanosensitive ion channel  37.47 
 
 		 399 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3015  MscS Mechanosensitive ion channel  34.72 
 
 		 379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2022  small-conductance mechanosensitive channel  34.29 
 
 		 379 aa  197  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1203  MscS Mechanosensitive ion channel  46.98 
 
 		 372 aa  191  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.950573  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10518  MscS Mechanosensitive ion channel  37.86 
 
 		 591 aa  176  6e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.526339  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1262  MscS mechanosensitive ion channel  34.02 
 
 		 627 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.523793  normal  0.0747451 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1004  MscS mechanosensitive ion channel  36.07 
 
 		 648 aa  160  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0783  MscS mechanosensitive ion channel  26.03 
 
 		 571 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2527  MscS mechanosensitive ion channel  32.23 
 
 		 566 aa  110  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.131998  normal  0.145786 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  31.29 
 
 		 351 aa  97.1  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1010  MscS mechanosensitive ion channel  29.64 
 
 		 308 aa  92.4  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.926579  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0227  MscS mechanosensitive ion channel  26.55 
 
 		 268 aa  91.7  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  25.93 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5898  MscS Mechanosensitive ion channel  34.45 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2627  MscS mechanosensitive ion channel  36.79 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.159228  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  26.55 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0421  hypothetical protein  27.6 
 
 		 1115 aa  65.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.693078  hitchhiker  0.0000017841 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4765  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1108 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.514219  normal  0.17769 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4708  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1108 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4616  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1108 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.115019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4625  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1108 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.288253  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4744  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1108 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0345  hypothetical protein  27.03 
 
 		 1103 aa  64.7  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.742298  unclonable  0.00000473028 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1730  MscS Mechanosensitive ion channel  29.37 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.351236  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04029  predicted mechanosensitive channel  25.73 
 
 		 1107 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.475668  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3831  MscS Mechanosensitive ion channel  25.73 
 
 		 1107 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915765  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03991  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1107 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.391275  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4716  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1107 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00612141  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4691  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1107 aa  63.5  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00421616  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5675  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1107 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00234961  normal  0.548719 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10253  hypothetical protein  27.5 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00229932  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  23.91 
 
 		 484 aa  63.5  0.000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3851  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1107 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332968 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4630  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1107 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.250026  normal  0.0442574 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4401  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1107 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>