More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1911 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_1386  MscS mechanosensitive ion channel  90.77 
 
 		 391 aa  702    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5188  MscS mechanosensitive ion channel  95.9 
 
 		 390 aa  681    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1911  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 390 aa  773    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801877 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6191  MscS mechanosensitive ion channel  99.74 
 
 		 390 aa  772    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.593763  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1797  MscS mechanosensitive ion channel  94.87 
 
 		 390 aa  697    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.986921 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1825  MscS mechanosensitive ion channel  95.13 
 
 		 390 aa  699    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0903923  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1888  MscS mechanosensitive ion channel  99.74 
 
 		 390 aa  772    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2257  small-conductance mechanosensitive ion channel  70.36 
 
 		 407 aa  545  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0990371  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2160  mechanosensitive ion channel family protein  75.78 
 
 		 394 aa  543  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1910  mechanosensitive ion channel family protein  76.73 
 
 		 395 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3394  mechanosensitive ion channel family protein  76.73 
 
 		 395 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1419  mechanosensitive ion channel family protein  76.73 
 
 		 395 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2436  mechanosensitive ion channel family protein  76.73 
 
 		 395 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1183  mechanosensitive ion channel family protein  76.73 
 
 		 395 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2314  mechanosensitive ion channel family protein  76.73 
 
 		 395 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557878  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1945  MscS Mechanosensitive ion channel  69.07 
 
 		 407 aa  534  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.415325  normal  0.454872 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2275  mechanosensitive ion channel family protein  76.73 
 
 		 395 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4345  MscS mechanosensitive ion channel  54.42 
 
 		 361 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3568  MscS Mechanosensitive ion channel  52.02 
 
 		 353 aa  364  2e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.492229  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2062  MscS mechanosensitive ion channel  54.15 
 
 		 352 aa  363  3e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5044  mechanosensitive ion channel protein  51.79 
 
 		 357 aa  362  5.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1241  mechanosensitive ion channel family protein  56.29 
 
 		 362 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2275  MscS mechanosensitive ion channel  53.75 
 
 		 376 aa  350  3e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.312032  normal  0.0129381 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0636  MscS mechanosensitive ion channel  56.01 
 
 		 364 aa  343  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3570  MscS mechanosensitive ion channel  51.14 
 
 		 368 aa  325  8.000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02550  membrane protein  51.55 
 
 		 375 aa  325  9e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.290793  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0785  MscS Mechanosensitive ion channel  53.98 
 
 		 395 aa  306  3e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0017606  normal  0.0299135 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1009  small-conductance mechanosensitive channel  54.74 
 
 		 331 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1933  MscS Mechanosensitive ion channel  53.56 
 
 		 358 aa  296  5e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2855  MscS mechanosensitive ion channel  51.44 
 
 		 374 aa  285  7e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154936 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3905  MscS mechanosensitive ion channel  55.42 
 
 		 373 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2136  MscS Mechanosensitive ion channel  53.1 
 
 		 349 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0838  MscS Mechanosensitive ion channel  44.81 
 
 		 374 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2114  MscS Mechanosensitive ion channel  47.45 
 
 		 361 aa  280  2e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2268  MscS mechanosensitive ion channel  49.43 
 
 		 362 aa  278  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.528739  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0235  MscS mechanosensitive ion channel  51.34 
 
 		 368 aa  270  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1121  MscS mechanosensitive ion channel  54.15 
 
 		 374 aa  264  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3654  MscS mechanosensitive ion channel  50.19 
 
 		 393 aa  261  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0415  small-conductance mechanosensitive channel  44.03 
 
 		 371 aa  260  2e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.344204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3940  MscS Mechanosensitive ion channel  49.06 
 
 		 393 aa  260  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3947  MscS Mechanosensitive ion channel  50.19 
 
 		 393 aa  260  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0285178  normal  0.460909 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0292  hypothetical protein  48.44 
 
 		 360 aa  258  1e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.40096  hitchhiker  0.00233312 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33880  small-conductance mechanosensitive channel  50.61 
 
 		 727 aa  252  6e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.415466  normal  0.49587 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3749  Small-conductance mechanosensitive ion channel  39.36 
 
 		 380 aa  252  8.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0247  hypothetical protein  46.3 
 
 		 361 aa  251  1e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2539  MscS Mechanosensitive ion channel  47.08 
 
 		 360 aa  251  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.984511  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2760  MscS Mechanosensitive ion channel  45.38 
 
 		 359 aa  249  8e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0914  MscS mechanosensitive ion channel  40.18 
 
 		 411 aa  246  4e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3703  MscS mechanosensitive ion channel  50 
 
 		 373 aa  246  6e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0936689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0017  MscS Mechanosensitive ion channel  38.9 
 
 		 392 aa  244  9.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.305748 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3972  MscS Mechanosensitive ion channel  36.21 
 
 		 363 aa  243  5e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0682489  normal  0.528998 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0118  MscS Mechanosensitive ion channel  46.85 
 
 		 358 aa  238  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.472344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6267  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  45.61 
 
 		 365 aa  237  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1771  MscS mechanosensitive ion channel  41.33 
 
 		 400 aa  237  3e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1046  MscS mechanosensitive ion channel  46.97 
 
 		 398 aa  236  6e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1758  MscS mechanosensitive ion channel  38.83 
 
 		 399 aa  236  6e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.010572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6211  MscS Mechanosensitive ion channel  41.26 
 
 		 391 aa  236  7e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2022  small-conductance mechanosensitive channel  40.13 
 
 		 379 aa  229  7e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0178  MscS mechanosensitive ion channel  46.46 
 
 		 545 aa  229  9e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.760917 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2302  MscS mechanosensitive ion channel  47.15 
 
 		 399 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.47196 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5784  MscS mechanosensitive ion channel  45.33 
 
 		 394 aa  228  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2310  MscS mechanosensitive ion channel  47.15 
 
 		 399 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2263  MscS mechanosensitive ion channel  47.15 
 
 		 402 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6897  MscS mechanosensitive ion channel  41.21 
 
 		 492 aa  226  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5934  MscS Mechanosensitive ion channel  43.46 
 
 		 378 aa  226  4e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2161  MscS Mechanosensitive ion channel  47.18 
 
 		 365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307461  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10518  MscS Mechanosensitive ion channel  35.21 
 
 		 591 aa  213  3.9999999999999995e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.526339  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3015  MscS Mechanosensitive ion channel  41.8 
 
 		 379 aa  211  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1861  MscS Mechanosensitive ion channel  39.93 
 
 		 402 aa  209  9e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1203  MscS Mechanosensitive ion channel  46.4 
 
 		 372 aa  189  7e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.950573  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1004  MscS mechanosensitive ion channel  32.7 
 
 		 648 aa  162  6e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1262  MscS mechanosensitive ion channel  32.31 
 
 		 627 aa  160  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.523793  normal  0.0747451 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0783  MscS mechanosensitive ion channel  29.13 
 
 		 571 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2527  MscS mechanosensitive ion channel  31.38 
 
 		 566 aa  107  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.131998  normal  0.145786 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  27.56 
 
 		 307 aa  103  7e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1010  MscS mechanosensitive ion channel  28.19 
 
 		 308 aa  93.6  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.926579  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0227  MscS mechanosensitive ion channel  25.39 
 
 		 268 aa  93.2  7e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  29.61 
 
 		 351 aa  87.4  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  27.41 
 
 		 304 aa  79.3  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2627  MscS mechanosensitive ion channel  23.28 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.159228  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5898  MscS Mechanosensitive ion channel  31.4 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0014  MscS Mechanosensitive ion channel  23.98 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0890  MscS mechanosensitive ion channel  32.74 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  25.12 
 
 		 806 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  25.45 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  25.85 
 
 		 322 aa  62.4  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  27.78 
 
 		 286 aa  62.4  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5329  mechanosensitive ion channel protein MscS  30.97 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  30.34 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0663  MscS Mechanosensitive ion channel  30.06 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2555  MscS mechanosensitive ion channel  29.34 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2989  Ricin B lectin  30 
 
 		 474 aa  60.8  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000129425 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0308  MscS mechanosensitive ion channel  26.09 
 
 		 459 aa  60.1  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  23.85 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0444  MscS Mechanosensitive ion channel  24.32 
 
 		 404 aa  59.7  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4142  MscS mechanosensitive ion channel  21.21 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.93898  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  25.72 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10253  hypothetical protein  24.32 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00229932  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  22.71 
 
 		 484 aa  58.2  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  29.73 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>