More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1771 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1771  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 400 aa  783    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1758  MscS mechanosensitive ion channel  91.5 
 
 		 399 aa  666    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.010572 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0914  MscS mechanosensitive ion channel  44.36 
 
 		 411 aa  342  5e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6211  MscS Mechanosensitive ion channel  50.13 
 
 		 391 aa  334  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6897  MscS mechanosensitive ion channel  48.2 
 
 		 492 aa  332  5e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33880  small-conductance mechanosensitive channel  51.9 
 
 		 727 aa  330  2e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.415466  normal  0.49587 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0178  MscS mechanosensitive ion channel  52.38 
 
 		 545 aa  325  1e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.760917 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1046  MscS mechanosensitive ion channel  49.45 
 
 		 398 aa  319  7e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2302  MscS mechanosensitive ion channel  45.78 
 
 		 399 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.47196 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2263  MscS mechanosensitive ion channel  45.78 
 
 		 402 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2310  MscS mechanosensitive ion channel  45.78 
 
 		 399 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5784  MscS mechanosensitive ion channel  45.77 
 
 		 394 aa  292  6e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2022  small-conductance mechanosensitive channel  40.53 
 
 		 379 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1009  small-conductance mechanosensitive channel  49.45 
 
 		 331 aa  266  7e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6267  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  50.52 
 
 		 365 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1386  MscS mechanosensitive ion channel  40.36 
 
 		 391 aa  257  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155035  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3015  MscS Mechanosensitive ion channel  47.96 
 
 		 379 aa  257  3e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1797  MscS mechanosensitive ion channel  40.8 
 
 		 390 aa  253  6e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.986921 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02550  membrane protein  46.42 
 
 		 375 aa  252  7e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.290793  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1825  MscS mechanosensitive ion channel  40.8 
 
 		 390 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0903923  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5044  mechanosensitive ion channel protein  46.18 
 
 		 357 aa  250  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5188  MscS mechanosensitive ion channel  41.23 
 
 		 390 aa  249  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1911  MscS mechanosensitive ion channel  40.94 
 
 		 390 aa  249  7e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801877 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6191  MscS mechanosensitive ion channel  40.94 
 
 		 390 aa  249  7e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.593763  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1888  MscS mechanosensitive ion channel  40.94 
 
 		 390 aa  249  7e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2257  small-conductance mechanosensitive ion channel  41.06 
 
 		 407 aa  249  8e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0990371  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2161  MscS Mechanosensitive ion channel  41.02 
 
 		 365 aa  248  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2062  MscS mechanosensitive ion channel  47.96 
 
 		 352 aa  246  4e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1945  MscS Mechanosensitive ion channel  37.98 
 
 		 407 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.415325  normal  0.454872 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1933  MscS Mechanosensitive ion channel  43.68 
 
 		 358 aa  245  8e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2314  mechanosensitive ion channel family protein  47.57 
 
 		 395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557878  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3394  mechanosensitive ion channel family protein  47.57 
 
 		 395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1419  mechanosensitive ion channel family protein  47.57 
 
 		 395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2760  MscS Mechanosensitive ion channel  42.35 
 
 		 359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2436  mechanosensitive ion channel family protein  47.57 
 
 		 395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1183  mechanosensitive ion channel family protein  47.57 
 
 		 395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1910  mechanosensitive ion channel family protein  47.57 
 
 		 395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2275  mechanosensitive ion channel family protein  47.57 
 
 		 395 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2160  mechanosensitive ion channel family protein  46.82 
 
 		 394 aa  244  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0292  hypothetical protein  38.04 
 
 		 360 aa  241  2e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.40096  hitchhiker  0.00233312 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0785  MscS Mechanosensitive ion channel  40.99 
 
 		 395 aa  238  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0017606  normal  0.0299135 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0415  small-conductance mechanosensitive channel  36.25 
 
 		 371 aa  238  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.344204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0838  MscS Mechanosensitive ion channel  45.25 
 
 		 374 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2114  MscS Mechanosensitive ion channel  39.24 
 
 		 361 aa  235  8e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4345  MscS mechanosensitive ion channel  43.61 
 
 		 361 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1203  MscS Mechanosensitive ion channel  45.24 
 
 		 372 aa  235  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.950573  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3568  MscS Mechanosensitive ion channel  45.32 
 
 		 353 aa  235  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.492229  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2136  MscS Mechanosensitive ion channel  41.41 
 
 		 349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2268  MscS mechanosensitive ion channel  41.82 
 
 		 362 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.528739  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3654  MscS mechanosensitive ion channel  37.04 
 
 		 393 aa  231  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3940  MscS Mechanosensitive ion channel  41.52 
 
 		 393 aa  231  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1241  mechanosensitive ion channel family protein  40.61 
 
 		 362 aa  231  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3972  MscS Mechanosensitive ion channel  44.19 
 
 		 363 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0682489  normal  0.528998 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3947  MscS Mechanosensitive ion channel  37.04 
 
 		 393 aa  229  4e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0285178  normal  0.460909 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2855  MscS mechanosensitive ion channel  39.17 
 
 		 374 aa  229  6e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154936 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1121  MscS mechanosensitive ion channel  38.51 
 
 		 374 aa  228  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0118  MscS Mechanosensitive ion channel  44.79 
 
 		 358 aa  228  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.472344 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2275  MscS mechanosensitive ion channel  37.18 
 
 		 376 aa  227  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.312032  normal  0.0129381 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0247  hypothetical protein  42.53 
 
 		 361 aa  223  6e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3905  MscS mechanosensitive ion channel  39.2 
 
 		 373 aa  222  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5934  MscS Mechanosensitive ion channel  42.19 
 
 		 378 aa  217  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3749  Small-conductance mechanosensitive ion channel  38.26 
 
 		 380 aa  215  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2539  MscS Mechanosensitive ion channel  41.09 
 
 		 360 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.984511  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0636  MscS mechanosensitive ion channel  45.1 
 
 		 364 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3703  MscS mechanosensitive ion channel  42.29 
 
 		 373 aa  209  6e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0936689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3570  MscS mechanosensitive ion channel  45.31 
 
 		 368 aa  206  7e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0235  MscS mechanosensitive ion channel  36.99 
 
 		 368 aa  204  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0017  MscS Mechanosensitive ion channel  37.98 
 
 		 392 aa  189  9e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.305748 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10518  MscS Mechanosensitive ion channel  29.97 
 
 		 591 aa  174  2.9999999999999996e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.526339  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1861  MscS Mechanosensitive ion channel  34.3 
 
 		 402 aa  160  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1262  MscS mechanosensitive ion channel  35.19 
 
 		 627 aa  158  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.523793  normal  0.0747451 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1004  MscS mechanosensitive ion channel  28.7 
 
 		 648 aa  152  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0783  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 571 aa  110  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2527  MscS mechanosensitive ion channel  25.76 
 
 		 566 aa  106  9e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.131998  normal  0.145786 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  28.79 
 
 		 351 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  32.37 
 
 		 307 aa  94.4  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1010  MscS mechanosensitive ion channel  27.97 
 
 		 308 aa  92  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.926579  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  28.5 
 
 		 304 aa  82.8  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0227  MscS mechanosensitive ion channel  27.21 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2627  MscS mechanosensitive ion channel  27.03 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.159228  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5898  MscS Mechanosensitive ion channel  30.71 
 
 		 268 aa  68.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  40.52 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0332  MscS Mechanosensitive ion channel  26.21 
 
 		 773 aa  67  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.323369  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0014  MscS Mechanosensitive ion channel  24.76 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2935  MscS Mechanosensitive ion channel  30.34 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.863949  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13183  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  30.47 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0757  MscS mechanosensitive ion channel  26.38 
 
 		 479 aa  63.2  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  30.48 
 
 		 806 aa  62  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10253  hypothetical protein  28.68 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00229932  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5311  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 858 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021896 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  31.97 
 
 		 633 aa  60.1  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1457  MscS mechanosensitive ion channel  27.48 
 
 		 768 aa  60.1  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0427  MscS mechanosensitive ion channel  26.9 
 
 		 288 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0918944  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0082  MscS mechanosensitive ion channel  28.04 
 
 		 303 aa  59.3  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0423997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2612  MscS mechanosensitive ion channel  26.71 
 
 		 273 aa  59.3  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1320  MscS Mechanosensitive ion channel  25.83 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1247  MscS Mechanosensitive ion channel  29.19 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1967  MscS Mechanosensitive ion channel  30.7 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  24.56 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1632  MscS mechanosensitive ion channel  35.29 
 
 		 877 aa  57.4  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253181  normal  0.172693 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>