More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1861 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1861  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 402 aa  809    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0017  MscS Mechanosensitive ion channel  50 
 
 		 392 aa  392  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.305748 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2855  MscS mechanosensitive ion channel  40.34 
 
 		 374 aa  271  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154936 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1121  MscS mechanosensitive ion channel  44.74 
 
 		 374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3947  MscS Mechanosensitive ion channel  43.14 
 
 		 393 aa  252  9.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0285178  normal  0.460909 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3654  MscS mechanosensitive ion channel  42.81 
 
 		 393 aa  249  5e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3905  MscS mechanosensitive ion channel  41.75 
 
 		 373 aa  246  4e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3940  MscS Mechanosensitive ion channel  43.21 
 
 		 393 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3703  MscS mechanosensitive ion channel  44.27 
 
 		 373 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0936689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0235  MscS mechanosensitive ion channel  42.95 
 
 		 368 aa  230  3e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3749  Small-conductance mechanosensitive ion channel  36.68 
 
 		 380 aa  226  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1933  MscS Mechanosensitive ion channel  41.57 
 
 		 358 aa  223  6e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2160  mechanosensitive ion channel family protein  38.7 
 
 		 394 aa  216  5e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3394  mechanosensitive ion channel family protein  42.12 
 
 		 395 aa  216  7e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1419  mechanosensitive ion channel family protein  42.12 
 
 		 395 aa  216  7e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2436  mechanosensitive ion channel family protein  42.12 
 
 		 395 aa  216  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1183  mechanosensitive ion channel family protein  42.12 
 
 		 395 aa  216  7e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1910  mechanosensitive ion channel family protein  42.12 
 
 		 395 aa  216  7e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2314  mechanosensitive ion channel family protein  42.12 
 
 		 395 aa  216  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557878  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2275  mechanosensitive ion channel family protein  40.86 
 
 		 395 aa  216  8e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2062  MscS mechanosensitive ion channel  38.46 
 
 		 352 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1945  MscS Mechanosensitive ion channel  41.5 
 
 		 407 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.415325  normal  0.454872 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2257  small-conductance mechanosensitive ion channel  41.9 
 
 		 407 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0990371  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2275  MscS mechanosensitive ion channel  37.78 
 
 		 376 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.312032  normal  0.0129381 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5188  MscS mechanosensitive ion channel  40.71 
 
 		 390 aa  209  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1009  small-conductance mechanosensitive channel  37.5 
 
 		 331 aa  209  7e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1797  MscS mechanosensitive ion channel  40.32 
 
 		 390 aa  209  9e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.986921 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02550  membrane protein  36.65 
 
 		 375 aa  208  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.290793  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1386  MscS mechanosensitive ion channel  40.94 
 
 		 391 aa  208  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6191  MscS mechanosensitive ion channel  40.94 
 
 		 390 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.593763  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1825  MscS mechanosensitive ion channel  40.32 
 
 		 390 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0903923  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1888  MscS mechanosensitive ion channel  40.94 
 
 		 390 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1911  MscS mechanosensitive ion channel  40.94 
 
 		 390 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801877 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5044  mechanosensitive ion channel protein  44.4 
 
 		 357 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0838  MscS Mechanosensitive ion channel  35.51 
 
 		 374 aa  206  8e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2136  MscS Mechanosensitive ion channel  39.31 
 
 		 349 aa  205  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4345  MscS mechanosensitive ion channel  42.98 
 
 		 361 aa  203  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0636  MscS mechanosensitive ion channel  44.16 
 
 		 364 aa  203  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2760  MscS Mechanosensitive ion channel  42.67 
 
 		 359 aa  202  8e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0785  MscS Mechanosensitive ion channel  39.58 
 
 		 395 aa  200  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0017606  normal  0.0299135 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1241  mechanosensitive ion channel family protein  34.88 
 
 		 362 aa  197  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3568  MscS Mechanosensitive ion channel  39.48 
 
 		 353 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.492229  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2114  MscS Mechanosensitive ion channel  39.46 
 
 		 361 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5934  MscS Mechanosensitive ion channel  33.42 
 
 		 378 aa  195  9e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0247  hypothetical protein  36.89 
 
 		 361 aa  195  1e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2268  MscS mechanosensitive ion channel  40 
 
 		 362 aa  191  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.528739  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0292  hypothetical protein  39.3 
 
 		 360 aa  188  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.40096  hitchhiker  0.00233312 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0415  small-conductance mechanosensitive channel  31.65 
 
 		 371 aa  189  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.344204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0118  MscS Mechanosensitive ion channel  37.37 
 
 		 358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.472344 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3570  MscS mechanosensitive ion channel  38.4 
 
 		 368 aa  184  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2022  small-conductance mechanosensitive channel  34.57 
 
 		 379 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3972  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 363 aa  180  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0682489  normal  0.528998 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2539  MscS Mechanosensitive ion channel  36.07 
 
 		 360 aa  176  8e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.984511  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6267  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  33.33 
 
 		 365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3015  MscS Mechanosensitive ion channel  33.83 
 
 		 379 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1046  MscS mechanosensitive ion channel  32.83 
 
 		 398 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10518  MscS Mechanosensitive ion channel  31.18 
 
 		 591 aa  171  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.526339  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2263  MscS mechanosensitive ion channel  35.08 
 
 		 402 aa  169  8e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2302  MscS mechanosensitive ion channel  35.08 
 
 		 399 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.47196 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2310  MscS mechanosensitive ion channel  35.08 
 
 		 399 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33880  small-conductance mechanosensitive channel  37.4 
 
 		 727 aa  167  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.415466  normal  0.49587 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0178  MscS mechanosensitive ion channel  37.33 
 
 		 545 aa  151  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.760917 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5784  MscS mechanosensitive ion channel  32.28 
 
 		 394 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0914  MscS mechanosensitive ion channel  32.71 
 
 		 411 aa  149  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1758  MscS mechanosensitive ion channel  34.16 
 
 		 399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.010572 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1004  MscS mechanosensitive ion channel  33.94 
 
 		 648 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1771  MscS mechanosensitive ion channel  32.45 
 
 		 400 aa  147  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2161  MscS Mechanosensitive ion channel  29.11 
 
 		 365 aa  147  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1203  MscS Mechanosensitive ion channel  36.52 
 
 		 372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.950573  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6897  MscS mechanosensitive ion channel  31.05 
 
 		 492 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1262  MscS mechanosensitive ion channel  29.08 
 
 		 627 aa  140  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.523793  normal  0.0747451 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6211  MscS Mechanosensitive ion channel  37.28 
 
 		 391 aa  136  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0783  MscS mechanosensitive ion channel  30.52 
 
 		 571 aa  117  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2527  MscS mechanosensitive ion channel  29.54 
 
 		 566 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.131998  normal  0.145786 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1010  MscS mechanosensitive ion channel  27.94 
 
 		 308 aa  96.3  8e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.926579  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  23.97 
 
 		 351 aa  94.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  25.28 
 
 		 307 aa  91.3  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0227  MscS mechanosensitive ion channel  30.29 
 
 		 268 aa  90.1  6e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5898  MscS Mechanosensitive ion channel  32.45 
 
 		 268 aa  87.4  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2627  MscS mechanosensitive ion channel  24.65 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.159228  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  27.72 
 
 		 276 aa  65.5  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  26.98 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0757  MscS mechanosensitive ion channel  24.49 
 
 		 479 aa  62  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  26.98 
 
 		 305 aa  62  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3671  MscS mechanosensitive ion channel  26.27 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  23.81 
 
 		 364 aa  60.1  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  21.3 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  26.92 
 
 		 796 aa  60.1  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1699  MscS mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 456 aa  59.7  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.254155  normal  0.22429 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1632  mechanosensitive ion channel family protein  29.36 
 
 		 782 aa  58.9  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274059  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  19.47 
 
 		 360 aa  59.3  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  34.13 
 
 		 279 aa  58.9  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  25.81 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  26.09 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2555  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  23.87 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0527  MscS mechanosensitive ion channel  29.55 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0014  MscS Mechanosensitive ion channel  23.85 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  24.51 
 
 		 362 aa  57  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2568  MscS mechanosensitive ion channel  21.4 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>