More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1262 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1004  MscS mechanosensitive ion channel  52.09 
 
 		 648 aa  663    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1262  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 627 aa  1288    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.523793  normal  0.0747451 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10518  MscS Mechanosensitive ion channel  31.69 
 
 		 591 aa  322  9.999999999999999e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.526339  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0783  MscS mechanosensitive ion channel  27.44 
 
 		 571 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1933  MscS Mechanosensitive ion channel  33.88 
 
 		 358 aa  192  2e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2527  MscS mechanosensitive ion channel  27.03 
 
 		 566 aa  179  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.131998  normal  0.145786 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1121  MscS mechanosensitive ion channel  36.4 
 
 		 374 aa  169  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2275  MscS mechanosensitive ion channel  31.54 
 
 		 376 aa  167  8e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.312032  normal  0.0129381 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3654  MscS mechanosensitive ion channel  34.02 
 
 		 393 aa  166  9e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3947  MscS Mechanosensitive ion channel  34.02 
 
 		 393 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0285178  normal  0.460909 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3940  MscS Mechanosensitive ion channel  34.65 
 
 		 393 aa  164  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1945  MscS Mechanosensitive ion channel  33.98 
 
 		 407 aa  163  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.415325  normal  0.454872 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2855  MscS mechanosensitive ion channel  31.86 
 
 		 374 aa  162  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154936 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2257  small-conductance mechanosensitive ion channel  33.59 
 
 		 407 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0990371  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3568  MscS Mechanosensitive ion channel  32.22 
 
 		 353 aa  162  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.492229  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5188  MscS mechanosensitive ion channel  32.69 
 
 		 390 aa  160  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6191  MscS mechanosensitive ion channel  32.31 
 
 		 390 aa  160  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.593763  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1911  MscS mechanosensitive ion channel  32.31 
 
 		 390 aa  160  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801877 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1888  MscS mechanosensitive ion channel  32.31 
 
 		 390 aa  160  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2136  MscS Mechanosensitive ion channel  31.18 
 
 		 349 aa  158  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0017  MscS Mechanosensitive ion channel  33.47 
 
 		 392 aa  158  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.305748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6267  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  35.34 
 
 		 365 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0292  hypothetical protein  29.71 
 
 		 360 aa  157  4e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.40096  hitchhiker  0.00233312 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1797  MscS mechanosensitive ion channel  31.54 
 
 		 390 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.986921 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1419  mechanosensitive ion channel family protein  32.49 
 
 		 395 aa  157  6e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3394  mechanosensitive ion channel family protein  32.49 
 
 		 395 aa  157  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2436  mechanosensitive ion channel family protein  32.49 
 
 		 395 aa  157  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1910  mechanosensitive ion channel family protein  32.49 
 
 		 395 aa  157  6e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2114  MscS Mechanosensitive ion channel  31.2 
 
 		 361 aa  157  6e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1183  mechanosensitive ion channel family protein  32.49 
 
 		 395 aa  157  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2275  mechanosensitive ion channel family protein  32.49 
 
 		 395 aa  157  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2314  mechanosensitive ion channel family protein  32.49 
 
 		 395 aa  157  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557878  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2160  mechanosensitive ion channel family protein  32.48 
 
 		 394 aa  157  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3905  MscS mechanosensitive ion channel  32.57 
 
 		 373 aa  156  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0838  MscS Mechanosensitive ion channel  33.48 
 
 		 374 aa  155  1e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1825  MscS mechanosensitive ion channel  31.54 
 
 		 390 aa  156  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0903923  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1386  MscS mechanosensitive ion channel  32.59 
 
 		 391 aa  153  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4345  MscS mechanosensitive ion channel  31.27 
 
 		 361 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0785  MscS Mechanosensitive ion channel  31.4 
 
 		 395 aa  152  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0017606  normal  0.0299135 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3703  MscS mechanosensitive ion channel  31.9 
 
 		 373 aa  153  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0936689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5934  MscS Mechanosensitive ion channel  34.32 
 
 		 378 aa  151  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0235  MscS mechanosensitive ion channel  30.16 
 
 		 368 aa  150  6e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2062  MscS mechanosensitive ion channel  31.64 
 
 		 352 aa  150  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0415  small-conductance mechanosensitive channel  31.97 
 
 		 371 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.344204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02550  membrane protein  31.05 
 
 		 375 aa  147  7.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.290793  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2268  MscS mechanosensitive ion channel  29.57 
 
 		 362 aa  147  8.000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.528739  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5044  mechanosensitive ion channel protein  31.01 
 
 		 357 aa  146  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1009  small-conductance mechanosensitive channel  31.53 
 
 		 331 aa  145  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0247  hypothetical protein  29.6 
 
 		 361 aa  144  4e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1241  mechanosensitive ion channel family protein  28.29 
 
 		 362 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0636  MscS mechanosensitive ion channel  33.05 
 
 		 364 aa  143  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3749  Small-conductance mechanosensitive ion channel  29.28 
 
 		 380 aa  142  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2760  MscS Mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 359 aa  141  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2539  MscS Mechanosensitive ion channel  31.48 
 
 		 360 aa  140  7.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.984511  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1861  MscS Mechanosensitive ion channel  31.56 
 
 		 402 aa  139  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3972  MscS Mechanosensitive ion channel  34.02 
 
 		 363 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0682489  normal  0.528998 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1771  MscS mechanosensitive ion channel  35.19 
 
 		 400 aa  139  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1046  MscS mechanosensitive ion channel  32.58 
 
 		 398 aa  139  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3570  MscS mechanosensitive ion channel  33.77 
 
 		 368 aa  137  6.0000000000000005e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1758  MscS mechanosensitive ion channel  35.19 
 
 		 399 aa  136  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.010572 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0118  MscS Mechanosensitive ion channel  31.47 
 
 		 358 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.472344 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2263  MscS mechanosensitive ion channel  28.78 
 
 		 402 aa  130  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1203  MscS Mechanosensitive ion channel  33.61 
 
 		 372 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.950573  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2302  MscS mechanosensitive ion channel  28.78 
 
 		 399 aa  130  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.47196 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0914  MscS mechanosensitive ion channel  31.76 
 
 		 411 aa  130  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2310  MscS mechanosensitive ion channel  28.78 
 
 		 399 aa  130  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5784  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3015  MscS Mechanosensitive ion channel  30.91 
 
 		 379 aa  128  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2022  small-conductance mechanosensitive channel  29.39 
 
 		 379 aa  127  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1010  MscS mechanosensitive ion channel  33.5 
 
 		 308 aa  127  6e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.926579  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0178  MscS mechanosensitive ion channel  31.49 
 
 		 545 aa  125  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.760917 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2161  MscS Mechanosensitive ion channel  27.41 
 
 		 365 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6211  MscS Mechanosensitive ion channel  30.96 
 
 		 391 aa  120  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33880  small-conductance mechanosensitive channel  26.89 
 
 		 727 aa  119  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.415466  normal  0.49587 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6897  MscS mechanosensitive ion channel  31.22 
 
 		 492 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  29.06 
 
 		 351 aa  109  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0227  MscS mechanosensitive ion channel  27.31 
 
 		 268 aa  103  8e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5898  MscS Mechanosensitive ion channel  32.32 
 
 		 268 aa  99.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  32.56 
 
 		 307 aa  97.1  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  29.76 
 
 		 304 aa  85.5  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4048  MscS mechanosensitive ion channel  22.69 
 
 		 569 aa  81.6  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138882  normal  0.12233 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3390  MscS mechanosensitive ion channel  27.75 
 
 		 861 aa  77.4  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  27.19 
 
 		 366 aa  75.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0445  potassium efflux protein KefA  33.61 
 
 		 1117 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1222  MscS mechanosensitive ion channel  26.47 
 
 		 451 aa  75.1  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.110808  normal  0.111103 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2627  MscS mechanosensitive ion channel  22.17 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.159228  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  27.5 
 
 		 484 aa  74.3  0.000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5024  potassium efflux system protein KefA, putative  33.9 
 
 		 1134 aa  74.3  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0501  potassium efflux protein KefA  33.9 
 
 		 1134 aa  74.3  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0399  potassium efflux protein KefA  33.61 
 
 		 1102 aa  73.9  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5117  potassium efflux protein KefA  33.61 
 
 		 1102 aa  73.9  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  30.71 
 
 		 637 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  32.46 
 
 		 1115 aa  72  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1013  potassium efflux protein KefA  31.09 
 
 		 1128 aa  72  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  32.46 
 
 		 1120 aa  71.6  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0104  MscS mechanosensitive ion channel  28.28 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00989653  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  32.46 
 
 		 1120 aa  71.6  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  32.46 
 
 		 1120 aa  71.6  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  32.46 
 
 		 1118 aa  71.6  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  32.46 
 
 		 1120 aa  71.6  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>