More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2855 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2855  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 374 aa  749    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3947  MscS Mechanosensitive ion channel  51.27 
 
 		 393 aa  383  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0285178  normal  0.460909 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1121  MscS mechanosensitive ion channel  52.45 
 
 		 374 aa  383  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3654  MscS mechanosensitive ion channel  50.99 
 
 		 393 aa  381  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3940  MscS Mechanosensitive ion channel  48.92 
 
 		 393 aa  375  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3749  Small-conductance mechanosensitive ion channel  50 
 
 		 380 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3905  MscS mechanosensitive ion channel  54.11 
 
 		 373 aa  340  2e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3703  MscS mechanosensitive ion channel  50 
 
 		 373 aa  337  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0936689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0017  MscS Mechanosensitive ion channel  43.26 
 
 		 392 aa  321  9.999999999999999e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.305748 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0235  MscS mechanosensitive ion channel  47.65 
 
 		 368 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1933  MscS Mechanosensitive ion channel  50.35 
 
 		 358 aa  299  5e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2136  MscS Mechanosensitive ion channel  51.95 
 
 		 349 aa  292  6e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2062  MscS mechanosensitive ion channel  53.03 
 
 		 352 aa  290  4e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1419  mechanosensitive ion channel family protein  51.22 
 
 		 395 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1910  mechanosensitive ion channel family protein  51.22 
 
 		 395 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2436  mechanosensitive ion channel family protein  51.22 
 
 		 395 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3394  mechanosensitive ion channel family protein  51.22 
 
 		 395 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1183  mechanosensitive ion channel family protein  51.22 
 
 		 395 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2314  mechanosensitive ion channel family protein  51.22 
 
 		 395 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557878  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1009  small-conductance mechanosensitive channel  48.42 
 
 		 331 aa  288  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2275  mechanosensitive ion channel family protein  50.87 
 
 		 395 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1797  MscS mechanosensitive ion channel  52.96 
 
 		 390 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.986921 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6191  MscS mechanosensitive ion channel  51.44 
 
 		 390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.593763  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1911  MscS mechanosensitive ion channel  51.44 
 
 		 390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801877 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1888  MscS mechanosensitive ion channel  51.44 
 
 		 390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5188  MscS mechanosensitive ion channel  52.22 
 
 		 390 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1825  MscS mechanosensitive ion channel  52.96 
 
 		 390 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0903923  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1945  MscS Mechanosensitive ion channel  46.49 
 
 		 407 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.415325  normal  0.454872 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2160  mechanosensitive ion channel family protein  53.15 
 
 		 394 aa  278  8e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2257  small-conductance mechanosensitive ion channel  52.57 
 
 		 407 aa  277  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0990371  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1241  mechanosensitive ion channel family protein  49.08 
 
 		 362 aa  277  3e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3568  MscS Mechanosensitive ion channel  47.89 
 
 		 353 aa  276  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.492229  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2114  MscS Mechanosensitive ion channel  40.8 
 
 		 361 aa  276  5e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2268  MscS mechanosensitive ion channel  49.81 
 
 		 362 aa  275  8e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.528739  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2275  MscS mechanosensitive ion channel  45.25 
 
 		 376 aa  275  9e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.312032  normal  0.0129381 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4345  MscS mechanosensitive ion channel  44.08 
 
 		 361 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0785  MscS Mechanosensitive ion channel  46.1 
 
 		 395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0017606  normal  0.0299135 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1386  MscS mechanosensitive ion channel  55.93 
 
 		 391 aa  273  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0292  hypothetical protein  48.01 
 
 		 360 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.40096  hitchhiker  0.00233312 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02550  membrane protein  44.72 
 
 		 375 aa  265  7e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.290793  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2760  MscS Mechanosensitive ion channel  43.95 
 
 		 359 aa  265  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5044  mechanosensitive ion channel protein  43.93 
 
 		 357 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1861  MscS Mechanosensitive ion channel  39.53 
 
 		 402 aa  262  8.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5934  MscS Mechanosensitive ion channel  43.05 
 
 		 378 aa  259  6e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0636  MscS mechanosensitive ion channel  53.95 
 
 		 364 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3972  MscS Mechanosensitive ion channel  45.65 
 
 		 363 aa  250  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0682489  normal  0.528998 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0838  MscS Mechanosensitive ion channel  45.83 
 
 		 374 aa  246  4e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0118  MscS Mechanosensitive ion channel  40.66 
 
 		 358 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.472344 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2539  MscS Mechanosensitive ion channel  44.09 
 
 		 360 aa  243  5e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.984511  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0247  hypothetical protein  48.56 
 
 		 361 aa  241  1e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0415  small-conductance mechanosensitive channel  39.64 
 
 		 371 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.344204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6267  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  41.69 
 
 		 365 aa  239  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3570  MscS mechanosensitive ion channel  50.44 
 
 		 368 aa  236  7e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0178  MscS mechanosensitive ion channel  44.73 
 
 		 545 aa  228  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.760917 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0914  MscS mechanosensitive ion channel  41.58 
 
 		 411 aa  228  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33880  small-conductance mechanosensitive channel  47.06 
 
 		 727 aa  224  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.415466  normal  0.49587 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1758  MscS mechanosensitive ion channel  41.27 
 
 		 399 aa  222  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.010572 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1046  MscS mechanosensitive ion channel  39.68 
 
 		 398 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6211  MscS Mechanosensitive ion channel  41.4 
 
 		 391 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6897  MscS mechanosensitive ion channel  39.4 
 
 		 492 aa  216  7e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2022  small-conductance mechanosensitive channel  36.49 
 
 		 379 aa  211  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1771  MscS mechanosensitive ion channel  39.08 
 
 		 400 aa  209  5e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2302  MscS mechanosensitive ion channel  38.12 
 
 		 399 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.47196 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2310  MscS mechanosensitive ion channel  38.12 
 
 		 399 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2263  MscS mechanosensitive ion channel  38.12 
 
 		 402 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2161  MscS Mechanosensitive ion channel  44.5 
 
 		 365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1203  MscS Mechanosensitive ion channel  46.67 
 
 		 372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.950573  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3015  MscS Mechanosensitive ion channel  36.27 
 
 		 379 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5784  MscS mechanosensitive ion channel  36.73 
 
 		 394 aa  182  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10518  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 591 aa  181  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.526339  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1004  MscS mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 648 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1262  MscS mechanosensitive ion channel  31.86 
 
 		 627 aa  162  6e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.523793  normal  0.0747451 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0783  MscS mechanosensitive ion channel  29.21 
 
 		 571 aa  119  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2527  MscS mechanosensitive ion channel  29.54 
 
 		 566 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.131998  normal  0.145786 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0227  MscS mechanosensitive ion channel  29.02 
 
 		 268 aa  105  9e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  33.54 
 
 		 351 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1010  MscS mechanosensitive ion channel  33.51 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.926579  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  30.14 
 
 		 307 aa  96.3  9e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5898  MscS Mechanosensitive ion channel  35.29 
 
 		 268 aa  82.4  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2989  Ricin B lectin  27.84 
 
 		 474 aa  70.9  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000129425 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  26.95 
 
 		 806 aa  69.7  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2627  MscS mechanosensitive ion channel  23.11 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.159228  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5329  mechanosensitive ion channel protein MscS  39.47 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0890  MscS mechanosensitive ion channel  39.47 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  25.19 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  29.89 
 
 		 262 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0571  MscS Mechanosensitive ion channel  28.49 
 
 		 260 aa  65.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000639441  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10253  hypothetical protein  31 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00229932  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4142  MscS mechanosensitive ion channel  23.48 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.93898  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  28.95 
 
 		 843 aa  63.9  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  32.56 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0663  MscS Mechanosensitive ion channel  39.47 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  27.17 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  29.86 
 
 		 830 aa  63.2  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0421  hypothetical protein  29.69 
 
 		 1115 aa  62.8  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.693078  hitchhiker  0.0000017841 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1162  MscS Mechanosensitive ion channel  27.07 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.102088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0308  MscS mechanosensitive ion channel  24.35 
 
 		 459 aa  61.2  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0473  hypothetical protein  34.62 
 
 		 1104 aa  60.8  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1934  mechanosensitive ion channel family protein  27.03 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117079  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  28.12 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>