More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2022 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2022  small-conductance mechanosensitive channel  100 
 
 		 379 aa  764    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3015  MscS Mechanosensitive ion channel  57.27 
 
 		 379 aa  409  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6267  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  51.41 
 
 		 365 aa  322  7e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0914  MscS mechanosensitive ion channel  41.16 
 
 		 411 aa  256  4e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2302  MscS mechanosensitive ion channel  39.95 
 
 		 399 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.47196 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2310  MscS mechanosensitive ion channel  39.95 
 
 		 399 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2263  MscS mechanosensitive ion channel  39.95 
 
 		 402 aa  248  9e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1771  MscS mechanosensitive ion channel  40.53 
 
 		 400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1758  MscS mechanosensitive ion channel  40.4 
 
 		 399 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.010572 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1046  MscS mechanosensitive ion channel  36.74 
 
 		 398 aa  240  4e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3394  mechanosensitive ion channel family protein  43.94 
 
 		 395 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1419  mechanosensitive ion channel family protein  43.94 
 
 		 395 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2436  mechanosensitive ion channel family protein  43.94 
 
 		 395 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1183  mechanosensitive ion channel family protein  43.94 
 
 		 395 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2314  mechanosensitive ion channel family protein  43.94 
 
 		 395 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557878  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1910  mechanosensitive ion channel family protein  43.94 
 
 		 395 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2275  mechanosensitive ion channel family protein  43.94 
 
 		 395 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1009  small-conductance mechanosensitive channel  42.47 
 
 		 331 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2160  mechanosensitive ion channel family protein  41.2 
 
 		 394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1386  MscS mechanosensitive ion channel  41.04 
 
 		 391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0178  MscS mechanosensitive ion channel  45.56 
 
 		 545 aa  231  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.760917 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1933  MscS Mechanosensitive ion channel  41.95 
 
 		 358 aa  230  3e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5784  MscS mechanosensitive ion channel  38.19 
 
 		 394 aa  230  4e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0838  MscS Mechanosensitive ion channel  40.74 
 
 		 374 aa  229  8e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1797  MscS mechanosensitive ion channel  41.24 
 
 		 390 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.986921 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5188  MscS mechanosensitive ion channel  42.86 
 
 		 390 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2257  small-conductance mechanosensitive ion channel  34.64 
 
 		 407 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0990371  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1825  MscS mechanosensitive ion channel  41.24 
 
 		 390 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0903923  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33880  small-conductance mechanosensitive channel  40.97 
 
 		 727 aa  226  4e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.415466  normal  0.49587 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1945  MscS Mechanosensitive ion channel  34.46 
 
 		 407 aa  226  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.415325  normal  0.454872 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0118  MscS Mechanosensitive ion channel  43.02 
 
 		 358 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.472344 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0292  hypothetical protein  40.81 
 
 		 360 aa  226  7e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.40096  hitchhiker  0.00233312 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6191  MscS mechanosensitive ion channel  42.38 
 
 		 390 aa  225  9e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.593763  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1888  MscS mechanosensitive ion channel  42.38 
 
 		 390 aa  225  9e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1911  MscS mechanosensitive ion channel  42.38 
 
 		 390 aa  225  9e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801877 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3568  MscS Mechanosensitive ion channel  37.39 
 
 		 353 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.492229  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2114  MscS Mechanosensitive ion channel  40.91 
 
 		 361 aa  223  3e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6211  MscS Mechanosensitive ion channel  42.81 
 
 		 391 aa  223  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5044  mechanosensitive ion channel protein  41.01 
 
 		 357 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4345  MscS mechanosensitive ion channel  41.52 
 
 		 361 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2136  MscS Mechanosensitive ion channel  41.54 
 
 		 349 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6897  MscS mechanosensitive ion channel  41.95 
 
 		 492 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2062  MscS mechanosensitive ion channel  40.37 
 
 		 352 aa  219  5e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2760  MscS Mechanosensitive ion channel  38.55 
 
 		 359 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2161  MscS Mechanosensitive ion channel  33.8 
 
 		 365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2275  MscS mechanosensitive ion channel  40.64 
 
 		 376 aa  212  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.312032  normal  0.0129381 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1241  mechanosensitive ion channel family protein  41.67 
 
 		 362 aa  212  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2855  MscS mechanosensitive ion channel  36.49 
 
 		 374 aa  211  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154936 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3749  Small-conductance mechanosensitive ion channel  40 
 
 		 380 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5934  MscS Mechanosensitive ion channel  36.6 
 
 		 378 aa  209  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2268  MscS mechanosensitive ion channel  37.63 
 
 		 362 aa  208  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.528739  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3905  MscS mechanosensitive ion channel  36.42 
 
 		 373 aa  206  5e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02550  membrane protein  34.8 
 
 		 375 aa  205  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.290793  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0785  MscS Mechanosensitive ion channel  36.58 
 
 		 395 aa  203  4e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0017606  normal  0.0299135 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3972  MscS Mechanosensitive ion channel  40.7 
 
 		 363 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0682489  normal  0.528998 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3947  MscS Mechanosensitive ion channel  34.29 
 
 		 393 aa  197  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0285178  normal  0.460909 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1203  MscS Mechanosensitive ion channel  49.78 
 
 		 372 aa  195  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.950573  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3654  MscS mechanosensitive ion channel  34.01 
 
 		 393 aa  194  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0415  small-conductance mechanosensitive channel  37.21 
 
 		 371 aa  193  4e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.344204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3940  MscS Mechanosensitive ion channel  36.36 
 
 		 393 aa  192  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1121  MscS mechanosensitive ion channel  37.59 
 
 		 374 aa  192  7e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0017  MscS Mechanosensitive ion channel  34.18 
 
 		 392 aa  192  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.305748 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3703  MscS mechanosensitive ion channel  40.45 
 
 		 373 aa  192  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0936689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2539  MscS Mechanosensitive ion channel  40.65 
 
 		 360 aa  189  9e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.984511  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0247  hypothetical protein  37.69 
 
 		 361 aa  187  3e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0235  MscS mechanosensitive ion channel  37.38 
 
 		 368 aa  186  5e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0636  MscS mechanosensitive ion channel  40.36 
 
 		 364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1861  MscS Mechanosensitive ion channel  34.57 
 
 		 402 aa  183  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3570  MscS mechanosensitive ion channel  39.11 
 
 		 368 aa  178  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10518  MscS Mechanosensitive ion channel  33.09 
 
 		 591 aa  160  4e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.526339  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1004  MscS mechanosensitive ion channel  32.57 
 
 		 648 aa  139  7e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1262  MscS mechanosensitive ion channel  29.39 
 
 		 627 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.523793  normal  0.0747451 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0783  MscS mechanosensitive ion channel  28.87 
 
 		 571 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  29.03 
 
 		 351 aa  94  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  29.25 
 
 		 307 aa  92  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2527  MscS mechanosensitive ion channel  26.89 
 
 		 566 aa  90.5  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.131998  normal  0.145786 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1010  MscS mechanosensitive ion channel  25.29 
 
 		 308 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.926579  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2627  MscS mechanosensitive ion channel  26.88 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.159228  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0227  MscS mechanosensitive ion channel  26.49 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5898  MscS Mechanosensitive ion channel  34.71 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2612  MscS mechanosensitive ion channel  26.94 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  30.36 
 
 		 400 aa  69.3  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  24.52 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  30.82 
 
 		 429 aa  66.2  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  24.13 
 
 		 633 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  31.71 
 
 		 276 aa  65.9  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10253  hypothetical protein  29.5 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00229932  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5854  hypothetical protein  32.24 
 
 		 735 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  27.91 
 
 		 806 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67630  hypothetical protein  32.24 
 
 		 735 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1277  MscS mechanosensitive ion channel  29.72 
 
 		 718 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175782  normal  0.44534 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0950  MscS mechanosensitive ion channel  31.35 
 
 		 787 aa  61.6  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  26.72 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  21.97 
 
 		 484 aa  60.5  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  36.29 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0427  MscS mechanosensitive ion channel  28.19 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0918944  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  31.78 
 
 		 389 aa  59.3  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0014  MscS Mechanosensitive ion channel  28.95 
 
 		 289 aa  59.3  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  25.94 
 
 		 294 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1688  MscS mechanosensitive ion channel  30.67 
 
 		 719 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.265093  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>