277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0017 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0017  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 392 aa  793    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.305748 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1861  MscS Mechanosensitive ion channel  50 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2855  MscS mechanosensitive ion channel  43.26 
 
 		 374 aa  321  1.9999999999999998e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154936 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1121  MscS mechanosensitive ion channel  45.27 
 
 		 374 aa  306  3e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3947  MscS Mechanosensitive ion channel  48.1 
 
 		 393 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0285178  normal  0.460909 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3654  MscS mechanosensitive ion channel  44.32 
 
 		 393 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3703  MscS mechanosensitive ion channel  46.13 
 
 		 373 aa  303  4.0000000000000003e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0936689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3940  MscS Mechanosensitive ion channel  44.89 
 
 		 393 aa  302  9e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3905  MscS mechanosensitive ion channel  49.66 
 
 		 373 aa  299  7e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3749  Small-conductance mechanosensitive ion channel  40 
 
 		 380 aa  289  5.0000000000000004e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0235  MscS mechanosensitive ion channel  46.25 
 
 		 368 aa  282  6.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2160  mechanosensitive ion channel family protein  41.74 
 
 		 394 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1933  MscS Mechanosensitive ion channel  40.6 
 
 		 358 aa  252  9.000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1419  mechanosensitive ion channel family protein  50.64 
 
 		 395 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1910  mechanosensitive ion channel family protein  50.64 
 
 		 395 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2436  mechanosensitive ion channel family protein  50.64 
 
 		 395 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3394  mechanosensitive ion channel family protein  50.64 
 
 		 395 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2314  mechanosensitive ion channel family protein  50.64 
 
 		 395 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557878  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2275  mechanosensitive ion channel family protein  50.64 
 
 		 395 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1183  mechanosensitive ion channel family protein  50.64 
 
 		 395 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2760  MscS Mechanosensitive ion channel  44.13 
 
 		 359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02550  membrane protein  39.03 
 
 		 375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.290793  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5188  MscS mechanosensitive ion channel  46.91 
 
 		 390 aa  243  6e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1797  MscS mechanosensitive ion channel  46.5 
 
 		 390 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.986921 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6191  MscS mechanosensitive ion channel  46.5 
 
 		 390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.593763  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1911  MscS mechanosensitive ion channel  46.5 
 
 		 390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801877 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1825  MscS mechanosensitive ion channel  46.5 
 
 		 390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0903923  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1888  MscS mechanosensitive ion channel  46.5 
 
 		 390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1009  small-conductance mechanosensitive channel  40.58 
 
 		 331 aa  239  4e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1386  MscS mechanosensitive ion channel  44.27 
 
 		 391 aa  236  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1945  MscS Mechanosensitive ion channel  49.34 
 
 		 407 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.415325  normal  0.454872 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2114  MscS Mechanosensitive ion channel  39.39 
 
 		 361 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2062  MscS mechanosensitive ion channel  45.56 
 
 		 352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2136  MscS Mechanosensitive ion channel  37.88 
 
 		 349 aa  233  3e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2257  small-conductance mechanosensitive ion channel  48.91 
 
 		 407 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0990371  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2268  MscS mechanosensitive ion channel  45.34 
 
 		 362 aa  232  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.528739  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0415  small-conductance mechanosensitive channel  34.67 
 
 		 371 aa  229  4e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.344204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2275  MscS mechanosensitive ion channel  43.02 
 
 		 376 aa  227  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.312032  normal  0.0129381 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4345  MscS mechanosensitive ion channel  46.43 
 
 		 361 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5044  mechanosensitive ion channel protein  46.15 
 
 		 357 aa  226  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3568  MscS Mechanosensitive ion channel  46.9 
 
 		 353 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.492229  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0292  hypothetical protein  40.38 
 
 		 360 aa  223  4e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.40096  hitchhiker  0.00233312 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5934  MscS Mechanosensitive ion channel  34.52 
 
 		 378 aa  223  7e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0838  MscS Mechanosensitive ion channel  37.19 
 
 		 374 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0636  MscS mechanosensitive ion channel  45.38 
 
 		 364 aa  222  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0118  MscS Mechanosensitive ion channel  36.19 
 
 		 358 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.472344 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0785  MscS Mechanosensitive ion channel  43.23 
 
 		 395 aa  222  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0017606  normal  0.0299135 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1241  mechanosensitive ion channel family protein  44.84 
 
 		 362 aa  216  5e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0247  hypothetical protein  46.61 
 
 		 361 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3972  MscS Mechanosensitive ion channel  32.1 
 
 		 363 aa  206  4e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0682489  normal  0.528998 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2539  MscS Mechanosensitive ion channel  38.36 
 
 		 360 aa  205  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.984511  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6267  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  37.11 
 
 		 365 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3570  MscS mechanosensitive ion channel  42.42 
 
 		 368 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33880  small-conductance mechanosensitive channel  36.14 
 
 		 727 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.415466  normal  0.49587 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1046  MscS mechanosensitive ion channel  35.59 
 
 		 398 aa  196  6e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2022  small-conductance mechanosensitive channel  34.18 
 
 		 379 aa  192  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0914  MscS mechanosensitive ion channel  34.01 
 
 		 411 aa  191  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6211  MscS Mechanosensitive ion channel  36.13 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3015  MscS Mechanosensitive ion channel  32.1 
 
 		 379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2263  MscS mechanosensitive ion channel  33.61 
 
 		 402 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2310  MscS mechanosensitive ion channel  33.61 
 
 		 399 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2302  MscS mechanosensitive ion channel  33.61 
 
 		 399 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.47196 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2161  MscS Mechanosensitive ion channel  35.47 
 
 		 365 aa  182  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6897  MscS mechanosensitive ion channel  34.39 
 
 		 492 aa  179  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5784  MscS mechanosensitive ion channel  34.88 
 
 		 394 aa  179  7e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10518  MscS Mechanosensitive ion channel  29.49 
 
 		 591 aa  179  1e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.526339  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0178  MscS mechanosensitive ion channel  40.61 
 
 		 545 aa  178  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.760917 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1758  MscS mechanosensitive ion channel  38.01 
 
 		 399 aa  176  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.010572 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1203  MscS Mechanosensitive ion channel  42.45 
 
 		 372 aa  176  9e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.950573  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1771  MscS mechanosensitive ion channel  40.73 
 
 		 400 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1004  MscS mechanosensitive ion channel  36.91 
 
 		 648 aa  160  4e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1262  MscS mechanosensitive ion channel  33.47 
 
 		 627 aa  158  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.523793  normal  0.0747451 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0783  MscS mechanosensitive ion channel  28.52 
 
 		 571 aa  117  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2527  MscS mechanosensitive ion channel  29.54 
 
 		 566 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.131998  normal  0.145786 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  39.66 
 
 		 307 aa  88.6  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0227  MscS mechanosensitive ion channel  25.93 
 
 		 268 aa  88.2  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1010  MscS mechanosensitive ion channel  27.32 
 
 		 308 aa  87  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.926579  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  29.79 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5898  MscS Mechanosensitive ion channel  29.46 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2627  MscS mechanosensitive ion channel  24.61 
 
 		 278 aa  65.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.159228  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  23.4 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  26.84 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  23.71 
 
 		 806 aa  55.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10253  hypothetical protein  25 
 
 		 307 aa  55.5  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00229932  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1632  mechanosensitive ion channel family protein  29.13 
 
 		 782 aa  54.7  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274059  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  25.78 
 
 		 860 aa  54.3  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  30.16 
 
 		 429 aa  53.9  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5283  MscS Mechanosensitive ion channel  26.92 
 
 		 376 aa  53.9  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5329  mechanosensitive ion channel protein MscS  32.88 
 
 		 331 aa  53.9  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0890  MscS mechanosensitive ion channel  32.88 
 
 		 330 aa  53.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0527  MscS mechanosensitive ion channel  27.97 
 
 		 276 aa  53.5  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1320  MscS Mechanosensitive ion channel  26.14 
 
 		 300 aa  53.5  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  36.05 
 
 		 637 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  28.65 
 
 		 796 aa  52.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  27.34 
 
 		 830 aa  52.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2612  MscS mechanosensitive ion channel  29.11 
 
 		 273 aa  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0663  MscS Mechanosensitive ion channel  34.25 
 
 		 336 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1699  MscS mechanosensitive ion channel  28.92 
 
 		 456 aa  51.6  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.254155  normal  0.22429 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  25.13 
 
 		 341 aa  50.8  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0253  mechanosensitive ion channel family protein  25.82 
 
 		 378 aa  50.8  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>