More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1853 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1853  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 290 aa  592  1e-168  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00500  MscS Mechanosensitive ion channel  44.2 
 
 		 334 aa  256  5e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0890  MscS mechanosensitive ion channel  45.11 
 
 		 330 aa  225  7e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5329  mechanosensitive ion channel protein MscS  44.53 
 
 		 331 aa  198  7e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0663  MscS Mechanosensitive ion channel  41.57 
 
 		 336 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2771  MscS Mechanosensitive ion channel  34.43 
 
 		 296 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1417  MscS Mechanosensitive ion channel  35.46 
 
 		 304 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4182  MscS mechanosensitive ion channel  35.09 
 
 		 324 aa  148  8e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0015  MscS mechanosensitive ion channel  32.17 
 
 		 287 aa  145  8.000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0407  MscS mechanosensitive ion channel  36.97 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.323817  normal  0.0164618 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0108  MscS mechanosensitive ion channel  30.59 
 
 		 304 aa  128  9.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1189  MscS Mechanosensitive ion channel  28.21 
 
 		 445 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1486  MscS Mechanosensitive ion channel  27.92 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  32.27 
 
 		 262 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2422  MscS mechanosensitive ion channel  28.08 
 
 		 572 aa  109  5e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  26.3 
 
 		 311 aa  108  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0293  MscS mechanosensitive ion channel  26.49 
 
 		 447 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0743  MscS Mechanosensitive ion channel  30.26 
 
 		 460 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  32.02 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.461855 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4142  MscS mechanosensitive ion channel  27.21 
 
 		 384 aa  106  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.93898  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01752  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  26.77 
 
 		 328 aa  105  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249612  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4521  MscS Mechanosensitive ion channel  23.97 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5986  MscS Mechanosensitive ion channel  28.21 
 
 		 337 aa  101  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4090  MscS mechanosensitive ion channel  30.05 
 
 		 349 aa  98.6  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0661  MscS Mechanosensitive ion channel  25.69 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  25.89 
 
 		 414 aa  97.4  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  29.11 
 
 		 277 aa  97.8  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0308  MscS mechanosensitive ion channel  27.49 
 
 		 459 aa  97.8  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0102  MscS mechanosensitive ion channel  25.76 
 
 		 537 aa  97.8  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.102568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1940  MscS mechanosensitive ion channel  27.76 
 
 		 489 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2989  Ricin B lectin  29.24 
 
 		 474 aa  96.7  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000129425 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  29.39 
 
 		 549 aa  95.5  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  29.39 
 
 		 549 aa  95.5  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  30.38 
 
 		 547 aa  95.5  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  29.39 
 
 		 549 aa  95.5  9e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1701  phosphoglycerate mutase  28.9 
 
 		 310 aa  95.1  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  27.76 
 
 		 547 aa  95.1  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1496  MscS Mechanosensitive ion channel  25.19 
 
 		 295 aa  93.6  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  29.02 
 
 		 533 aa  93.6  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2000  MscS Mechanosensitive ion channel  28.65 
 
 		 302 aa  91.7  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.03582 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  24.78 
 
 		 356 aa  90.9  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  28.14 
 
 		 551 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  27.76 
 
 		 550 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  28.14 
 
 		 551 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  31.63 
 
 		 540 aa  90.5  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  26.64 
 
 		 279 aa  90.5  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02489  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  24.3 
 
 		 367 aa  90.1  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  30.34 
 
 		 283 aa  89.7  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3659  MscS mechanosensitive ion channel  24.18 
 
 		 439 aa  89.4  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.19276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  29.03 
 
 		 298 aa  89.7  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  28.25 
 
 		 389 aa  89.4  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  30.05 
 
 		 544 aa  89  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0091  MscS Mechanosensitive ion channel  28.22 
 
 		 297 aa  88.6  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  27.57 
 
 		 408 aa  88.6  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  25.9 
 
 		 360 aa  87.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  26.61 
 
 		 281 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  28.03 
 
 		 538 aa  87.4  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  25.45 
 
 		 843 aa  88.2  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  27.64 
 
 		 280 aa  88.2  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2740  MscS mechanosensitive ion channel  30.04 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1729  MscS Mechanosensitive ion channel  25.69 
 
 		 272 aa  87  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.356127  hitchhiker  0.00130809 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  24.7 
 
 		 842 aa  87  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  25.87 
 
 		 288 aa  87.4  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  28.5 
 
 		 534 aa  86.7  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1966  hypothetical protein  29.76 
 
 		 268 aa  87  4e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  24.81 
 
 		 273 aa  86.7  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  24.79 
 
 		 279 aa  86.7  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  28.12 
 
 		 299 aa  86.7  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2981  hypothetical protein  26.2 
 
 		 298 aa  86.3  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0759175  normal  0.0858863 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  25.4 
 
 		 359 aa  85.9  7e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0442  MscS Mechanosensitive ion channel  29.51 
 
 		 279 aa  85.9  8e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0527  MscS mechanosensitive ion channel  25.45 
 
 		 276 aa  85.5  9e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  26.72 
 
 		 531 aa  85.1  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1298  MscS Mechanosensitive ion channel  27.15 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.861763  normal  0.526246 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  25.33 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  23.04 
 
 		 360 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  28.95 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0540  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  33.99 
 
 		 173 aa  84  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000231888  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0910  MscS mechanosensitive ion channel  35.61 
 
 		 400 aa  84.7  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505459  normal  0.0192096 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0541  MscS mechanosensitive ion channel  26.34 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2423  MscS Mechanosensitive ion channel  26.73 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0692547 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  33.77 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1066  MscS Mechanosensitive ion channel  31.28 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  25.26 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  26.63 
 
 		 393 aa  82.4  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02189  hypothetical protein  31.82 
 
 		 249 aa  82  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  29.85 
 
 		 288 aa  82  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  25.12 
 
 		 276 aa  82  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0306  small-conductance mechanosensitive channel  25.94 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000279081  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0812  small-conductance mechanosensitive channel  31.13 
 
 		 274 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  26.79 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1162  MscS Mechanosensitive ion channel  26.55 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.102088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  23.4 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  26.15 
 
 		 275 aa  82  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1245  ion channel protein  28.05 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2829  MscS mechanosensitive ion channel  30.14 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  28.75 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0797  MscS Mechanosensitive ion channel  25.97 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0886  MscS mechanosensitive ion channel  25.41 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.36483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>