More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1496 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1496  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 
295 aa  595  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4521  MscS Mechanosensitive ion channel  48.7 
 
 
291 aa  256  3e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  39.27 
 
 
311 aa  211  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4090  MscS mechanosensitive ion channel  38.43 
 
 
349 aa  206  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01752  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  35.51 
 
 
328 aa  189  5.999999999999999e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249612  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13183  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  33.57 
 
 
316 aa  177  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1486  MscS Mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 
272 aa  159  7e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0014  MscS Mechanosensitive ion channel  31.64 
 
 
289 aa  149  4e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00500  MscS Mechanosensitive ion channel  29.39 
 
 
334 aa  130  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0102  MscS mechanosensitive ion channel  29.69 
 
 
537 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.102568  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2422  MscS mechanosensitive ion channel  29.69 
 
 
572 aa  125  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0015  MscS mechanosensitive ion channel  28.72 
 
 
287 aa  124  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  30.91 
 
 
288 aa  123  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  28.68 
 
 
287 aa  117  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3659  MscS mechanosensitive ion channel  30.4 
 
 
439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.19276  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  29.14 
 
 
544 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  29.82 
 
 
288 aa  114  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  29.39 
 
 
533 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1417  MscS Mechanosensitive ion channel  30.6 
 
 
304 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0890  MscS mechanosensitive ion channel  28.2 
 
 
330 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10253  hypothetical protein  29.68 
 
 
307 aa  109  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00229932  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0308  MscS mechanosensitive ion channel  26.72 
 
 
459 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1189  MscS Mechanosensitive ion channel  27.6 
 
 
445 aa  109  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  33.17 
 
 
540 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  30.27 
 
 
547 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0108  MscS mechanosensitive ion channel  28.04 
 
 
304 aa  107  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  29.86 
 
 
538 aa  107  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4182  MscS mechanosensitive ion channel  29.75 
 
 
324 aa  106  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5986  MscS Mechanosensitive ion channel  30.68 
 
 
337 aa  106  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  30.2 
 
 
549 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  30.2 
 
 
549 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  30.2 
 
 
549 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  33.02 
 
 
547 aa  105  9e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  28.03 
 
 
286 aa  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2989  Ricin B lectin  27.92 
 
 
474 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000129425 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  29.75 
 
 
274 aa  104  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  27.74 
 
 
273 aa  104  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0663  MscS Mechanosensitive ion channel  28.25 
 
 
336 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  28.85 
 
 
276 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2771  MscS Mechanosensitive ion channel  26.15 
 
 
296 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0661  MscS Mechanosensitive ion channel  30.63 
 
 
295 aa  103  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  29.32 
 
 
277 aa  103  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  29.6 
 
 
356 aa  103  5e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  29.54 
 
 
534 aa  102  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1940  MscS mechanosensitive ion channel  29.51 
 
 
489 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3392  MscS Mechanosensitive ion channel  31.4 
 
 
833 aa  101  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  27.68 
 
 
275 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  27.68 
 
 
275 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3699  MscS Mechanosensitive ion channel  25.18 
 
 
283 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  28.3 
 
 
531 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1342  MscS Mechanosensitive ion channel  29.74 
 
 
266 aa  100  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00293598  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  26.15 
 
 
276 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0104  MscS mechanosensitive ion channel  26.77 
 
 
278 aa  101  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00989653  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  32.64 
 
 
279 aa  101  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  28.31 
 
 
275 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  29.19 
 
 
408 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  27.68 
 
 
274 aa  99.8  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  28.14 
 
 
275 aa  99.8  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  26.64 
 
 
322 aa  100  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4142  MscS mechanosensitive ion channel  22.26 
 
 
384 aa  99.8  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.93898  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0585  putative small-conductance mechanosensitive channel  29.32 
 
 
277 aa  99.4  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591532  normal  0.0145572 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  25.98 
 
 
270 aa  99.4  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  29.05 
 
 
550 aa  99.4  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  27.31 
 
 
275 aa  99  8e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  27.99 
 
 
288 aa  99  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  27.31 
 
 
275 aa  99  8e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  28.97 
 
 
843 aa  98.6  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1887  MscS Mechanosensitive ion channel  28.51 
 
 
811 aa  98.6  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.723703  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  26.94 
 
 
275 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  30.43 
 
 
288 aa  98.6  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  31.43 
 
 
842 aa  98.2  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  27.15 
 
 
360 aa  98.2  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  30.17 
 
 
551 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2423  MscS Mechanosensitive ion channel  30.49 
 
 
297 aa  98.2  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0692547 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  30.17 
 
 
551 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  27.48 
 
 
283 aa  97.4  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  31.31 
 
 
274 aa  97.8  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1709  small conductance mechanosensitive channel  31.03 
 
 
494 aa  97.4  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0466336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  26.94 
 
 
275 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  27.15 
 
 
359 aa  98.2  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  26.94 
 
 
275 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3896  MscS Mechanosensitive ion channel  24.91 
 
 
283 aa  97.4  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  27.68 
 
 
275 aa  97.1  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  27.15 
 
 
360 aa  97.1  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  30.65 
 
 
637 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1359  MscS mechanosensitive ion channel  27.48 
 
 
275 aa  96.7  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  25.97 
 
 
286 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  25.82 
 
 
561 aa  96.3  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5329  mechanosensitive ion channel protein MscS  28.1 
 
 
331 aa  96.3  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  24.73 
 
 
291 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  27.03 
 
 
414 aa  96.7  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0743  MscS Mechanosensitive ion channel  26.2 
 
 
460 aa  96.3  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  25.97 
 
 
286 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  25.97 
 
 
286 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  25.97 
 
 
286 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  25.97 
 
 
286 aa  96.3  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  25.97 
 
 
286 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  25.65 
 
 
299 aa  96.3  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  25.97 
 
 
286 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  25.97 
 
 
286 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>