More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1066 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1066  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 261 aa  508  1e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1417  MscS Mechanosensitive ion channel  30.68 
 
 		 304 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  30.33 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1640  mechanosensitive ion channel  37.89 
 
 		 173 aa  100  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0204845  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  33.05 
 
 		 393 aa  99.8  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  31.55 
 
 		 406 aa  98.6  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0540  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  38.71 
 
 		 173 aa  97.8  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000231888  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02189  hypothetical protein  30.49 
 
 		 249 aa  97.1  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2771  MscS Mechanosensitive ion channel  26.21 
 
 		 296 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  30.12 
 
 		 281 aa  95.9  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  28.74 
 
 		 270 aa  95.1  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0663  MscS Mechanosensitive ion channel  33.88 
 
 		 336 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  27.84 
 
 		 275 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  27.57 
 
 		 275 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  29.44 
 
 		 275 aa  94  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  37.5 
 
 		 269 aa  93.6  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  26.85 
 
 		 806 aa  93.6  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  27.57 
 
 		 275 aa  93.6  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  27.57 
 
 		 275 aa  93.6  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  27.57 
 
 		 275 aa  93.2  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0306  small-conductance mechanosensitive channel  24.78 
 
 		 284 aa  93.2  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000279081  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  26.76 
 
 		 275 aa  93.2  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  27.47 
 
 		 275 aa  92.4  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  27.47 
 
 		 275 aa  92.4  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  27.84 
 
 		 275 aa  91.3  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  30.12 
 
 		 291 aa  91.3  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01752  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  34.09 
 
 		 328 aa  91.7  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249612  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  29.37 
 
 		 276 aa  90.5  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3394  MscS mechanosensitive ion channel  26.58 
 
 		 277 aa  91.3  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00053127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  30.7 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00500  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 334 aa  90.5  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0757  MscS mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 479 aa  90.5  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  27.38 
 
 		 362 aa  89.7  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00678  mechanosensitive ion channel family protein  27.27 
 
 		 271 aa  90.1  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.096226  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  27.78 
 
 		 362 aa  90.1  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  27.94 
 
 		 274 aa  89.4  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3509  MscS mechanosensitive ion channel  25.32 
 
 		 278 aa  89.4  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.126996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0443  MscS mechanosensitive ion channel  25.32 
 
 		 278 aa  89.4  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3684  MscS mechanosensitive ion channel  24.89 
 
 		 278 aa  89.7  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2423  MscS Mechanosensitive ion channel  25.1 
 
 		 297 aa  89.4  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0692547 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  26.97 
 
 		 299 aa  89.4  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2740  MscS mechanosensitive ion channel  27.41 
 
 		 288 aa  89  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1298  MscS Mechanosensitive ion channel  31.25 
 
 		 262 aa  89  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.861763  normal  0.526246 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  27.97 
 
 		 288 aa  89  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4512  MscS mechanosensitive ion channel  27.2 
 
 		 277 aa  88.6  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4090  MscS mechanosensitive ion channel  35.57 
 
 		 349 aa  89  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0767  small-conductance mechanosensitive ion channel  33.69 
 
 		 401 aa  88.6  9e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.967765  normal  0.366005 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1162  MscS Mechanosensitive ion channel  28.45 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.102088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0589  MscS mechanosensitive ion channel  30.36 
 
 		 291 aa  88.2  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0457  MscS mechanosensitive ion channel  25.21 
 
 		 277 aa  88.2  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1124  MscS Mechanosensitive ion channel  31.2 
 
 		 345 aa  88.2  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.745547  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0408  hypothetical protein  28.11 
 
 		 282 aa  88.2  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  30.67 
 
 		 273 aa  87.8  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  27.71 
 
 		 362 aa  87.4  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  28.4 
 
 		 277 aa  87.8  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4903  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 327 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0463  MscS mechanosensitive ion channel  25.73 
 
 		 278 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.11026  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0541  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 273 aa  87  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0890  MscS mechanosensitive ion channel  29.96 
 
 		 330 aa  86.7  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1486  MscS Mechanosensitive ion channel  28.99 
 
 		 272 aa  86.7  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3856  MscS mechanosensitive ion channel  25.31 
 
 		 278 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.20088  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0773  MscS mechanosensitive ion channel  33.16 
 
 		 401 aa  87  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  27.16 
 
 		 274 aa  87  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0487  MscS Mechanosensitive ion channel  25.31 
 
 		 278 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  26.43 
 
 		 274 aa  86.3  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0812  small-conductance mechanosensitive channel  27.06 
 
 		 274 aa  86.7  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  24.89 
 
 		 549 aa  86.7  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3612  MscS Mechanosensitive ion channel  36.55 
 
 		 374 aa  86.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.649067 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  27.68 
 
 		 282 aa  86.3  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000332583  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  24.89 
 
 		 549 aa  86.7  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4689  MscS Mechanosensitive ion channel  36.55 
 
 		 374 aa  86.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1034  MscS mechanosensitive ion channel  32.68 
 
 		 288 aa  86.7  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  26.38 
 
 		 286 aa  85.9  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0539  MscS mechanosensitive ion channel  27.03 
 
 		 278 aa  86.3  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.815557  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  24.89 
 
 		 549 aa  86.3  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  25.59 
 
 		 270 aa  86.3  5e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0307  MscS mechanosensitive ion channel  26.82 
 
 		 435 aa  86.3  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.381926  normal  0.0553472 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  31.4 
 
 		 262 aa  86.3  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0484  MscS mechanosensitive ion channel  25.31 
 
 		 278 aa  86.3  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0216741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0457  MscS mechanosensitive ion channel  25.75 
 
 		 278 aa  85.9  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  34.67 
 
 		 277 aa  85.9  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  27.23 
 
 		 538 aa  85.5  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  30.81 
 
 		 287 aa  85.5  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1729  MscS Mechanosensitive ion channel  33.14 
 
 		 272 aa  85.5  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.356127  hitchhiker  0.00130809 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1359  MscS mechanosensitive ion channel  26.38 
 
 		 275 aa  85.5  8e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5803  Small-conductance mechanosensitive channel  30.54 
 
 		 284 aa  85.5  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  26.79 
 
 		 843 aa  85.5  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2162  periplasmic binding protein; mechanosensitive ion channel component  31.21 
 
 		 794 aa  85.5  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10253  hypothetical protein  28.77 
 
 		 307 aa  85.5  8e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00229932  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5331  MscS mechanosensitive ion channel  30.56 
 
 		 301 aa  85.5  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  30.28 
 
 		 280 aa  85.1  9e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  27.85 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  31.1 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  25.1 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0797  MscS Mechanosensitive ion channel  28.45 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6057  MscS Mechanosensitive ion channel  30.36 
 
 		 779 aa  84.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  26.73 
 
 		 547 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1153  MscS Mechanosensitive ion channel  41.03 
 
 		 352 aa  84.3  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0617  MscS mechanosensitive ion channel  34.97 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3671  MscS mechanosensitive ion channel  27.91 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>