More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6057 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6057  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 779 aa  1553    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2162  periplasmic binding protein; mechanosensitive ion channel component  30.76 
 
 		 794 aa  354  4e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1599  MscS Mechanosensitive ion channel  26.28 
 
 		 862 aa  271  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2049  MscS mechanosensitive ion channel  27.76 
 
 		 783 aa  257  6e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2052  MscS Mechanosensitive ion channel  25.26 
 
 		 810 aa  207  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3392  MscS Mechanosensitive ion channel  25.17 
 
 		 833 aa  204  5e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3343  mechanosensitive ion channel protein  23.77 
 
 		 813 aa  197  6e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.183155 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  25.29 
 
 		 842 aa  173  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  29.97 
 
 		 806 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  32.81 
 
 		 840 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  31.84 
 
 		 796 aa  130  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  32.75 
 
 		 891 aa  128  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  32.75 
 
 		 785 aa  127  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  29.25 
 
 		 830 aa  125  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  27.23 
 
 		 753 aa  124  9e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 843 aa  124  9e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  32.35 
 
 		 860 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1518  hypothetical protein  32.43 
 
 		 732 aa  122  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0587  MscS mechanosensitive ion channel  29.06 
 
 		 1067 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0226105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0586  MscS mechanosensitive ion channel  29.06 
 
 		 1067 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0875624 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3910  hypothetical protein  27.92 
 
 		 301 aa  117  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  28 
 
 		 832 aa  117  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0935  MscS mechanosensitive ion channel  26.83 
 
 		 845 aa  117  8.999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2730  potassium efflux system KEFA  31.41 
 
 		 825 aa  117  8.999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668875  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  31.02 
 
 		 435 aa  117  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588  transporter, putative  28.57 
 
 		 1067 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3291  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 1068 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.563171  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3443  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 1067 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6436  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.227593 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3036  transporter, putative  28.57 
 
 		 1080 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0415629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  29 
 
 		 299 aa  115  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  30.54 
 
 		 849 aa  115  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  24.67 
 
 		 859 aa  115  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4343  MscS mechanosensitive ion channel  31.42 
 
 		 910 aa  114  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3321  MscS mechanosensitive ion channel  29.74 
 
 		 1078 aa  114  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.660513  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4556  MscS Mechanosensitive ion channel  29.79 
 
 		 883 aa  114  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0198839  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 843 aa  114  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7380  mechanosensitive ion channel protein  27.85 
 
 		 439 aa  114  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3721  MscS Mechanosensitive ion channel  28.08 
 
 		 1072 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0547  MscS mechanosensitive ion channel  28.08 
 
 		 1067 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  28.4 
 
 		 844 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  33.14 
 
 		 472 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3904  MscS mechanosensitive ion channel  28.08 
 
 		 1072 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3778  MscS mechanosensitive ion channel  28.08 
 
 		 1072 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1435  hypothetical protein  26.05 
 
 		 983 aa  112  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1549  hypothetical protein  26.05 
 
 		 983 aa  112  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0786  MscS mechanosensitive ion channel  28.08 
 
 		 1066 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.213544  hitchhiker  0.000495101 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  30.42 
 
 		 847 aa  111  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  30.42 
 
 		 847 aa  111  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3551  MscS mechanosensitive ion channel  28.93 
 
 		 1062 aa  111  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3758  MscS Mechanosensitive ion channel  28.36 
 
 		 809 aa  110  9.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992907  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  26.75 
 
 		 291 aa  110  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  31.09 
 
 		 874 aa  110  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  25.63 
 
 		 685 aa  110  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  29.78 
 
 		 1115 aa  109  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3059  MscS mechanosensitive ion channel  29.66 
 
 		 879 aa  109  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0365719  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  27.8 
 
 		 1235 aa  109  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0473  hypothetical protein  25.94 
 
 		 1104 aa  108  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  30.73 
 
 		 1120 aa  108  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  30.73 
 
 		 1120 aa  108  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  30.73 
 
 		 1120 aa  108  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  30.73 
 
 		 1118 aa  108  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  30.73 
 
 		 1120 aa  108  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  26.02 
 
 		 1166 aa  108  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  30.73 
 
 		 1120 aa  108  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  30.73 
 
 		 1120 aa  108  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  30.73 
 
 		 1120 aa  108  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  30.73 
 
 		 1120 aa  108  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1852  mechanosensitive ion channel family protein  32.68 
 
 		 804 aa  107  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0601787  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0445  potassium efflux protein KefA  27.88 
 
 		 1117 aa  107  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  30.94 
 
 		 981 aa  107  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  31.32 
 
 		 807 aa  107  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1934  mechanosensitive ion channel family protein  29.41 
 
 		 287 aa  105  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3549  MscS mechanosensitive ion channel  32.2 
 
 		 803 aa  106  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.566467  normal  0.27975 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0555  MscS mechanosensitive ion channel  26.6 
 
 		 1060 aa  105  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0475901  normal  0.179203 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4436  MscS mechanosensitive ion channel  32.34 
 
 		 432 aa  105  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506103  normal  0.992693 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4182  MscS mechanosensitive ion channel  26.6 
 
 		 1070 aa  105  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1206  potassium efflux protein KefA  28.87 
 
 		 1098 aa  105  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03384  small-conductance mechanosensitive channel  31.49 
 
 		 803 aa  105  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.670806  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  29.77 
 
 		 752 aa  105  4e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  30.17 
 
 		 1120 aa  104  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  30.17 
 
 		 1118 aa  104  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  30.17 
 
 		 1120 aa  104  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  30.17 
 
 		 1118 aa  104  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  30.17 
 
 		 1118 aa  104  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3172  MscS Mechanosensitive ion channel  29.1 
 
 		 784 aa  104  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 636 aa  104  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3045  potassium efflux protein KefA  31.14 
 
 		 1133 aa  104  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3390  MscS mechanosensitive ion channel  28.09 
 
 		 861 aa  104  8e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 636 aa  104  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2316  mechanosensitive ion channel family protein  30.61 
 
 		 773 aa  103  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  30.73 
 
 		 1111 aa  103  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1712  MscS mechanosensitive ion channel  26.46 
 
 		 291 aa  103  9e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4625  hypothetical protein  25.12 
 
 		 1108 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.288253  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5378  MscS Mechanosensitive ion channel  30.73 
 
 		 909 aa  103  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.287309  normal  0.723398 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4744  hypothetical protein  25.12 
 
 		 1108 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  29.83 
 
 		 864 aa  103  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3064  potassium efflux protein KefA  28.25 
 
 		 1120 aa  103  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0384  hypothetical protein  25.52 
 
 		 1107 aa  103  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.207125  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3204  potassium efflux protein KefA  28.25 
 
 		 1120 aa  103  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>