More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0015 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0015  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 287 aa  575  1.0000000000000001e-163  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4182  MscS mechanosensitive ion channel  56.74 
 
 		 324 aa  308  5e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0108  MscS mechanosensitive ion channel  53.49 
 
 		 304 aa  290  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1417  MscS Mechanosensitive ion channel  39.57 
 
 		 304 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00500  MscS Mechanosensitive ion channel  36.11 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0890  MscS mechanosensitive ion channel  32.25 
 
 		 330 aa  161  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2771  MscS Mechanosensitive ion channel  34.85 
 
 		 296 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0407  MscS mechanosensitive ion channel  39.64 
 
 		 315 aa  152  5e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.323817  normal  0.0164618 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01752  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  35.48 
 
 		 328 aa  151  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249612  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1853  MscS mechanosensitive ion channel  32.17 
 
 		 290 aa  145  8.000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  31.66 
 
 		 311 aa  142  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal  1 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5329  mechanosensitive ion channel protein MscS  31.05 
 
 		 331 aa  139  4.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4090  MscS mechanosensitive ion channel  32.36 
 
 		 349 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0663  MscS Mechanosensitive ion channel  35.27 
 
 		 336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  32.93 
 
 		 563 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  32.53 
 
 		 532 aa  130  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1189  MscS Mechanosensitive ion channel  28 
 
 		 445 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  33.07 
 
 		 538 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1496  MscS Mechanosensitive ion channel  28.72 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  32.43 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  30.71 
 
 		 341 aa  123  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  35.97 
 
 		 393 aa  123  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13183  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  29.6 
 
 		 316 aa  123  4e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  31.8 
 
 		 544 aa  123  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0014  MscS Mechanosensitive ion channel  27.63 
 
 		 289 aa  122  5e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2128  MscS mechanosensitive ion channel  29.89 
 
 		 270 aa  122  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  29.25 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  30.4 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1486  MscS Mechanosensitive ion channel  28.79 
 
 		 272 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  31.94 
 
 		 322 aa  120  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  32.68 
 
 		 547 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  29.53 
 
 		 534 aa  119  7.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  32.66 
 
 		 547 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  28.57 
 
 		 280 aa  116  5e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  31.71 
 
 		 843 aa  113  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1709  small conductance mechanosensitive channel  30.94 
 
 		 494 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0466336 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1940  MscS mechanosensitive ion channel  29.39 
 
 		 489 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  30.65 
 
 		 533 aa  112  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0585  putative small-conductance mechanosensitive channel  30.49 
 
 		 277 aa  112  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591532  normal  0.0145572 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3343  mechanosensitive ion channel protein  28.32 
 
 		 813 aa  112  8.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.183155 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4521  MscS Mechanosensitive ion channel  29.71 
 
 		 291 aa  112  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  29.13 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  31.62 
 
 		 540 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  34.91 
 
 		 360 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  28.4 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  32.26 
 
 		 551 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  28.83 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  32.26 
 
 		 551 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  32.26 
 
 		 550 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  34.2 
 
 		 356 aa  110  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  26.62 
 
 		 275 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  34.91 
 
 		 360 aa  109  6e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  26.62 
 
 		 275 aa  109  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  26.62 
 
 		 275 aa  109  6e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  31.45 
 
 		 549 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  31.45 
 
 		 549 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1887  MscS Mechanosensitive ion channel  32.46 
 
 		 811 aa  108  8.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.723703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  31.45 
 
 		 549 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  26.48 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1359  MscS mechanosensitive ion channel  29.01 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  29.44 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  29.82 
 
 		 561 aa  106  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1188  MscS mechanosensitive ion channel  31.75 
 
 		 267 aa  106  4e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3699  MscS Mechanosensitive ion channel  28.85 
 
 		 283 aa  106  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  34.43 
 
 		 359 aa  106  4e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3896  MscS Mechanosensitive ion channel  28.85 
 
 		 283 aa  106  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0730  MscS mechanosensitive ion channel  32.54 
 
 		 267 aa  106  5e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.506108  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  26.62 
 
 		 275 aa  106  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  26.85 
 
 		 275 aa  105  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  27.05 
 
 		 274 aa  105  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0442  MscS Mechanosensitive ion channel  28.46 
 
 		 279 aa  105  9e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3910  hypothetical protein  33.02 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2422  MscS mechanosensitive ion channel  27.96 
 
 		 572 aa  104  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  27.76 
 
 		 275 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4603  mechanosensitive ion channel family protein  27.24 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0515  MscS Mechanosensitive ion channel  28.46 
 
 		 292 aa  103  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0104  MscS mechanosensitive ion channel  28.78 
 
 		 278 aa  104  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00989653  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  33.48 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  29.84 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  29.92 
 
 		 366 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2284  MscS mechanosensitive ion channel  29.92 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0569  MscS Mechanosensitive ion channel  29.62 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912877  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  27.06 
 
 		 275 aa  103  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  27.37 
 
 		 287 aa  103  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3012  MscS mechanosensitive ion channel  33.85 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  34.05 
 
 		 685 aa  103  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  27.97 
 
 		 288 aa  102  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0743  MscS Mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 460 aa  102  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2989  Ricin B lectin  29.17 
 
 		 474 aa  103  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000129425 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0556  MscS Mechanosensitive ion channel  29.21 
 
 		 293 aa  102  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0102  MscS mechanosensitive ion channel  28.42 
 
 		 537 aa  102  6e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.102568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  30.95 
 
 		 406 aa  102  6e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3627  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 268 aa  102  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0202  mechanosensitive ion channel family protein  24.29 
 
 		 271 aa  102  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3172  MscS Mechanosensitive ion channel  31.53 
 
 		 784 aa  102  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0091  MscS mechanosensitive ion channel  31.87 
 
 		 267 aa  102  7e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  26.07 
 
 		 275 aa  102  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  26.07 
 
 		 275 aa  102  7e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0854  MscS mechanosensitive ion channel  28.85 
 
 		 289 aa  102  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0851  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  28.85 
 
 		 289 aa  102  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>