More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3145 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 304 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243267  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4726  MscS mechanosensitive ion channel  72.05 
 
 		 325 aa  350  1e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.440183  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4144  MscS mechanosensitive ion channel  48.39 
 
 		 311 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.789982 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4255  mechanosensitive (MS) ion channel protein  50.78 
 
 		 311 aa  235  7e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4274  hypothetical protein  52.48 
 
 		 368 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1534  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.18 
 
 		 501 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231252  normal  0.283254 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2519  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  33.64 
 
 		 492 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.806579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  33 
 
 		 366 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2775  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  31.9 
 
 		 493 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.85719 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1867  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.14 
 
 		 480 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0456814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6888  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  29.67 
 
 		 506 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2712  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  28.1 
 
 		 507 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0470198  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5823  MscS mechanosensitive ion channel  27.52 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal  0.440829 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6131  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  32.24 
 
 		 489 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0258  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  29.03 
 
 		 492 aa  97.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.986681 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  26.43 
 
 		 364 aa  96.3  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2303  MscS Mechanosensitive ion channel  30.73 
 
 		 512 aa  95.1  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.697138  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2387  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  28.77 
 
 		 490 aa  95.5  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2790  MscS mechanosensitive ion channel  28.11 
 
 		 335 aa  94.7  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.756482  normal  0.557915 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1530  MscS Mechanosensitive ion channel  28.22 
 
 		 372 aa  94.7  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.421553 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2122  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  34.38 
 
 		 489 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.510942  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_1178  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  28.02 
 
 		 505 aa  94.4  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.811879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5283  MscS Mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 376 aa  94.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  24.75 
 
 		 369 aa  92  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  26.07 
 
 		 359 aa  90.9  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  24.78 
 
 		 360 aa  90.1  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  26.09 
 
 		 369 aa  89.7  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7035  MscS mechanosensitive ion channel  32.23 
 
 		 493 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.666416  normal  0.218312 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1460  MscS mechanosensitive ion channel  31.75 
 
 		 493 aa  89  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6368  MscS mechanosensitive ion channel  31.75 
 
 		 493 aa  89  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5166  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  26.89 
 
 		 475 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0740457  normal  0.0860349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5308  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  26.89 
 
 		 508 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119708 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5256  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  26.89 
 
 		 475 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.584441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  30.17 
 
 		 393 aa  87.4  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  24.19 
 
 		 362 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1417  MscS Mechanosensitive ion channel  32.26 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  23.84 
 
 		 366 aa  83.2  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  26.34 
 
 		 406 aa  82.8  0.000000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 479 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3626  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  29.02 
 
 		 489 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  30.29 
 
 		 400 aa  82.8  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  26.9 
 
 		 311 aa  82.4  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1277  MscS mechanosensitive ion channel  25.94 
 
 		 352 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  25.66 
 
 		 414 aa  81.3  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2162  periplasmic binding protein; mechanosensitive ion channel component  26.38 
 
 		 794 aa  80.9  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2440  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  29.63 
 
 		 509 aa  80.5  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00769093 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1529  MscS Mechanosensitive ion channel  25.19 
 
 		 385 aa  80.9  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  26.29 
 
 		 806 aa  80.9  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  27.42 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0767  small-conductance mechanosensitive ion channel  29.03 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.967765  normal  0.366005 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3910  hypothetical protein  28.02 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012669  Bcav_0226  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  32.05 
 
 		 473 aa  79.3  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.512445  normal  0.203081 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0141  MscS Mechanosensitive ion channel  29.59 
 
 		 373 aa  79  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195967  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_1599  MscS Mechanosensitive ion channel  25.6 
 
 		 862 aa  79  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  27.81 
 
 		 291 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1968  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  24.02 
 
 		 475 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.805203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0773  MscS mechanosensitive ion channel  28.39 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  25.87 
 
 		 842 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  22.58 
 
 		 362 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  25.62 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  26.29 
 
 		 637 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  21.79 
 
 		 361 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3931  hypothetical protein  27.34 
 
 		 806 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.604151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46240  hypothetical protein  26.56 
 
 		 807 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.566889  normal  0.0303227 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1852  mechanosensitive ion channel family protein  29.76 
 
 		 804 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0601787  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6057  MscS Mechanosensitive ion channel  21.82 
 
 		 779 aa  77  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0308  MscS mechanosensitive ion channel  27.37 
 
 		 459 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1124  MscS Mechanosensitive ion channel  22.26 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.745547  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  31.08 
 
 		 429 aa  76.6  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3549  MscS mechanosensitive ion channel  29.76 
 
 		 803 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.566467  normal  0.27975 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2829  MscS mechanosensitive ion channel  26.67 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12461  transmembrane protein  29.05 
 
 		 481 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4142  MscS mechanosensitive ion channel  26.85 
 
 		 384 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.93898  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0741  MscS mechanosensitive ion channel  26.95 
 
 		 803 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  29.1 
 
 		 825 aa  75.9  0.0000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  26.49 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2316  mechanosensitive ion channel family protein  28.99 
 
 		 773 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3659  MscS mechanosensitive ion channel  29.52 
 
 		 439 aa  75.9  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.19276  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1934  mechanosensitive ion channel family protein  24.86 
 
 		 287 aa  75.5  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117079  n/a   
 
 
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NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  26.24 
 
 		 472 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0689  MscS mechanosensitive ion channel  24.56 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.13803  n/a   
 
 
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NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  26.36 
 
 		 274 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
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NC_006348  BMA0986  mechanosensitive ion channel family protein  28.4 
 
 		 808 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722323  n/a   
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_2264  mechanosensitive ion channel family protein  28.4 
 
 		 809 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_2125  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  28.4 
 
 		 809 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0467602  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_0740  MscS mechanosensitive ion channel  26.95 
 
 		 803 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333087  normal  1 
 
 
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NC_011138  MADE_02489  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  27.88 
 
 		 367 aa  75.1  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_2070  mechanosensitive ion channel family protein  28.4 
 
 		 809 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563687  n/a   
 
 
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NC_010676  Bphyt_6691  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 485 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2300  MscS Mechanosensitive ion channel  27.88 
 
 		 427 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013061  Phep_3392  MscS Mechanosensitive ion channel  22.02 
 
 		 833 aa  74.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008782  Ajs_2811  MscS mechanosensitive ion channel  27.88 
 
 		 427 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.231648 
 
 
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NC_002947  PP_0707  MscS mechanosensitive ion channel  26.95 
 
 		 855 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.441898  normal  1 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_0786  MscS Mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 840 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_1189  MscS Mechanosensitive ion channel  31.03 
 
 		 445 aa  73.9  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009135  MmarC5_1409  MscS mechanosensitive ion channel  24.91 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_2869  MscS Mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 815 aa  73.9  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266209  n/a   
 
 
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NC_012029  Hlac_2479  MscS Mechanosensitive ion channel  26.06 
 
 		 383 aa  73.6  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.827266 
 
 
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NC_013421  Pecwa_1404  MscS Mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 817 aa  73.9  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_0857  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 840 aa  73.6  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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