81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0589 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0589  phospholipid-binding domain-containing protein  100 
 
 
183 aa  369  1e-101  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2199  putative transport-associated  82.32 
 
 
191 aa  315  3e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0366  transport-associated, putative  50.54 
 
 
191 aa  189  1e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2000  transport-associated protein  30.43 
 
 
185 aa  84.3  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0471437  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  30.41 
 
 
202 aa  63.5  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2802  transport-associated  22.88 
 
 
184 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  30.61 
 
 
202 aa  61.6  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2204  transport-associated  24.18 
 
 
176 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3297  transport-associated  24.84 
 
 
201 aa  59.3  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.173268  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  27.4 
 
 
204 aa  57  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  30.56 
 
 
204 aa  56.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  27.4 
 
 
204 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  27.4 
 
 
204 aa  57  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  24.87 
 
 
199 aa  54.3  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3587  transport-associated  33.33 
 
 
191 aa  53.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3465  periplasmic protein  25.62 
 
 
202 aa  52  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  26.03 
 
 
205 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  27.59 
 
 
205 aa  51.6  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  26.03 
 
 
205 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  26.03 
 
 
205 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  26.03 
 
 
205 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  26.03 
 
 
205 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  26.9 
 
 
201 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  26.9 
 
 
201 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  26.9 
 
 
201 aa  50.8  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  26.9 
 
 
201 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  25.68 
 
 
201 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  26.9 
 
 
201 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1844  transport-associated  22.36 
 
 
235 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  26.9 
 
 
201 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  26.9 
 
 
201 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  26.9 
 
 
201 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4244  transport-associated protein  25.69 
 
 
136 aa  48.1  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5094  transport-associated  28 
 
 
273 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0983587  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  26.53 
 
 
218 aa  47.4  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  21.43 
 
 
543 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2206  transport-associated protein  25.58 
 
 
195 aa  47  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  26 
 
 
192 aa  46.2  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  24.2 
 
 
279 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  28.37 
 
 
215 aa  45.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6457  transport-associated  30.88 
 
 
136 aa  45.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591912  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2170  transport-associated  33.73 
 
 
104 aa  45.1  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.395466  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1372  transport-associated  30.88 
 
 
136 aa  45.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3263  transport-associated protein  26.8 
 
 
272 aa  45.1  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369629  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3575  transport-associated protein  29.73 
 
 
220 aa  43.9  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.913691  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0449  hypothetical protein  27.75 
 
 
183 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1123  hypothetical protein  21.94 
 
 
191 aa  43.9  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3989  transport-associated  24.77 
 
 
136 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.279726  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0477  transport-associated  24.32 
 
 
103 aa  43.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3696  transport-associated  21.48 
 
 
192 aa  43.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.148519  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0425  hypothetical protein  26.28 
 
 
183 aa  43.5  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1310  transport-associated  26.43 
 
 
179 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0905482  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4378  transport-associated  24.77 
 
 
136 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.294226  normal  0.933336 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5977  transport-associated  26.17 
 
 
136 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663122  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6049  transport-associated  30.88 
 
 
134 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0480722 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0149  transport-associated  27.33 
 
 
273 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01237  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  25 
 
 
175 aa  42.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.315155  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0249  transport-associated  33.87 
 
 
189 aa  42.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0333  hypothetical protein  22.93 
 
 
279 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2920  hypothetical protein  35.82 
 
 
190 aa  42.4  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0472  hypothetical protein  21.29 
 
 
191 aa  42.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0536  hypothetical protein  21.29 
 
 
191 aa  42.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35439  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0932  transport-associated  24.48 
 
 
131 aa  42.4  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4133  transport-associated  26.61 
 
 
188 aa  42.4  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5453  transport-associated protein  28.57 
 
 
134 aa  42.4  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.627587  hitchhiker  0.00543554 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3063  hypothetical protein  35.82 
 
 
190 aa  42  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0270  transport-associated  28.77 
 
 
191 aa  42  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000691335  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  24.1 
 
 
276 aa  41.6  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3178  putative phospholipid-binding protein  30.99 
 
 
256 aa  41.2  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1744  putative phospholipid-binding protein  30.99 
 
 
256 aa  41.2  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2799  transporter, putative  30.99 
 
 
266 aa  41.2  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00116321  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  24.71 
 
 
171 aa  41.2  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0039  phospholipid-binding domain-containing protein  30.99 
 
 
266 aa  41.2  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6387  transport-associated  28.57 
 
 
134 aa  41.2  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.508762 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0022  putative phospholipid-binding protein  30.99 
 
 
266 aa  41.2  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0386174  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  24.71 
 
 
171 aa  41.2  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5639  transport-associated  28.57 
 
 
134 aa  41.2  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3898  putative phospholipid-binding protein  30.99 
 
 
266 aa  41.2  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3817  putative phospholipid-binding protein  30.99 
 
 
266 aa  41.2  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262069  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3995  transport-associated  26.17 
 
 
182 aa  41.2  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000543546  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001941  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  23.84 
 
 
183 aa  40.8  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>