87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0735 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0718  transport-associated  100 
 
 		 121 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523753  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0735  transport-associated  100 
 
 		 121 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.106493 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2545  transport-associated protein  87.6 
 
 		 120 aa  184  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.899169 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0839  transport-associated  92.56 
 
 		 121 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0811  transport-associated  92.56 
 
 		 121 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0356  transport-associated  92.56 
 
 		 121 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29049  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3931  transport-associated protein  86.78 
 
 		 121 aa  159  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0118237 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2719  transport-associated domain-containing protein  70.67 
 
 		 221 aa  114  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3148  putative phospholipid-binding protein  70.67 
 
 		 294 aa  114  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2029  transport-associated domain-containing protein  70.67 
 
 		 221 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.168793  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0885  transport-associated domain-containing protein  59.84 
 
 		 122 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3185  transport-associated domain-containing protein  59.84 
 
 		 122 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0627443  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1891  putative phospholipid-binding protein  59.84 
 
 		 122 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944608  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3201  phospholipid-binding domain-containing protein  69.33 
 
 		 221 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1419  transport-associated domain-containing protein  56.56 
 
 		 222 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1624  putative phospholipid-binding protein  53.28 
 
 		 119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0267001  normal  0.292905 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5031  transport-associated  51.64 
 
 		 119 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677375 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2416  transport-associated  54.29 
 
 		 118 aa  103  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3880  putative periplasmic protein  59.68 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0799  transport-associated  54.84 
 
 		 117 aa  97.1  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3244  transport-associated  47.93 
 
 		 118 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.688311  normal  0.631575 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4015  transport-associated  47.12 
 
 		 118 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1679  transport-associated protein  56.16 
 
 		 118 aa  85.5  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.3238  normal  0.893681 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5879  transport-associated  42.37 
 
 		 115 aa  84.3  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4971  transport-associated  47.42 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314311  normal  0.115696 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5640  transport-associated  46.15 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4984  transport-associated  49.44 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0812534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2719  putative phospholipid-binding protein  46.36 
 
 		 116 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0383  phospholipid binding protein  36.36 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2456  transport-associated protein  38.67 
 
 		 84 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5938  transport-associated  40.62 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483865  normal  0.018454 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6356  transport-associated  39.2 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.802203  normal  0.334542 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4236  transport-associated protein  39.17 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5211  transport-associated  35.48 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0618952  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5648  transport-associated  35.48 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0978596  normal  0.176508 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3885  transport-associated  33.06 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.225437 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5086  transport-associated  32.23 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3177  transport-associated  32.23 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944582  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5191  transport-associated  32.23 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696153 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3026  transport-associated protein  37.72 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311021  normal  0.461623 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1716  periplasmic phospholipid binding protein  33.06 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.547226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2480  transport-associated protein  37.5 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.567161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0122  transport-associated  37.29 
 
 		 200 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4223  transport-associated protein  40 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3270  transport-associated  36.7 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21303  normal  0.821762 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  34.17 
 
 		 201 aa  47  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  34.17 
 
 		 201 aa  47  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  34.17 
 
 		 201 aa  47  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  35.25 
 
 		 201 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  34.17 
 
 		 201 aa  47  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  34.17 
 
 		 201 aa  47  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  34.17 
 
 		 201 aa  47  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  34.17 
 
 		 201 aa  47  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3042  hypothetical protein  46.77 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.224721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  30.36 
 
 		 204 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  30.36 
 
 		 204 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  30.36 
 
 		 204 aa  45.1  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0141  transport-associated  30.23 
 
 		 309 aa  44.7  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  35.96 
 
 		 205 aa  44.7  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  34.45 
 
 		 205 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  34.45 
 
 		 205 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  34.45 
 
 		 205 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  34.45 
 
 		 205 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  34.45 
 
 		 205 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4342  hypothetical protein  39.13 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5837  hypothetical protein  39.13 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5023  hypothetical protein  39.13 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226696  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  32.5 
 
 		 201 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4238  transport-associated protein  30.67 
 
 		 244 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.248738  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3429  transport-associated protein  36.78 
 
 		 412 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.389194  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3027  phospholipid-binding domain-containing protein  36.67 
 
 		 184 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119447  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3156  phospholipid-binding domain-containing protein  36.67 
 
 		 246 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0915  transport-associated  42.62 
 
 		 165 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.629645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1376  osmotically inducible protein Y  36.67 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0948  transport-associated  55 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0063  transport-associated  31.25 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37402  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5083  transport-associated protein  42.22 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  51.16 
 
 		 218 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  48.84 
 
 		 202 aa  40.8  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4411  transport-associated  35.71 
 
 		 244 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1642  putative periplasmic protein  43.14 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  32.91 
 
 		 543 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  38.3 
 
 		 199 aa  40.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  48.84 
 
 		 202 aa  40.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5453  transport-associated protein  37.25 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.627587  hitchhiker  0.00543554 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6440  transport-associated  39.22 
 
 		 287 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1389  transport-associated  39.22 
 
 		 287 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0291894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>