56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4342 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4342  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  248  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5837  hypothetical protein  94.66 
 
 
125 aa  184  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5023  hypothetical protein  94.66 
 
 
125 aa  184  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226696  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3042  hypothetical protein  67.13 
 
 
142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.224721  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6500  hypothetical protein  41.54 
 
 
129 aa  87  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.193571  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5747  hypothetical protein  47.83 
 
 
129 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.401679  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5086  transport-associated  45 
 
 
123 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5191  transport-associated  45 
 
 
123 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00696153 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3177  transport-associated  45 
 
 
123 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944582  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4015  transport-associated  40.21 
 
 
118 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5879  transport-associated  36.84 
 
 
115 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5640  transport-associated  44.21 
 
 
117 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3026  transport-associated protein  38 
 
 
124 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311021  normal  0.461623 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3270  transport-associated  38.53 
 
 
139 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21303  normal  0.821762 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3244  transport-associated  36.72 
 
 
118 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.688311  normal  0.631575 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1679  transport-associated protein  42.67 
 
 
118 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.3238  normal  0.893681 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1716  periplasmic phospholipid binding protein  36.97 
 
 
121 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.547226  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5648  transport-associated  35.05 
 
 
123 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0978596  normal  0.176508 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0122  transport-associated  40.22 
 
 
200 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5211  transport-associated  35.05 
 
 
123 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0618952  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4971  transport-associated  41.33 
 
 
115 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314311  normal  0.115696 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5938  transport-associated  38.04 
 
 
124 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483865  normal  0.018454 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6356  transport-associated  36.07 
 
 
125 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.802203  normal  0.334542 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2416  transport-associated  37.35 
 
 
118 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1119  putative phophoslipid binding protein  28 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000111186 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1624  putative phospholipid-binding protein  39.51 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0267001  normal  0.292905 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3885  transport-associated  38.46 
 
 
135 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.225437 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3185  transport-associated domain-containing protein  34.92 
 
 
122 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0627443  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1891  putative phospholipid-binding protein  34.92 
 
 
122 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944608  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0885  transport-associated domain-containing protein  34.92 
 
 
122 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1419  transport-associated domain-containing protein  41.03 
 
 
222 aa  47  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2545  transport-associated protein  36.25 
 
 
120 aa  47  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.899169 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5031  transport-associated  39.18 
 
 
119 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.677375 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2719  putative phospholipid-binding protein  43.24 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3148  putative phospholipid-binding protein  39.74 
 
 
294 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2719  transport-associated domain-containing protein  39.24 
 
 
221 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2029  transport-associated domain-containing protein  39.24 
 
 
221 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.168793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3201  phospholipid-binding domain-containing protein  35.71 
 
 
221 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2456  transport-associated protein  36.9 
 
 
84 aa  43.5  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148047  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1844  transport-associated  35.21 
 
 
235 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2480  transport-associated protein  36.71 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.567161  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0735  transport-associated  41.94 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.106493 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3027  phospholipid-binding domain-containing protein  34.15 
 
 
184 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119447  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3156  phospholipid-binding domain-containing protein  34.15 
 
 
246 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0718  transport-associated  41.94 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523753  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3880  putative periplasmic protein  39.13 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1376  osmotically inducible protein Y  34.15 
 
 
174 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0799  transport-associated  42.86 
 
 
117 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2956  transport-associated protein  30.84 
 
 
295 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5453  transport-associated protein  37.14 
 
 
134 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.627587  hitchhiker  0.00543554 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5898  transport-associated  33.33 
 
 
116 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  37.68 
 
 
205 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  37.68 
 
 
205 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  37.68 
 
 
205 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  37.68 
 
 
205 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  37.68 
 
 
205 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>