More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_655 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_655  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
473 aa  976    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00597549  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0677  putative GAF sensor protein  91.85 
 
 
466 aa  890    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000194317  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0749  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  93.64 
 
 
174 aa  336  5e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00900087  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0033  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
186 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0723  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.1 
 
 
178 aa  181  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0293167  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1636  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.76 
 
 
190 aa  179  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2376  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.43 
 
 
179 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00118053  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02170  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 
181 aa  177  3e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0351776  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1543  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.89 
 
 
176 aa  176  7e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2787  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.39 
 
 
183 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2473  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.99 
 
 
183 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0886  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.89 
 
 
182 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000644191  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12790  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.73 
 
 
184 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.370105  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0169  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.1 
 
 
174 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0321  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.41 
 
 
682 aa  173  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.124455 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0062  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
180 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0063  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
180 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
180 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
180 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0075  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
180 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0888602  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0059  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
180 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5245  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
180 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.706873 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0071  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
180 aa  171  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0072  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
180 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0063  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
179 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0140  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.48 
 
 
174 aa  171  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000569861  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1437  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
181 aa  171  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.55755e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2663  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
180 aa  171  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0107677 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0080  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.12 
 
 
181 aa  171  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.297539  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1672  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.65 
 
 
176 aa  171  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544224  normal  0.102762 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0792  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.41 
 
 
181 aa  171  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0512  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.29 
 
 
187 aa  171  4e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0701  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.4 
 
 
179 aa  170  5e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.482713 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1044  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.42 
 
 
186 aa  170  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.684921  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2896  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.93 
 
 
184 aa  169  7e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2786  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.84 
 
 
181 aa  169  8e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0223963  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2186  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.81 
 
 
189 aa  169  8e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.341617  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1428  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.84 
 
 
181 aa  169  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0375844 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3998  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.09 
 
 
178 aa  169  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0865  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.81 
 
 
676 aa  169  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000888188 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0131  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.17 
 
 
175 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0706154  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  47.31 
 
 
180 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0641  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.21 
 
 
177 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.801586  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0117  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.78 
 
 
177 aa  167  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2618  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.17 
 
 
176 aa  167  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4506  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.85 
 
 
189 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2148  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.95 
 
 
176 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3145  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.73 
 
 
176 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0822  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.73 
 
 
176 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3448  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.34 
 
 
182 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0793  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.73 
 
 
176 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35700  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.82 
 
 
184 aa  164  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.175987  normal  0.670419 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2897  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.41 
 
 
180 aa  164  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1154  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.48 
 
 
178 aa  164  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3124  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.48 
 
 
178 aa  164  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0134  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.29 
 
 
175 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309601  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0145  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.29 
 
 
175 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9176  Hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.37 
 
 
180 aa  163  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0577662  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0015  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  44.91 
 
 
180 aa  163  5.0000000000000005e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4969  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.37 
 
 
179 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.187483 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0185  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.27 
 
 
178 aa  163  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0734521  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0194  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.27 
 
 
178 aa  163  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.99214  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0530  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.51 
 
 
190 aa  163  8.000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.185084  normal  0.0224456 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0186  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.27 
 
 
178 aa  163  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.186171  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0189  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.27 
 
 
178 aa  163  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0202  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.27 
 
 
178 aa  163  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1323  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.18 
 
 
176 aa  162  1e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0360186 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1913  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
181 aa  162  1e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2829  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.27 
 
 
177 aa  161  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.472087  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0127  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.71 
 
 
175 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594897  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2835  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.15 
 
 
175 aa  162  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3803  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.12 
 
 
176 aa  161  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0626  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.39 
 
 
184 aa  160  3e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0463  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.24 
 
 
179 aa  160  3e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143113  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3351  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.27 
 
 
181 aa  160  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00328622  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3479  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.27 
 
 
181 aa  160  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8427  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.59 
 
 
179 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3435  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.94 
 
 
188 aa  160  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121685  normal  0.0247328 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1019  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.27 
 
 
181 aa  160  5e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2106  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.31 
 
 
181 aa  160  6e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0971806  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2230  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.63 
 
 
179 aa  160  6e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.912712  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0013  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  41.92 
 
 
180 aa  160  6e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03458  hypothetical protein  46.95 
 
 
176 aa  160  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002554  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  47.85 
 
 
169 aa  159  7e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0199  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.11 
 
 
180 aa  159  8e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0299222  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0084  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.3 
 
 
179 aa  159  8e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0216938  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3910  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
176 aa  159  8e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.835811  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0299  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.78 
 
 
608 aa  159  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.347067 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0829  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.12 
 
 
176 aa  159  9e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0673  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.06 
 
 
178 aa  159  9e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.959091  normal  0.12012 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01220  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.09 
 
 
183 aa  159  9e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00570  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.7 
 
 
186 aa  159  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00463004  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3713  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.51 
 
 
190 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3818  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.56 
 
 
176 aa  159  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.76085 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0129  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.06 
 
 
178 aa  158  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.49178  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3590  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.51 
 
 
176 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0169693  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0688  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.73 
 
 
177 aa  158  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0311  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.12 
 
 
183 aa  158  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0133  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.06 
 
 
178 aa  158  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0127  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.06 
 
 
178 aa  158  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>