More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0321 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0321  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
682 aa  1357    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.124455 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0865  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  79.24 
 
 
676 aa  1018    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000888188 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3027  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  43.43 
 
 
486 aa  321  3e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00722625  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2663  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  76.97 
 
 
180 aa  290  8e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0107677 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2662  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  43.29 
 
 
474 aa  280  8e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0298541 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0086  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.55 
 
 
470 aa  254  3e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2060  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.6 
 
 
471 aa  250  8e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0862311  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0104  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  37.17 
 
 
455 aa  250  8e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192858  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1229  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.24 
 
 
476 aa  249  1e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2255  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.43 
 
 
470 aa  247  6e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000164425  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1203  PP-loop  34.18 
 
 
476 aa  242  2e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1421  PP-loop family protein  33.75 
 
 
470 aa  231  3e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4506  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  61.29 
 
 
189 aa  230  7e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0228  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.07 
 
 
473 aa  229  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2376  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  56.67 
 
 
179 aa  226  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00118053  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3028  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  61.8 
 
 
180 aa  224  4e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133397  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0094  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.97 
 
 
454 aa  223  8e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3448  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  61.45 
 
 
182 aa  221  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0792  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  64 
 
 
181 aa  221  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0791  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.17 
 
 
458 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000325177  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2186  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  60.11 
 
 
189 aa  218  4e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.341617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9176  Hypoxanthine phosphoribosyltransferase  58.99 
 
 
180 aa  217  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0577662  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2735  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.47 
 
 
459 aa  213  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000920326  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0033  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.8 
 
 
186 aa  212  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2788  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.6 
 
 
469 aa  211  3e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1891  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  36.73 
 
 
468 aa  211  4e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000460009  hitchhiker  0.0000000000638883 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2474  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.75 
 
 
469 aa  210  5e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0723  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  58.99 
 
 
178 aa  209  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0293167  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0058  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.57 
 
 
476 aa  209  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1810  cell cycle protein MesJ, putative  34.29 
 
 
471 aa  209  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0106411  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0530  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  57.14 
 
 
190 aa  208  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.185084  normal  0.0224456 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0626  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  57.14 
 
 
184 aa  208  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1437  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.56 
 
 
181 aa  208  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.55755e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0062  hypothetical protein  28.8 
 
 
476 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0062  hypothetical protein  28.8 
 
 
476 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223025  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0071  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.8 
 
 
476 aa  207  4e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0058  cell cycle protein  28.8 
 
 
476 aa  207  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2896  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  60.47 
 
 
184 aa  207  5e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02170  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  56.18 
 
 
181 aa  206  1e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0351776  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5246  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.64 
 
 
476 aa  206  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.320432  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0058  cell cycle protein  28.4 
 
 
476 aa  204  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0701  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  56.11 
 
 
179 aa  204  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.482713 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0074  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.86 
 
 
476 aa  204  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0125987  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0061  hypothetical protein  27.66 
 
 
476 aa  204  6e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.625972  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00560  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.6 
 
 
468 aa  203  8e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0427403  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2787  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.96 
 
 
183 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2473  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.51 
 
 
183 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2897  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  54.44 
 
 
180 aa  202  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4969  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55 
 
 
179 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.187483 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0068  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.1 
 
 
480 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.552857  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0070  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.36 
 
 
476 aa  201  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2105  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  57.95 
 
 
183 aa  201  3.9999999999999996e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5245  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  54.7 
 
 
180 aa  200  6e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.706873 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0071  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  54.7 
 
 
180 aa  200  7e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1594  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.55 
 
 
457 aa  200  7.999999999999999e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00570  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.4 
 
 
186 aa  200  9e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00463004  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3435  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  59.64 
 
 
188 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121685  normal  0.0247328 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35700  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  58.89 
 
 
184 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.175987  normal  0.670419 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12790  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  56.74 
 
 
184 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.370105  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01220  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  54.44 
 
 
183 aa  199  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0059  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  54.14 
 
 
180 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0311  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  56.57 
 
 
183 aa  199  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0062  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  54.14 
 
 
180 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0075  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  54.14 
 
 
180 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0888602  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0063  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  54.14 
 
 
180 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  54.14 
 
 
180 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  54.14 
 
 
180 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  53.59 
 
 
180 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0063  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  54.14 
 
 
179 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2988  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  57.14 
 
 
183 aa  197  5.000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0150  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  56 
 
 
183 aa  197  5.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0058  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.66 
 
 
476 aa  197  7e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0169  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.02 
 
 
174 aa  197  7e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13655  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  60.22 
 
 
216 aa  197  8.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0149578  hitchhiker  0.000159475 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0443  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  54.49 
 
 
183 aa  197  8.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.939378  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0072  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.59 
 
 
180 aa  196  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0199  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.67 
 
 
180 aa  195  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0299222  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2248  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.12 
 
 
485 aa  194  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000793902  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0615  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.98 
 
 
195 aa  194  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1636  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.62 
 
 
190 aa  194  4e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0079  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.5 
 
 
509 aa  194  5e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32100  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.06 
 
 
184 aa  193  9e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.918593  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0062  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.36 
 
 
462 aa  193  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0340332  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0080  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.37 
 
 
181 aa  193  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.297539  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4745  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.26 
 
 
190 aa  192  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.587694  decreased coverage  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1265  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.55 
 
 
470 aa  191  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.265542  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2640  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.69 
 
 
457 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1913  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.49 
 
 
181 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03458  hypothetical protein  55.15 
 
 
176 aa  191  5e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4309  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.72 
 
 
190 aa  191  5e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0523048 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24790  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  54.4 
 
 
183 aa  190  5.999999999999999e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0013  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.96 
 
 
180 aa  190  5.999999999999999e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0083  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.78 
 
 
481 aa  190  5.999999999999999e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.24629  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0125  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.02 
 
 
472 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002554  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  55.83 
 
 
169 aa  190  7e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02020  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.96 
 
 
199 aa  190  7e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000199226  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4775  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  60 
 
 
211 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4861  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  60 
 
 
211 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196918  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5377  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  59.67 
 
 
194 aa  189  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5161  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  60 
 
 
211 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.571818  normal  0.392124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>