More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2787 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2787  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
183 aa  362  1e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2473  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  98.91 
 
 
183 aa  360  8e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02170  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.67 
 
 
181 aa  221  3e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0351776  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2376  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.75 
 
 
179 aa  218  6e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00118053  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4506  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.33 
 
 
189 aa  215  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9176  Hypoxanthine phosphoribosyltransferase  54.86 
 
 
180 aa  214  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0577662  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2896  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  54.44 
 
 
184 aa  214  5.9999999999999996e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0626  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.89 
 
 
184 aa  213  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3448  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.17 
 
 
182 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0080  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  57.54 
 
 
181 aa  212  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.297539  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1437  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  56.74 
 
 
181 aa  211  3.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.55755e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00570  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  57.06 
 
 
186 aa  211  3.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00463004  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2663  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.06 
 
 
180 aa  209  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0107677 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2835  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  58.48 
 
 
175 aa  208  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2186  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  56.82 
 
 
189 aa  208  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.341617  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0723  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  56.74 
 
 
178 aa  207  6e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0293167  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0140  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  56.8 
 
 
174 aa  206  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000569861  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0199  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  54.24 
 
 
180 aa  206  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0299222  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2897  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.67 
 
 
180 aa  205  3e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2988  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.51 
 
 
183 aa  204  6e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2106  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  58.66 
 
 
181 aa  204  7e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0971806  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1672  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 
176 aa  203  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544224  normal  0.102762 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0701  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.7 
 
 
179 aa  202  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.482713 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0443  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.51 
 
 
183 aa  202  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.939378  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0033  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.54 
 
 
186 aa  201  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32100  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.71 
 
 
184 aa  201  4e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.918593  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0013  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52.51 
 
 
180 aa  201  4e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2105  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.14 
 
 
183 aa  200  7e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0311  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.69 
 
 
183 aa  200  8e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0545  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.06 
 
 
179 aa  200  8e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.176774  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0532  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.06 
 
 
179 aa  200  8e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.187289  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24790  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.56 
 
 
183 aa  200  9.999999999999999e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0615  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.14 
 
 
195 aa  199  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1636  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  54.19 
 
 
190 aa  199  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0150  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.12 
 
 
183 aa  199  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0015  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.96 
 
 
180 aa  198  3.9999999999999996e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0530  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.43 
 
 
190 aa  197  7e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.185084  normal  0.0224456 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4969  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.3 
 
 
179 aa  197  7.999999999999999e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.187483 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0169  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.76 
 
 
174 aa  196  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01220  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.56 
 
 
183 aa  195  3e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0107  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.11 
 
 
182 aa  194  4.0000000000000005e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.576089 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0149  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.68 
 
 
179 aa  194  5.000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0641  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  57.06 
 
 
177 aa  194  5.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.801586  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4309  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.28 
 
 
190 aa  194  8.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0523048 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0063  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  54.75 
 
 
181 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000259815  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0792  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  56 
 
 
181 aa  193  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8427  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.14 
 
 
179 aa  193  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5245  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.12 
 
 
180 aa  192  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.706873 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1606  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  57.31 
 
 
180 aa  192  2e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.126532  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.12 
 
 
180 aa  192  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0071  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.12 
 
 
180 aa  192  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0059  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.12 
 
 
180 aa  191  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0061  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  54.75 
 
 
181 aa  192  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0084  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.11 
 
 
179 aa  191  6e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0216938  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4745  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.72 
 
 
190 aa  191  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.587694  decreased coverage  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0072  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.12 
 
 
180 aa  190  8e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0062  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.12 
 
 
180 aa  190  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0063  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.12 
 
 
180 aa  190  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.12 
 
 
180 aa  190  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.12 
 
 
180 aa  190  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0075  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.12 
 
 
180 aa  190  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0888602  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0063  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.12 
 
 
179 aa  190  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12790  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.43 
 
 
184 aa  189  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.370105  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0321  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.96 
 
 
682 aa  187  9e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.124455 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0203  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.28 
 
 
184 aa  186  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.727257  normal  0.158525 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4712  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.43 
 
 
183 aa  185  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1323  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 
176 aa  185  3e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0360186 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5074  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.43 
 
 
183 aa  185  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2254  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.84 
 
 
184 aa  185  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000437646  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2148  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.29 
 
 
176 aa  185  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0865  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.84 
 
 
676 aa  184  8e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000888188 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4551  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.84 
 
 
175 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4937  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.84 
 
 
175 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1588  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.31 
 
 
175 aa  183  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0117  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.12 
 
 
177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4975  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.84 
 
 
175 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4569  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.84 
 
 
175 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0834  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.12 
 
 
195 aa  182  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.258272  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0297  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.84 
 
 
175 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4942  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.84 
 
 
175 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1913  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.42 
 
 
181 aa  182  3e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02020  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.09 
 
 
199 aa  181  4.0000000000000006e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000199226  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4651  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48 
 
 
175 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4958  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.26 
 
 
175 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1746  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.61 
 
 
172 aa  181  6e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.477142  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0299  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
608 aa  181  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.347067 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3028  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.89 
 
 
180 aa  181  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133397  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1785  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.22 
 
 
179 aa  180  9.000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.128209  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3479  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  47.95 
 
 
176 aa  180  9.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3058  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
172 aa  180  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342631  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0886  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.71 
 
 
182 aa  180  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000644191  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1044  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.8 
 
 
186 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.684921  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03458  hypothetical protein  52.12 
 
 
176 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3477  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.3 
 
 
182 aa  178  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1428  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.8 
 
 
181 aa  178  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0375844 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2786  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.8 
 
 
181 aa  178  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0223963  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2829  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.6 
 
 
177 aa  178  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.472087  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3534  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.3 
 
 
182 aa  178  4e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0127  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
175 aa  178  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594897  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0134  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.53 
 
 
175 aa  177  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>