More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1606 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1606  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
180 aa  357  6e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.126532  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0199  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  57.14 
 
 
180 aa  213  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0299222  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5245  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  57.8 
 
 
180 aa  204  5e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.706873 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0071  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  57.23 
 
 
180 aa  204  6e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2473  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  57.89 
 
 
183 aa  203  8e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0059  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  57.8 
 
 
180 aa  203  9e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2787  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  57.31 
 
 
183 aa  203  9e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0072  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  57.23 
 
 
180 aa  202  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0075  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  57.23 
 
 
180 aa  202  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0888602  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0062  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  57.23 
 
 
180 aa  202  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0063  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  57.23 
 
 
180 aa  202  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  57.23 
 
 
180 aa  202  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  57.23 
 
 
180 aa  202  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0063  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  57.23 
 
 
179 aa  202  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0015  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  55.43 
 
 
180 aa  201  3e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0013  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  53.71 
 
 
180 aa  201  5e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  56.4 
 
 
180 aa  201  6e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2376  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.86 
 
 
179 aa  191  5e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00118053  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0063  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  58.86 
 
 
181 aa  190  8e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000259815  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2148  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.12 
 
 
176 aa  189  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0061  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  58.29 
 
 
181 aa  188  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0545  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52 
 
 
179 aa  187  7e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.176774  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0532  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52 
 
 
179 aa  187  7e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.187289  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0140  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.66 
 
 
174 aa  187  7e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000569861  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0080  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.89 
 
 
181 aa  184  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.297539  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0117  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
177 aa  184  5e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0403  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.37 
 
 
179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000407024  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0149  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 
179 aa  182  3e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0267  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.84 
 
 
180 aa  182  3e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02170  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.28 
 
 
181 aa  181  4.0000000000000006e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0351776  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0311  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.79 
 
 
183 aa  181  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1437  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.43 
 
 
181 aa  181  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.55755e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2186  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
189 aa  181  6e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.341617  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0150  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.19 
 
 
183 aa  179  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0017  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  56.49 
 
 
183 aa  179  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2835  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  54.22 
 
 
175 aa  178  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0329  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.5 
 
 
178 aa  178  4e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2896  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.16 
 
 
184 aa  177  4.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0135  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.11 
 
 
178 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2663  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.43 
 
 
180 aa  177  5.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0107677 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1785  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.09 
 
 
179 aa  177  5.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.128209  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12790  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.84 
 
 
184 aa  177  5.999999999999999e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.370105  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0701  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 
179 aa  177  8e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.482713 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00124  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.11 
 
 
178 aa  177  9e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03458  hypothetical protein  50 
 
 
176 aa  177  9e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0127  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.11 
 
 
178 aa  177  9e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0133  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.11 
 
 
178 aa  177  9e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0129  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.11 
 
 
178 aa  177  9e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.49178  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00123  hypothetical protein  49.11 
 
 
178 aa  177  9e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0118  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.11 
 
 
178 aa  177  9e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3477  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.11 
 
 
182 aa  177  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2897  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.63 
 
 
180 aa  176  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3534  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.11 
 
 
182 aa  177  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3713  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.62 
 
 
190 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0186  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
178 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.186171  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0185  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
178 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0734521  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0673  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.11 
 
 
178 aa  176  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.959091  normal  0.12012 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0189  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
178 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0202  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
178 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0194  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
178 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.99214  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3590  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.62 
 
 
176 aa  175  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0169693  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3521  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.62 
 
 
176 aa  175  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241179  hitchhiker  0.00357405 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0721  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.62 
 
 
176 aa  175  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.59238  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2829  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.26 
 
 
177 aa  174  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.472087  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3998  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.52 
 
 
178 aa  174  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0829  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.62 
 
 
176 aa  174  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1368  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
180 aa  174  6e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282504  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3448  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
182 aa  174  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0792  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.42 
 
 
181 aa  174  7e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3145  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.62 
 
 
176 aa  174  7e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0822  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.62 
 
 
176 aa  174  7e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0793  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.62 
 
 
176 aa  174  7e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1581  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.92 
 
 
178 aa  174  7e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.435118  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1543  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.16 
 
 
176 aa  174  8e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002554  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50.31 
 
 
169 aa  174  8e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4975  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.47 
 
 
175 aa  173  9e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4569  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.47 
 
 
175 aa  173  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9176  Hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.84 
 
 
180 aa  174  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0577662  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4937  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.47 
 
 
175 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4712  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.47 
 
 
183 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4551  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.47 
 
 
175 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5074  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.47 
 
 
183 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00570  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.31 
 
 
186 aa  173  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00463004  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0187  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.82 
 
 
181 aa  173  9.999999999999999e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4958  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.88 
 
 
175 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2786  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.41 
 
 
181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0223963  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2988  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1133  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0688  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1428  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.41 
 
 
181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0375844 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3351  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.93 
 
 
181 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00328622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4651  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.47 
 
 
175 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3479  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.93 
 
 
181 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0216  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
190 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3124  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.09 
 
 
178 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1019  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.93 
 
 
181 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1154  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.09 
 
 
178 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0169  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.24 
 
 
174 aa  171  3.9999999999999995e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4942  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.88 
 
 
175 aa  171  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2254  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 
184 aa  171  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000437646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>