More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0443 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0443  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
183 aa  372  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.939378  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3448  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  73.14 
 
 
182 aa  273  8e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0311  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  70.33 
 
 
183 aa  272  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0150  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  69.78 
 
 
183 aa  270  7e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9176  Hypoxanthine phosphoribosyltransferase  71.02 
 
 
180 aa  268  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0577662  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4506  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  70.22 
 
 
189 aa  268  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01220  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  68.85 
 
 
183 aa  267  7e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0626  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  69.95 
 
 
184 aa  261  3e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2988  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  68.31 
 
 
183 aa  258  2e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2896  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  68.68 
 
 
184 aa  258  3e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0530  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  66.85 
 
 
190 aa  255  3e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.185084  normal  0.0224456 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32100  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  69.89 
 
 
184 aa  253  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.918593  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2105  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  65.54 
 
 
183 aa  248  3e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24790  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  63.39 
 
 
183 aa  243  9.999999999999999e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4969  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  67.82 
 
 
179 aa  243  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.187483 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8427  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  65.91 
 
 
179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0701  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  64.57 
 
 
179 aa  234  4e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.482713 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12790  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  62.09 
 
 
184 aa  225  3e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.370105  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4745  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  59.34 
 
 
190 aa  217  8.999999999999998e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.587694  decreased coverage  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0615  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  62.86 
 
 
195 aa  216  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4309  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  58.79 
 
 
190 aa  215  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0523048 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2663  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  58.99 
 
 
180 aa  211  4.9999999999999996e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0107677 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02170  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.93 
 
 
181 aa  209  2e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0351776  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2376  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.23 
 
 
179 aa  208  4e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00118053  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2897  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.78 
 
 
180 aa  206  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2186  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  57.78 
 
 
189 aa  203  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.341617  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2787  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.51 
 
 
183 aa  202  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2473  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.96 
 
 
183 aa  202  3e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0203  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  59.89 
 
 
184 aa  202  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.727257  normal  0.158525 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35700  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  60.77 
 
 
184 aa  200  8e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.175987  normal  0.670419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0834  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  58.76 
 
 
195 aa  196  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.258272  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0311  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  60.34 
 
 
182 aa  196  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0847  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  54.24 
 
 
222 aa  194  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5161  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  59.79 
 
 
211 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.571818  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4775  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  59.79 
 
 
211 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4861  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  59.79 
 
 
211 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196918  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0299  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  57.71 
 
 
608 aa  194  7e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.347067 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4019  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  60.67 
 
 
224 aa  193  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13655  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  59.34 
 
 
216 aa  192  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0149578  hitchhiker  0.000159475 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0556  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  60.67 
 
 
188 aa  192  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.600381  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2835  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  57.58 
 
 
175 aa  191  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1412  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  57.75 
 
 
191 aa  190  8e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5055 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5377  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  59.22 
 
 
194 aa  189  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013711 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0723  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  57.14 
 
 
178 aa  189  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0293167  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1437  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.25 
 
 
181 aa  188  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.55755e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3028  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.98 
 
 
180 aa  187  8e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133397  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4313  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  59.65 
 
 
595 aa  186  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0033  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.72 
 
 
186 aa  186  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0545  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.81 
 
 
179 aa  184  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.176774  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0532  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.81 
 
 
179 aa  184  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.187289  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0071  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.12 
 
 
180 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0075  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.12 
 
 
180 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0888602  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0062  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.12 
 
 
180 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0063  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.12 
 
 
180 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.12 
 
 
180 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.12 
 
 
180 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0059  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.12 
 
 
180 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0063  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.12 
 
 
179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0072  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.12 
 
 
180 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5245  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.12 
 
 
180 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.706873 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50.56 
 
 
180 aa  182  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0013  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  47.75 
 
 
180 aa  181  3e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0321  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  54.49 
 
 
682 aa  181  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.124455 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0792  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.27 
 
 
181 aa  181  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0107  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
182 aa  181  6e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.576089 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1913  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.52 
 
 
181 aa  181  7e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0865  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.25 
 
 
676 aa  181  7e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000888188 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0015  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.31 
 
 
180 aa  180  1e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0080  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.61 
 
 
181 aa  179  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.297539  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0149  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.25 
 
 
179 aa  177  4.999999999999999e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1672  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.8 
 
 
176 aa  176  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544224  normal  0.102762 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00570  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.56 
 
 
186 aa  176  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00463004  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1847  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
187 aa  176  2e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2106  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.11 
 
 
181 aa  174  8e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0971806  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02020  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.16 
 
 
199 aa  174  8e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000199226  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1636  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
190 aa  173  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0169  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.78 
 
 
174 aa  171  3.9999999999999995e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2254  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.43 
 
 
184 aa  171  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000437646  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0199  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.29 
 
 
180 aa  171  5.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0299222  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1133  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
186 aa  170  1e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0063  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
181 aa  169  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000259815  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03458  hypothetical protein  50.29 
 
 
176 aa  169  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0886  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.91 
 
 
182 aa  168  5e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000644191  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3998  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.11 
 
 
178 aa  167  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0084  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.26 
 
 
179 aa  167  9e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0216938  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2829  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.67 
 
 
177 aa  166  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.472087  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3435  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.56 
 
 
188 aa  166  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121685  normal  0.0247328 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0847  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.82 
 
 
179 aa  166  2e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00021639  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2148  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.83 
 
 
176 aa  166  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4651  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.83 
 
 
175 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0061  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.88 
 
 
181 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3058  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.9 
 
 
172 aa  165  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342631  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0140  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.9 
 
 
174 aa  165  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000569861  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0117  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.82 
 
 
177 aa  164  5e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00124  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
178 aa  164  9e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3477  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
182 aa  164  9e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0118  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
178 aa  164  9e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0127  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
178 aa  164  9e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00123  hypothetical protein  49.7 
 
 
178 aa  164  9e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3534  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
182 aa  164  9e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>