More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2254 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2254  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
184 aa  363  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000437646  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0084  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  68.18 
 
 
179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0216938  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0080  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  61.59 
 
 
181 aa  215  2.9999999999999998e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.297539  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2376  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.54 
 
 
179 aa  208  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00118053  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2186  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.81 
 
 
189 aa  206  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.341617  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2106  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  56.35 
 
 
181 aa  204  4e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0971806  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2663  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.93 
 
 
180 aa  203  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0107677 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1437  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.33 
 
 
181 aa  202  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.55755e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4651  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  57.32 
 
 
175 aa  202  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0033  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.93 
 
 
186 aa  201  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2787  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.45 
 
 
183 aa  201  7e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4975  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  56.71 
 
 
175 aa  200  8e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4569  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  56.71 
 
 
175 aa  200  8e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2473  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.45 
 
 
183 aa  200  8e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4937  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  56.71 
 
 
175 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4712  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  56.71 
 
 
183 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4551  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  56.71 
 
 
175 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4942  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  56.71 
 
 
175 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4958  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  56.1 
 
 
175 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5074  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  56.71 
 
 
183 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0297  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  56.71 
 
 
175 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00570  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.89 
 
 
186 aa  199  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00463004  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3479  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  53.67 
 
 
176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2835  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.49 
 
 
175 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3448  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.56 
 
 
182 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0792  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  59.43 
 
 
181 aa  197  6e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4506  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.02 
 
 
189 aa  197  7e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0641  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  60.23 
 
 
177 aa  196  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.801586  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0886  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  56.5 
 
 
182 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000644191  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0169  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  54.65 
 
 
174 aa  195  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9176  Hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.85 
 
 
180 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0577662  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1636  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.78 
 
 
190 aa  195  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01220  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.27 
 
 
183 aa  195  3e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1672  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.53 
 
 
176 aa  194  5.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544224  normal  0.102762 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1785  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  58.38 
 
 
179 aa  194  5.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.128209  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0140  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  56.32 
 
 
174 aa  194  5.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000569861  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2896  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.4 
 
 
184 aa  194  7e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0311  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 
183 aa  192  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4969  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.85 
 
 
179 aa  192  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.187483 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0723  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  54.49 
 
 
178 aa  191  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0293167  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0150  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.02 
 
 
183 aa  191  7e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0626  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.41 
 
 
184 aa  190  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02170  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.63 
 
 
181 aa  189  2e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0351776  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0530  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.43 
 
 
190 aa  189  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.185084  normal  0.0224456 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2988  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.3 
 
 
183 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0443  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.43 
 
 
183 aa  188  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.939378  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3028  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.84 
 
 
180 aa  188  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133397  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12790  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 
184 aa  187  5.999999999999999e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.370105  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5245  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.11 
 
 
180 aa  186  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.706873 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0071  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.11 
 
 
180 aa  186  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0329  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.44 
 
 
178 aa  186  2e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32100  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.87 
 
 
184 aa  186  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.918593  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0199  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
180 aa  186  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0299222  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0059  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.11 
 
 
180 aa  185  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2148  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.01 
 
 
176 aa  185  4e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0062  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.11 
 
 
180 aa  184  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0063  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.11 
 
 
180 aa  184  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.11 
 
 
180 aa  184  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.11 
 
 
180 aa  184  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0075  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.11 
 
 
180 aa  184  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0888602  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0072  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.11 
 
 
180 aa  184  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3058  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
172 aa  183  9e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342631  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0321  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.56 
 
 
682 aa  183  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.124455 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
180 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0063  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50.84 
 
 
179 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0865  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
676 aa  181  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000888188 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3435  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.54 
 
 
188 aa  181  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121685  normal  0.0247328 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0117  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.85 
 
 
177 aa  181  7e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0532  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.16 
 
 
179 aa  181  7e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.187289  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0545  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.16 
 
 
179 aa  181  7e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.176774  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03458  hypothetical protein  52.47 
 
 
176 aa  179  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2547  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.72 
 
 
183 aa  179  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  9.49891e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0701  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.75 
 
 
179 aa  179  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.482713 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8427  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.63 
 
 
179 aa  179  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0847  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.16 
 
 
179 aa  178  4e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00021639  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1588  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.75 
 
 
175 aa  177  5.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3233  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.62 
 
 
176 aa  176  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159861  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2105  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.63 
 
 
183 aa  175  3e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3803  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.9 
 
 
176 aa  175  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0061  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.85 
 
 
181 aa  175  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3145  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.9 
 
 
176 aa  175  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0822  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.9 
 
 
176 aa  175  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1543  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
176 aa  175  3e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0793  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.9 
 
 
176 aa  175  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1913  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.78 
 
 
181 aa  175  4e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24790  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.33 
 
 
183 aa  174  5e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002554  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.25 
 
 
169 aa  174  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2618  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.85 
 
 
176 aa  174  5e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0829  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
176 aa  174  6e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3998  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.48 
 
 
178 aa  174  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0463  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.69 
 
 
179 aa  174  7e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143113  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2829  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 
177 aa  174  8e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.472087  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0107  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.57 
 
 
182 aa  174  9e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.576089 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0013  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
180 aa  174  9e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0015  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  47.73 
 
 
180 aa  173  9.999999999999999e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1019  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.06 
 
 
181 aa  173  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0673  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.48 
 
 
178 aa  173  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.959091  normal  0.12012 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3713  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.9 
 
 
190 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0512  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 
187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0721  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.9 
 
 
176 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.59238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>