More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0173 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0173  response regulator receiver protein  100 
 
 		 121 aa  237  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1988  response regulator receiver protein  70.94 
 
 		 119 aa  169  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1566  response regulator receiver protein  60.98 
 
 		 126 aa  150  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1357  response regulator receiver protein  54.31 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0648  response regulator receiver protein  51.28 
 
 		 151 aa  127  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1807  response regulator receiver protein  50.43 
 
 		 139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0618  response regulator receiver protein  51.3 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1769  response regulator receiver protein  48.76 
 
 		 129 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2042  response regulator receiver protein  45.69 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0314  response regulator receiver protein  50.43 
 
 		 131 aa  115  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0234873  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1352  response regulator receiver protein  47.46 
 
 		 139 aa  114  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00001959  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2331  response regulator receiver protein  45.61 
 
 		 142 aa  113  6.9999999999999995e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000425244  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0407  response regulator receiver protein  49.15 
 
 		 128 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.627834  normal  0.12665 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1350  response regulator receiver protein  46.09 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00189482  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1361  response regulator receiver protein  49.57 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0327  response regulator receiver domain-containing protein  48.7 
 
 		 142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0313  response regulator receiver protein  49.57 
 
 		 143 aa  110  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0254543  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0321  response regulator receiver domain-containing protein  46.96 
 
 		 122 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1358  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.107991  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0018  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000218096  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2739  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 451 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.693002  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2037  response regulator receiver protein  47.66 
 
 		 120 aa  108  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0656  response regulator receiver protein  47.46 
 
 		 129 aa  107  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1360  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  49.55 
 
 		 403 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1088  two component transcriptional regulator  45.13 
 
 		 264 aa  106  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237646 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1362  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1843  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  46.73 
 
 		 465 aa  105  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.798265  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2795  two component transcriptional regulator  48.48 
 
 		 266 aa  105  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0695  response regulator receiver domain-containing protein  47.46 
 
 		 141 aa  105  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.396926  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1991  response regulator receiver protein  46.49 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2272  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.86 
 
 		 382 aa  105  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275022  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0632  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 135 aa  103  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2827  response regulator receiver protein  47.37 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2334  response regulator receiver protein  46.09 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1773  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.28 
 
 		 408 aa  102  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.55 
 
 		 233 aa  101  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0636  response regulator receiver protein  45.69 
 
 		 124 aa  100  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.621219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4779  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.05 
 
 		 494 aa  99.8  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3572  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 457 aa  99.4  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0620  response regulator receiver protein  44.74 
 
 		 142 aa  99  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0657  response regulator receiver protein  46.96 
 
 		 143 aa  97.8  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.771795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1341  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 301 aa  97.8  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0403  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.21 
 
 		 374 aa  97.4  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2335  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 411 aa  97.4  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000388714  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1348  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 173 aa  97.1  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  41.96 
 
 		 224 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  41.96 
 
 		 224 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1772  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 151 aa  96.7  9e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2345  two component signal transduction response regulator  40.17 
 
 		 455 aa  96.7  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00459366  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  43.59 
 
 		 227 aa  95.9  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0710  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 456 aa  96.3  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1351  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 141 aa  96.3  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000171187  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 		 224 aa  95.5  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2269  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 130 aa  95.1  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.740525  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0692  response regulator receiver domain-containing protein  43.48 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000176776  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2510  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  48 
 
 		 472 aa  95.9  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0791346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0150  response regulator receiver protein  48.72 
 
 		 134 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.89872  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1495  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  42.73 
 
 		 458 aa  94.7  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.301103  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2736  two component transcriptional regulator, Fis family  38.94 
 
 		 191 aa  94.7  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.564364  hitchhiker  0.00000000117794 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0324  response regulator receiver domain-containing protein  43.52 
 
 		 127 aa  94.7  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.581793  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0654  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 413 aa  95.1  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0643  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 478 aa  94  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1908  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 473 aa  93.6  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3765  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 463 aa  93.6  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000821276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1993  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.14 
 
 		 486 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1886  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.06 
 
 		 461 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2056  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.1 
 
 		 473 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.732718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.5 
 
 		 223 aa  93.2  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0328  response regulator receiver domain-containing protein  42.37 
 
 		 406 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.918345  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1992  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 460 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  40.18 
 
 		 224 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1971  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.1 
 
 		 473 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0887215  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0628  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.44 
 
 		 446 aa  93.2  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0404  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.134088 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2015  two component hybrid sensor response regulator  43.97 
 
 		 391 aa  92  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1951  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 470 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.516267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0818  two component transcriptional regulator  45.61 
 
 		 267 aa  92  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000529672  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1364  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 485 aa  92.4  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3372  winged helix family two component transcriptional regulator  46.85 
 
 		 233 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.690812  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0257  DNA-binding response regulator  41.03 
 
 		 232 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0117449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.38 
 
 		 225 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.38 
 
 		 225 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.38 
 
 		 225 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2092  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 462 aa  91.7  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5010  DNA-binding response regulator  41.03 
 
 		 232 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4991  DNA-binding response regulator  41.03 
 
 		 232 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4963  DNA-binding response regulator  41.03 
 
 		 232 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4745  DNA-binding response regulator  41.03 
 
 		 232 aa  91.7  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4583  DNA-binding response regulator  41.03 
 
 		 232 aa  91.7  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.510578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4605  DNA-binding response regulator  41.03 
 
 		 232 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000523811  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3349  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.3 
 
 		 223 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1994  two component signal transduction response regulator  40.57 
 
 		 477 aa  91.3  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.33 
 
 		 229 aa  91.3  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5106  DNA-binding response regulator  41.03 
 
 		 232 aa  91.7  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0916  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 480 aa  91.3  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.3 
 
 		 223 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0215  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.92 
 
 		 528 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0571306 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3744  putative GAF sensor protein  38.79 
 
 		 323 aa  90.9  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4549  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.83 
 
 		 221 aa  90.9  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.703481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  38.98 
 
 		 239 aa  90.9  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>