More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1988 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1988  response regulator receiver protein  100 
 
 		 119 aa  236  8e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0173  response regulator receiver protein  70.94 
 
 		 121 aa  169  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1566  response regulator receiver protein  60.8 
 
 		 126 aa  148  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0648  response regulator receiver protein  49.57 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1807  response regulator receiver protein  51.72 
 
 		 139 aa  124  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2331  response regulator receiver protein  50.88 
 
 		 142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000425244  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1357  response regulator receiver protein  50.86 
 
 		 144 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1350  response regulator receiver protein  50.45 
 
 		 147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00189482  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0314  response regulator receiver protein  48.31 
 
 		 131 aa  113  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0234873  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0618  response regulator receiver protein  45.22 
 
 		 157 aa  112  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0018  response regulator receiver protein  47.46 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000218096  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0632  response regulator receiver protein  47.37 
 
 		 135 aa  111  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0321  response regulator receiver domain-containing protein  45.38 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1769  response regulator receiver protein  49.58 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0407  response regulator receiver protein  49.57 
 
 		 128 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.627834  normal  0.12665 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0313  response regulator receiver protein  46.96 
 
 		 143 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0254543  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1352  response regulator receiver protein  46.55 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00001959  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1361  response regulator receiver protein  50 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2334  response regulator receiver protein  45.69 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2272  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.72 
 
 		 382 aa  105  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275022  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0327  response regulator receiver domain-containing protein  47.37 
 
 		 142 aa  105  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0636  response regulator receiver protein  47.46 
 
 		 124 aa  104  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.621219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2739  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 451 aa  104  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.693002  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1843  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  47.17 
 
 		 465 aa  103  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.798265  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0657  response regulator receiver protein  49.57 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.771795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1360  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.85 
 
 		 403 aa  101  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1358  response regulator receiver protein  40 
 
 		 144 aa  100  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.107991  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1348  response regulator receiver protein  47.86 
 
 		 173 aa  100  7e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2037  response regulator receiver protein  42.99 
 
 		 120 aa  100  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1991  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 153 aa  100  9e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0656  response regulator receiver protein  45.3 
 
 		 129 aa  99.4  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1017  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.74 
 
 		 445 aa  99  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.246569  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1341  response regulator receiver protein  45.3 
 
 		 301 aa  98.2  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0695  response regulator receiver domain-containing protein  44.92 
 
 		 141 aa  98.6  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.396926  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0816  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 157 aa  98.6  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2335  response regulator receiver protein  44.74 
 
 		 411 aa  97.8  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000388714  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2042  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 147 aa  98.2  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  40.18 
 
 		 224 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  40.18 
 
 		 224 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3079  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 480 aa  96.7  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00177638  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 224 aa  95.5  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0620  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 142 aa  95.1  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1986  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.68 
 
 		 457 aa  94.4  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.546437 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1088  two component transcriptional regulator  39.5 
 
 		 264 aa  94  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237646 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4779  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.52 
 
 		 494 aa  94  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0097  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.61 
 
 		 448 aa  94  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0781  hypothetical protein  35.9 
 
 		 223 aa  93.6  8e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2924  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 470 aa  93.6  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.777319  hitchhiker  0.0000000000564278 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0598  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  37.93 
 
 		 470 aa  93.2  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0752  hypothetical protein  35.9 
 
 		 223 aa  92.8  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2827  response regulator receiver protein  43.52 
 
 		 137 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1797  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.47 
 
 		 461 aa  93.2  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.774224  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2239  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.68 
 
 		 457 aa  92.8  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3647  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 471 aa  93.2  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0209004  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2786  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.17 
 
 		 480 aa  92.8  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.543097  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1694  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.89 
 
 		 472 aa  92.8  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  37.82 
 
 		 235 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1773  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.25 
 
 		 408 aa  92  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5047  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 387 aa  92  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1351  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000171187  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0200  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.46 
 
 		 449 aa  92  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1362  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 159 aa  92  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  39.5 
 
 		 227 aa  92.4  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0150  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.89872  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0963  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  37.61 
 
 		 467 aa  91.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3961  heavy metal response regulator  42.86 
 
 		 229 aa  91.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00889091  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3572  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 457 aa  91.3  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5178  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.83 
 
 		 225 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.341313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2795  two component transcriptional regulator  41 
 
 		 266 aa  91.3  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0109  two component Fis family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 466 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0328  response regulator receiver domain-containing protein  44.86 
 
 		 406 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.918345  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3349  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.02 
 
 		 223 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2034  response regulator receiver protein  42.61 
 
 		 300 aa  91.3  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.02 
 
 		 223 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3404  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 455 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.235439  normal  0.675632 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1658  response regulator/GGDEF domain-containing protein  42.06 
 
 		 458 aa  90.5  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.939598  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0684  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.39 
 
 		 469 aa  90.5  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150794 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 224 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3268  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 483 aa  90.5  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  40.68 
 
 		 247 aa  90.5  8e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2366  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 385 aa  90.1  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000342445  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4159  nitrogen regulation protein NR(I)  37.07 
 
 		 470 aa  90.1  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.086406  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 237 aa  89.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.03 
 
 		 233 aa  90.1  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0769  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.29 
 
 		 453 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.165448  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5978  regulatory protein CzcR  36.97 
 
 		 225 aa  90.1  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000269255  normal  0.0723212 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1760  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  36.97 
 
 		 225 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133831  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31960  putative two-component response regulator  39.32 
 
 		 224 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.029957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3962  nitrogen regulation protein NR(I)  37.07 
 
 		 470 aa  90.1  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 246 aa  90.1  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2714  putative two-component response regulator  39.32 
 
 		 224 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4216  nitrogen regulation protein NR(I)  35.34 
 
 		 469 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.295301  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0776  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  42.31 
 
 		 465 aa  89  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0886  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 207 aa  88.6  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2736  two component transcriptional regulator, Fis family  37.17 
 
 		 191 aa  89.4  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.564364  hitchhiker  0.00000000117794 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0324  response regulator receiver domain-containing protein  40.74 
 
 		 127 aa  89  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.581793  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0113  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.03 
 
 		 459 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.212971  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4287  nitrogen regulation protein NR(I)  35.34 
 
 		 469 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0756679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0654  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 413 aa  89  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113697  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08281  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family protein  39.09 
 
 		 388 aa  89.4  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>