More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0652 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0652  response regulator receiver protein  100 
 
 		 122 aa  236  9e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.429078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2269  response regulator receiver protein  50 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.740525  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0321  response regulator receiver domain-containing protein  50 
 
 		 122 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1769  response regulator receiver protein  46.61 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0654  response regulator receiver protein  44.14 
 
 		 413 aa  97.8  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0407  response regulator receiver protein  44.92 
 
 		 128 aa  97.4  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.627834  normal  0.12665 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2271  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 127 aa  94  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.420434  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0816  response regulator receiver protein  46.49 
 
 		 157 aa  94  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0656  response regulator receiver protein  44.64 
 
 		 129 aa  93.6  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0404  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 151 aa  92  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.134088 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1772  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 151 aa  90.5  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2333  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 117 aa  89.4  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000530573  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0814  response regulator receiver protein  45.05 
 
 		 132 aa  90.1  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0324  response regulator receiver domain-containing protein  41.44 
 
 		 127 aa  88.2  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.581793  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2335  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 411 aa  88.2  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000388714  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0648  response regulator receiver protein  41.96 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2272  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.61 
 
 		 382 aa  86.3  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275022  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0328  response regulator receiver domain-containing protein  40.91 
 
 		 406 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.918345  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2331  response regulator receiver protein  46.32 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000425244  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0173  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4918  two component transcriptional regulator  41.03 
 
 		 234 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.134814 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0495  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 456 aa  85.1  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0632  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 135 aa  85.5  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1807  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 139 aa  84.3  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2037  response regulator receiver protein  38.53 
 
 		 120 aa  84.3  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0781  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 233 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.174075 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2915  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  36.07 
 
 		 457 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5261  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0893  winged helix family two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.83 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1988  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 119 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1991  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.35 
 
 		 513 aa  81.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 235 aa  81.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0640  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 233 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  37.82 
 
 		 406 aa  81.3  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  35.65 
 
 		 236 aa  80.9  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 234 aa  80.5  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13797  two component transcriptional regulatory protein  38.32 
 
 		 286 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.173423 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1991  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1351  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 141 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000171187  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0555  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 457 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0268  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.21 
 
 		 456 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540037 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1724  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.96 
 
 		 243 aa  80.1  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1773  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.48 
 
 		 408 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0283  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.21 
 
 		 456 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.5 
 
 		 326 aa  79.3  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2739  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 451 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.693002  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  35.9 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  36.52 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1350  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00189482  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  38.26 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0811  nitrogen regulation protein NtrX  36.75 
 
 		 456 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.686874  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  38.68 
 
 		 231 aa  78.2  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0511  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  37.61 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  35.9 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.59 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.61 
 
 		 240 aa  78.2  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0618  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.65 
 
 		 273 aa  78.6  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1377  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.26 
 
 		 462 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.244526  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1461  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 445 aa  77.4  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0783973  normal  0.675596 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0766  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 228 aa  77.4  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0291358  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1797  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.83 
 
 		 461 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.774224  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  35.9 
 
 		 239 aa  77  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2205  two component Fis family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 182 aa  76.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  36.52 
 
 		 246 aa  77  0.00000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3285  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.34 
 
 		 450 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0710  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 456 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0485  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  37.61 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.98 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1013  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.17 
 
 		 456 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0616674 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2255  two component transcriptional regulator, Fis family  38.46 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0449716  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2143  phosphate regulon transcriptional regulatory protein Phob  37.61 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0124  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.352403 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2343  two component transcriptional regulator, Fis family  38.46 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.888574  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2058  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  37.61 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.275433  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2345  two component signal transduction response regulator  36.75 
 
 		 455 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00459366  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1607  two component Fis family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.016434  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0314  response regulator receiver protein  38.74 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0234873  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0794  two component transcriptional regulator  43.1 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.665518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1362  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3260  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.5 
 
 		 450 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3061  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  40.34 
 
 		 450 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1081  two component  38.94 
 
 		 441 aa  75.9  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.136641  normal  0.653656 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1357  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2266  two component transcriptional regulator  37.96 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  36.67 
 
 		 326 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  34.23 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0202  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 233 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.382528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  43.7 
 
 		 1651 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  34.23 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  36.52 
 
 		 248 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1042  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 444 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4688  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.74 
 
 		 252 aa  74.7  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1334  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 243 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  35.65 
 
 		 247 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2039  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40 
 
 		 476 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.238588  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>