More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2271 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2271  response regulator receiver protein  100 
 
 		 127 aa  259  6.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.420434  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2335  response regulator receiver protein  49.17 
 
 		 411 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000388714  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1772  response regulator receiver protein  51.26 
 
 		 151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0404  response regulator receiver protein  49.56 
 
 		 151 aa  122  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.134088 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0654  response regulator receiver protein  47.41 
 
 		 413 aa  122  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0816  response regulator receiver protein  49.15 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0328  response regulator receiver domain-containing protein  43.44 
 
 		 406 aa  115  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.918345  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1769  response regulator receiver protein  50 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0656  response regulator receiver protein  48.65 
 
 		 129 aa  115  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0407  response regulator receiver protein  50 
 
 		 128 aa  114  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.627834  normal  0.12665 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2269  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 130 aa  107  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.740525  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0321  response regulator receiver domain-containing protein  44.63 
 
 		 122 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1807  response regulator receiver protein  43.51 
 
 		 139 aa  105  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0324  response regulator receiver domain-containing protein  49.06 
 
 		 127 aa  103  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.581793  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1351  response regulator receiver protein  42.06 
 
 		 141 aa  103  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000171187  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1350  response regulator receiver protein  40.98 
 
 		 147 aa  97.4  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00189482  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0648  response regulator receiver protein  40.8 
 
 		 151 aa  96.7  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1357  response regulator receiver protein  40.8 
 
 		 144 aa  95.1  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2042  response regulator receiver protein  40.94 
 
 		 147 aa  94.4  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0652  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 122 aa  94  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.429078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0403  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.74 
 
 		 374 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0814  response regulator receiver protein  43.09 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1360  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.2 
 
 		 403 aa  91.7  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2827  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 137 aa  90.9  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1566  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 126 aa  90.1  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2037  response regulator receiver protein  38.74 
 
 		 120 aa  90.1  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3404  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 455 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.235439  normal  0.675632 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0632  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 135 aa  89.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0314  response regulator receiver protein  42.61 
 
 		 131 aa  89  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0234873  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1991  response regulator receiver protein  43.8 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1965  two component LuxR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 217 aa  88.2  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 239 aa  87.4  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1352  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 139 aa  87  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00001959  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.14 
 
 		 227 aa  86.3  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  37.19 
 
 		 225 aa  86.7  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2739  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 451 aa  86.7  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.693002  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 233 aa  85.5  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  40.5 
 
 		 226 aa  85.9  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1361  response regulator receiver protein  37.9 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2255  two component transcriptional regulator, Fis family  34.71 
 
 		 185 aa  84.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0449716  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1969  sigma-54 dependent transcriptional regulator/response regulator  39.83 
 
 		 473 aa  84.7  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.440374  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2845  two component transcriptional regulator  38.26 
 
 		 232 aa  85.1  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.868207 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1607  two component Fis family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 185 aa  84.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.016434  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5029  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.87 
 
 		 225 aa  85.1  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2034  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 300 aa  85.1  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2343  two component transcriptional regulator, Fis family  34.71 
 
 		 185 aa  84.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.888574  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2333  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 117 aa  84.7  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000530573  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1341  response regulator receiver protein  36.92 
 
 		 301 aa  84.7  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  41.59 
 
 		 229 aa  84.7  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4549  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 221 aa  84.7  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.703481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4630  two component transcriptional regulator  41.59 
 
 		 235 aa  84.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0961185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2406  response regulator receiver domain-containing protein  38.98 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0173  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 121 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3288  two component transcriptional regulator  38.66 
 
 		 272 aa  84.3  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2331  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 142 aa  84  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000425244  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1480  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.72 
 
 		 219 aa  83.6  8e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1114  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.22 
 
 		 501 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2165  response regulator  41.59 
 
 		 393 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0249002  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1682  response regulator receiver modulated serine phosphatase  41.96 
 
 		 412 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0128  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  39.47 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15610  Response regulator, transciptional regulatory protein  40 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0572115  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0010  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.62 
 
 		 508 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0502065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  37.5 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3577  response regulator receiver protein  41.59 
 
 		 393 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0411  two component transcriptional regulator  35.59 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1055  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 481 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.874499  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1461  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.67 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.616357  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0313  response regulator receiver protein  35.2 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0254543  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1183  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.22 
 
 		 481 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1706  response regulator receiver modulated serine phosphatase  41.96 
 
 		 393 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000168842 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2035  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 129 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1797  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.02 
 
 		 461 aa  82  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.774224  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  33.9 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3849  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  41.59 
 
 		 412 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0402  two component transcriptional regulator  36.52 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.344138  normal  0.0526207 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0463  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.966783  normal  0.711351 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0597  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0367  winged helix family two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0127671 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0976  anti-sigma-factor antagonist  38.39 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0206  response regulator receiver protein  36.28 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.164513  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2392  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.29 
 
 		 458 aa  82  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0321511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  34.17 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0136  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  38.6 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0361  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324623  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09580  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  38.6 
 
 		 244 aa  81.3  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1485  response regulator receiver  35.2 
 
 		 235 aa  81.3  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.236897  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0097  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.59 
 
 		 448 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0620  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  36.07 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1491  two component transcriptional regulator  38.4 
 
 		 236 aa  81.6  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00391258 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  33.61 
 
 		 236 aa  80.9  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  35.4 
 
 		 233 aa  81.3  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  35.4 
 
 		 233 aa  81.3  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  35.4 
 
 		 233 aa  81.3  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0007  two component Fis family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4159  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 		 230 aa  81.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.667277  normal  0.0359145 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1708  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.05 
 
 		 228 aa  80.9  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.476364 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  35.9 
 
 		 227 aa  80.9  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>