More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2333 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2333  response regulator receiver protein  100 
 
 		 117 aa  236  5.999999999999999e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000530573  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0321  response regulator receiver domain-containing protein  43.59 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0648  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 151 aa  90.1  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0652  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 122 aa  89.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.429078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0656  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2334  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 151 aa  86.7  9e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0618  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 157 aa  86.7  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1769  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0407  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.627834  normal  0.12665 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1357  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 144 aa  85.1  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2271  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 127 aa  84.7  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.420434  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0816  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0314  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0234873  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1772  response regulator receiver protein  40 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0404  response regulator receiver protein  40 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.134088 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1358  response regulator receiver protein  39.82 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.107991  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0654  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 413 aa  80.5  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113697  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03275  two-component system, transcriptional regulatory protein  33.33 
 
 		 234 aa  80.1  0.000000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1988  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 119 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0324  response regulator receiver domain-containing protein  39.81 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.581793  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1807  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4779  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.13 
 
 		 494 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2269  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.740525  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0173  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2335  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 411 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000388714  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1991  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1360  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 		 403 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0620  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1350  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00189482  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2037  response regulator receiver protein  37.38 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0313  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0254543  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0018  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000218096  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2331  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000425244  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1351  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000171187  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2042  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2827  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0636  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.621219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2035  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0632  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.05 
 
 		 225 aa  71.2  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0695  response regulator receiver domain-containing protein  36.13 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.396926  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0328  response regulator receiver domain-containing protein  34.58 
 
 		 406 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.918345  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3392  response regulator transcription regulator protein  35.59 
 
 		 224 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4085  two component transcriptional regulator  34.75 
 
 		 225 aa  70.5  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0879  two component Fis family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 488 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000467826  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0403  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 374 aa  70.1  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4040  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.4 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0717  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 466 aa  69.3  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1566  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0146  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2273  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.103597  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3281  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.75 
 
 		 226 aa  67.8  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 231 aa  67.8  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3603  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.75 
 
 		 226 aa  67.8  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1773  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 		 408 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2272  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 		 382 aa  67.8  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275022  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 204 aa  67.8  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4637  DNA-binding response regulator  31.97 
 
 		 222 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4521  two component transcriptional regulator  31.62 
 
 		 230 aa  67.4  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1352  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 139 aa  67  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00001959  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1251  two component transcriptional regulator, AraC family  37.29 
 
 		 566 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  31.36 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3049  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.34 
 
 		 445 aa  66.2  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3651  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 445 aa  66.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2034  response regulator receiver protein  32.46 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0901  winged helix family two component transcriptional regulator  36.07 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  36.13 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  36.13 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1341  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.05 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000154116  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0969  two component transcriptional regulator  36.07 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0722332 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4486  two component transcriptional regulator  36.07 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643247  normal  0.864162 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3111  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 458 aa  66.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0940  two component transcriptional regulator  36.07 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4374  DNA-binding response regulator ColR  35.25 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4070  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  35.25 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0290724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2296  response regulator receiver domain-containing protein  35.59 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621544 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0258  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 451 aa  65.1  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.667822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  35.9 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  36.13 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  36.13 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  36.13 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  36.13 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0010  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 		 508 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0502065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  36.13 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.48 
 
 		 233 aa  64.7  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2737  response regulator receiver domain-containing protein  31.3 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00154696  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1480  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.05 
 
 		 219 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0965  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.34 
 
 		 462 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1226  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.48 
 
 		 445 aa  64.3  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  29.66 
 
 		 231 aa  64.7  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1085  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.65 
 
 		 445 aa  64.3  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  35.29 
 
 		 223 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  35.29 
 
 		 223 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1708  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40 
 
 		 463 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2239  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40 
 
 		 466 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3201  response regulator receiver domain-containing protein  33.05 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1347  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 688 aa  63.9  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2403  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 467 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.32958 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1635  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40 
 
 		 463 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0346405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>