More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3481 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3481  sporulation transcriptional activator Spo0A  100 
 
 		 272 aa  559  1e-158  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0151287  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1086  response regulator receiver protein  64.07 
 
 		 256 aa  354  6.999999999999999e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2041  sporulation transcriptional activator Spo0A  62.96 
 
 		 258 aa  354  6.999999999999999e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1505  response regulator receiver protein  65.92 
 
 		 256 aa  354  7.999999999999999e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1615  response regulator receiver protein  62.45 
 
 		 256 aa  348  7e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1392  sporulation transcriptional activator Spo0A  58.89 
 
 		 257 aa  333  2e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.664762  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3021  sporulation transcriptional activator Spo0A  55.19 
 
 		 264 aa  321  9.000000000000001e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000341276  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0590  response regulator receiver protein  56.55 
 
 		 268 aa  318  3.9999999999999996e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1781  Spo0A protein  55.88 
 
 		 276 aa  312  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4023  sporulation transcriptional activator Spo0A  54.14 
 
 		 288 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0869765  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2865  response regulator receiver protein  54.44 
 
 		 264 aa  310  1e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2314  sporulation transcriptional activator Spo0A  56.39 
 
 		 259 aa  310  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.453721  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1894  sporulation transcriptional activator Spo0A  54.51 
 
 		 281 aa  310  1e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258911  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4282  stage 0 sporulation protein A  54.14 
 
 		 276 aa  309  4e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4394  stage 0 sporulation protein A  53.7 
 
 		 264 aa  308  5e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.206267  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0952  stage 0 sporulation protein A  54.14 
 
 		 276 aa  308  5e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.023849  hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4243  stage 0 sporulation protein A  53.76 
 
 		 276 aa  308  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0766925  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4301  stage 0 sporulation protein A  53.76 
 
 		 276 aa  308  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.794835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4192  stage 0 sporulation protein A  53.76 
 
 		 276 aa  308  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17859e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4076  stage 0 sporulation protein A  53.76 
 
 		 276 aa  308  6.999999999999999e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000149935  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3914  stage 0 sporulation protein A  53.76 
 
 		 276 aa  308  6.999999999999999e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000973306  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3925  stage 0 sporulation protein A  53.76 
 
 		 276 aa  308  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.497663  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2067  Spo0A protein  55.88 
 
 		 276 aa  306  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.935155  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0256  sporulation transcriptional activator Spo0A  54.89 
 
 		 259 aa  305  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1546  response regulator receiver protein  55.19 
 
 		 260 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0812  response regulator receiver protein  56.02 
 
 		 269 aa  302  4.0000000000000003e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1767  sporulation transcriptional activator Spo0A  53.53 
 
 		 266 aa  301  1e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.943443  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1689  response regulator receiver protein  53.68 
 
 		 280 aa  292  5e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144029 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06590  response regulator receiver protein  51.09 
 
 		 262 aa  283  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232495  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1337  sporulation transcriptional activator Spo0A  48.88 
 
 		 267 aa  269  4e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.190748  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3087  response regulator receiver protein  49.82 
 
 		 269 aa  265  8e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000156547  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2497  sporulation transcriptional activator Spo0A  47.06 
 
 		 266 aa  256  3e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2425  response regulator receiver protein  34.08 
 
 		 251 aa  147  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000315639  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0109  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  42.98 
 
 		 342 aa  94.4  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0944  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.25 
 
 		 344 aa  91.7  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0246262  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2335  response regulator receiver protein  36.76 
 
 		 411 aa  89.4  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000388714  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.57 
 
 		 235 aa  87.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4067  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.83 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.352272 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1337  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.29 
 
 		 350 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.241681  normal  0.456966 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0654  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 413 aa  83.2  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  35.25 
 
 		 1374 aa  82.4  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3278  two component LuxR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  36.59 
 
 		 231 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  32.1 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  38.66 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3763  two component LuxR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0403461 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2573  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.04 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0970392  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2316  response regulator receiver protein  36.23 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000147543  hitchhiker  0.000888492 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3532  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.64 
 
 		 370 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.998897  normal  0.150916 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  36.59 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.45 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3006  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.6 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248543  hitchhiker  0.000146029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4495  LytTR family two component transcriptional regulator  38.79 
 
 		 245 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  32.1 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0328  response regulator receiver domain-containing protein  37.72 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.918345  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1910  response regulator receiver protein  38.68 
 
 		 226 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.36963 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2180  response regulator receiver  37.29 
 
 		 151 aa  78.6  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.269305  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  39.5 
 
 		 238 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1857  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.53 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 212 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 1003 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0703  two component LuxR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.901141  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  37.82 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2262  two component transcriptional regulator  40.5 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2099  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  39.32 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.97 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4672  response regulator receiver protein  39.81 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223352  normal  0.339353 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2026  Two-component protein Kinase  35.65 
 
 		 595 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0822  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.68 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 365 aa  76.3  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0656  response regulator receiver protein  39.64 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02061  two-component response regulator  37.82 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.540525 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5915  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.52 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00974735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20270  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.5 
 
 		 339 aa  76.3  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4166  chemotaxis-specific methylesterase  44.95 
 
 		 375 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4054  chemotaxis-specific methylesterase  44.95 
 
 		 375 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3871  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00685623  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5387  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.09 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6161  response regulator receiver protein  37.27 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.902987  decreased coverage  0.000109123 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5345  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.33 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.264155 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3228  Two-component protein Kinase  34.78 
 
 		 595 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0170  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.6 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26531  two-component response regulator  45.24 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1403  chemotaxis-specific methylesterase  44.95 
 
 		 381 aa  75.5  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.551695  normal  0.0191361 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1500  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3778  response regulator receiver domain-containing protein  37.29 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2129  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3861  two component AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0972  two component LuxR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299836  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2635  response regulator receiver  30.43 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.3 
 
 		 231 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 		 462 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  37.04 
 
 		 230 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  37.04 
 
 		 230 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>